MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017066	ATAG	2	8	18753	18760	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017066	AAT	2	6	18769	18774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017066	T	7	7	18781	18787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017066	TAT	2	6	18905	18910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017066	AGT	2	6	18926	18931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017066	A	6	6	18946	18951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017066	TTAAT	2	10	19001	19010	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017066	ATT	2	6	19023	19028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017066	CTTA	2	8	19036	19043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_017066	TCT	2	6	19186	19191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017066	CAA	2	6	19226	19231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017066	AT	3	6	19235	19240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017066	TAA	2	6	19243	19248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017066	TAA	2	6	19250	19255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017066	AAT	3	9	19299	19307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017066	TTC	2	6	19326	19331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_017066	TTA	2	6	19364	19369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017066	ATA	2	6	19406	19411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017066	AGT	2	6	19432	19437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017066	ATA	2	6	19440	19445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017066	ATA	2	6	19478	19483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017066	TTA	2	6	19558	19563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017066	AGT	2	6	19571	19576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017066	TGT	2	6	19596	19601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017066	T	6	6	19639	19644	0 %	100 %	0 %	0 %	383752004
526	NC_017066	TCA	2	6	19685	19690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752004
527	NC_017066	AT	3	6	19733	19738	50 %	50 %	0 %	0 %	383752004
528	NC_017066	T	7	7	19750	19756	0 %	100 %	0 %	0 %	383752004
529	NC_017066	T	7	7	19779	19785	0 %	100 %	0 %	0 %	383752004
530	NC_017066	TACC	2	8	19823	19830	25 %	25 %	0 %	50 %	383752004
531	NC_017066	CTC	2	6	19848	19853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752004
532	NC_017066	ATG	2	6	19872	19877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752004
533	NC_017066	TAA	2	6	19893	19898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752004
534	NC_017066	TCT	2	6	19904	19909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752004
535	NC_017066	TGC	2	6	19912	19917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752004
536	NC_017066	TAT	2	6	19977	19982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752004
537	NC_017066	GCTA	2	8	20017	20024	25 %	25 %	25 %	25 %	383752004
538	NC_017066	TA	4	8	20110	20117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017066	CTTG	2	8	20191	20198	0 %	50 %	25 %	25 %	383752005
540	NC_017066	ATGC	2	8	20209	20216	25 %	25 %	25 %	25 %	383752005
541	NC_017066	AACA	2	8	20222	20229	75 %	0 %	0 %	25 %	383752005
542	NC_017066	AAC	2	6	20253	20258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752005
543	NC_017066	TAT	2	6	20321	20326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752005
544	NC_017066	CT	4	8	20337	20344	0 %	50 %	0 %	50 %	383752005
545	NC_017066	TGC	2	6	20436	20441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752005
546	NC_017066	CT	3	6	20459	20464	0 %	50 %	0 %	50 %	383752005
547	NC_017066	CTG	2	6	20473	20478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752005
548	NC_017066	TA	3	6	20552	20557	50 %	50 %	0 %	0 %	383752005
549	NC_017066	GA	3	6	20623	20628	50 %	0 %	50 %	0 %	383752005
550	NC_017066	A	6	6	20634	20639	100 %	0 %	0 %	0 %	383752005
551	NC_017066	TATTT	2	10	20675	20684	20 %	80 %	0 %	0 %	383752005
552	NC_017066	AAGC	2	8	20708	20715	50 %	0 %	25 %	25 %	383752005
553	NC_017066	ATC	2	6	20744	20749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752005
554	NC_017066	AAT	2	6	20768	20773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752005
555	NC_017066	TA	3	6	20794	20799	50 %	50 %	0 %	0 %	383752005
556	NC_017066	ATA	2	6	20901	20906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752005
557	NC_017066	TAA	2	6	20911	20916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752005
558	NC_017066	TAG	2	6	20923	20928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752005
559	NC_017066	ATT	2	6	20967	20972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752005
560	NC_017066	TAA	2	6	20978	20983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752005
