MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_017066	CTA	2	6	128366	128371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752084
3503	NC_017066	TA	3	6	128466	128471	50 %	50 %	0 %	0 %	383752084
3504	NC_017066	TAA	2	6	128486	128491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752084
3505	NC_017066	AT	3	6	128539	128544	50 %	50 %	0 %	0 %	383752084
3506	NC_017066	AGA	2	6	128571	128576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752084
3507	NC_017066	AAT	2	6	128577	128582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752084
3508	NC_017066	A	6	6	128616	128621	100 %	0 %	0 %	0 %	383752084
3509	NC_017066	TAA	2	6	128633	128638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752084
3510	NC_017066	A	6	6	128658	128663	100 %	0 %	0 %	0 %	383752084
3511	NC_017066	ATT	2	6	128671	128676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752084
3512	NC_017066	AAT	2	6	128681	128686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017066	TA	3	6	128693	128698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_017066	TA	3	6	128700	128705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_017066	ATT	2	6	128709	128714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3519	NC_017066	TA	3	6	128951	128956	50 %	50 %	0 %	0 %	383752085
3520	NC_017066	TGG	2	6	128960	128965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752085
3521	NC_017066	T	6	6	128988	128993	0 %	100 %	0 %	0 %	383752085
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3533	NC_017066	TTGCT	2	10	129444	129453	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3534	NC_017066	T	6	6	129506	129511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3536	NC_017066	ACT	2	6	129568	129573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3539	NC_017066	TAA	2	6	129603	129608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017066	TCT	2	6	129611	129616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_017066	TAT	2	6	129633	129638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017066	GTA	2	6	129653	129658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3548	NC_017066	TA	4	8	129841	129848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_017066	TAT	2	6	129860	129865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3560	NC_017066	AAC	2	6	130249	130254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_017066	ATT	2	6	130271	130276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017066	ATT	2	6	130309	130314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017066	AT	4	8	130316	130323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3578	NC_017066	TAAGC	2	10	130739	130748	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3589	NC_017066	GCAT	2	8	131236	131243	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3590	NC_017066	GTA	2	6	131244	131249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3596	NC_017066	AT	3	6	131466	131471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3611	NC_017066	A	8	8	132181	132188	100 %	0 %	0 %	0 %	383752086
3612	NC_017066	ATT	2	6	132207	132212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752086
3613	NC_017066	AT	3	6	132312	132317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_017066	GTA	2	6	132323	132328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_017066	CAC	2	6	132377	132382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_017066	TA	3	6	132418	132423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_017066	TA	5	10	132431	132440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_017066	T	7	7	132458	132464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_017066	AAT	2	6	132500	132505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_017066	A	6	6	132535	132540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017066	ATA	2	6	132595	132600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_017066	TAT	2	6	132647	132652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_017066	TA	4	8	132655	132662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_017066	TAA	2	6	132692	132697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_017066	TTTTA	2	10	132708	132717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_017066	TAC	2	6	132721	132726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_017066	TAT	2	6	132737	132742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_017066	A	6	6	132835	132840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_017066	AAT	2	6	132909	132914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_017066	TTG	2	6	132932	132937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_017066	CATT	2	8	132959	132966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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