MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1503	NC_017066	ATA	2	6	57088	57093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752031
1504	NC_017066	A	6	6	57115	57120	100 %	0 %	0 %	0 %	383752031
1505	NC_017066	TTA	2	6	57122	57127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752031
1506	NC_017066	AAT	2	6	57143	57148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752031
1507	NC_017066	CAT	2	6	57150	57155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752031
1508	NC_017066	TA	3	6	57168	57173	50 %	50 %	0 %	0 %	383752031
1509	NC_017066	GA	3	6	57213	57218	50 %	0 %	50 %	0 %	383752031
1510	NC_017066	TA	3	6	57238	57243	50 %	50 %	0 %	0 %	383752031
1511	NC_017066	TAA	2	6	57270	57275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752031
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1514	NC_017066	TATTT	2	10	57320	57329	20 %	80 %	0 %	0 %	383752031
1515	NC_017066	ATT	2	6	57366	57371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017066	TAA	2	6	57380	57385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017066	TAAA	2	8	57406	57413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1519	NC_017066	TTA	3	9	57450	57458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017066	ATGA	2	8	57531	57538	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017066	TAAT	2	8	57550	57557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017066	AAT	2	6	57576	57581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752032
1523	NC_017066	A	6	6	57649	57654	100 %	0 %	0 %	0 %	383752032
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1526	NC_017066	A	6	6	57801	57806	100 %	0 %	0 %	0 %	383752032
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1541	NC_017066	TA	3	6	58438	58443	50 %	50 %	0 %	0 %	383752032
1542	NC_017066	A	8	8	58466	58473	100 %	0 %	0 %	0 %	383752032
1543	NC_017066	AT	3	6	58507	58512	50 %	50 %	0 %	0 %	383752032
1544	NC_017066	ACTAAA	2	12	58576	58587	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383752032
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1547	NC_017066	GTA	2	6	58654	58659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752032
1548	NC_017066	ATA	2	6	58822	58827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017066	A	6	6	58904	58909	100 %	0 %	0 %	0 %	383752033
1550	NC_017066	A	6	6	58915	58920	100 %	0 %	0 %	0 %	383752033
1551	NC_017066	CTTA	2	8	58930	58937	25 %	50 %	0 %	25 %	383752033
1552	NC_017066	ATA	2	6	59070	59075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752033
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1557	NC_017066	TA	3	6	59301	59306	50 %	50 %	0 %	0 %	383752033
1558	NC_017066	A	6	6	59348	59353	100 %	0 %	0 %	0 %	383752033
1559	NC_017066	TAA	2	6	59412	59417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752033
1560	NC_017066	ATA	2	6	59444	59449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752033
1561	NC_017066	A	6	6	59485	59490	100 %	0 %	0 %	0 %	383752033
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1608	NC_017066	GCAT	2	8	61096	61103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_017066	AT	3	6	61102	61107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017066	TAAA	2	8	61147	61154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017066	TAT	2	6	61188	61193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017066	TAC	2	6	61265	61270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_017066	AAT	2	6	61302	61307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017066	ATA	2	6	61361	61366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_017066	TAC	2	6	61369	61374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_017066	ATG	2	6	61399	61404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1618	NC_017066	TACT	2	8	61426	61433	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_017066	AT	3	6	61453	61458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017066	TTAG	2	8	61528	61535	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017066	AAT	2	6	61585	61590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017066	TAT	2	6	61656	61661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017066	TA	3	6	61679	61684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017066	A	6	6	61704	61709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017066	ATA	2	6	61775	61780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017066	TCTA	2	8	61829	61836	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1628	NC_017066	CAA	2	6	61902	61907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_017066	AAAT	2	8	61916	61923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017066	TTG	2	6	61954	61959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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