561	NC_017066	GTC	2	6	21004	21009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752005
562	NC_017066	TAT	2	6	21011	21016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752005
563	NC_017066	T	6	6	21031	21036	0 %	100 %	0 %	0 %	383752005
564	NC_017066	T	6	6	21052	21057	0 %	100 %	0 %	0 %	383752005
565	NC_017066	TAA	2	6	21066	21071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752006
566	NC_017066	TGC	2	6	21078	21083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752006
567	NC_017066	T	8	8	21084	21091	0 %	100 %	0 %	0 %	383752006
568	NC_017066	CTT	2	6	21095	21100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752006
569	NC_017066	TGA	2	6	21162	21167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752006
570	NC_017066	AT	3	6	21198	21203	50 %	50 %	0 %	0 %	383752006
571	NC_017066	CTA	2	6	21217	21222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752006
572	NC_017066	AT	3	6	21342	21347	50 %	50 %	0 %	0 %	383752006
573	NC_017066	TAT	2	6	21380	21385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752006
574	NC_017066	CCT	2	6	21400	21405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752006
575	NC_017066	TA	3	6	21432	21437	50 %	50 %	0 %	0 %	383752006
576	NC_017066	CAA	2	6	21461	21466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752006
577	NC_017066	TAAA	2	8	21542	21549	75 %	25 %	0 %	0 %	383752006
578	NC_017066	TAAT	2	8	21557	21564	50 %	50 %	0 %	0 %	383752006
579	NC_017066	ATT	2	6	21727	21732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752006
580	NC_017066	TAA	2	6	21811	21816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752007
581	NC_017066	CCA	2	6	21833	21838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752007
582	NC_017066	TTG	2	6	21847	21852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752007
583	NC_017066	AAAT	2	8	21859	21866	75 %	25 %	0 %	0 %	383752007
584	NC_017066	CTA	2	6	21915	21920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752007
585	NC_017066	TAT	2	6	21937	21942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752007
586	NC_017066	AC	3	6	21979	21984	50 %	0 %	0 %	50 %	383752007
587	NC_017066	TATC	2	8	21996	22003	25 %	50 %	0 %	25 %	383752007
588	NC_017066	ATA	2	6	22011	22016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752007
589	NC_017066	TA	3	6	22106	22111	50 %	50 %	0 %	0 %	383752007
590	NC_017066	T	7	7	22135	22141	0 %	100 %	0 %	0 %	383752007
591	NC_017066	AT	4	8	22149	22156	50 %	50 %	0 %	0 %	383752007
592	NC_017066	CAT	2	6	22159	22164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752007
593	NC_017066	CAAT	2	8	22165	22172	50 %	25 %	0 %	25 %	383752007
594	NC_017066	TA	3	6	22208	22213	50 %	50 %	0 %	0 %	383752007
595	NC_017066	CAC	2	6	22255	22260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752007
596	NC_017066	A	7	7	22310	22316	100 %	0 %	0 %	0 %	383752007
597	NC_017066	AT	3	6	22360	22365	50 %	50 %	0 %	0 %	383752007
598	NC_017066	ATA	2	6	22422	22427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752007
599	NC_017066	TAA	2	6	22435	22440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752007
600	NC_017066	AAG	2	6	22468	22473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752007
601	NC_017066	TTA	2	6	22494	22499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752007
602	NC_017066	TAT	2	6	22507	22512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752007
603	NC_017066	T	6	6	22527	22532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017066	ATT	2	6	22535	22540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017066	AAT	2	6	22589	22594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017066	AT	3	6	22633	22638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017066	TA	3	6	22662	22667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017066	TCCTC	2	10	22734	22743	0 %	40 %	0 %	60 %	383752008
609	NC_017066	GCA	2	6	22790	22795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752008
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611	NC_017066	T	8	8	22863	22870	0 %	100 %	0 %	0 %	383752008
612	NC_017066	CAT	2	6	22891	22896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752008
613	NC_017066	ATAA	2	8	22987	22994	75 %	25 %	0 %	0 %	383752008
614	NC_017066	AAT	2	6	23017	23022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752008
615	NC_017066	ACC	2	6	23023	23028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752008
616	NC_017066	CAC	2	6	23115	23120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752008
617	NC_017066	ATT	2	6	23126	23131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752008
618	NC_017066	CCA	2	6	23150	23155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752008
619	NC_017066	TCAA	2	8	23177	23184	50 %	25 %	0 %	25 %	383752008
620	NC_017066	CTT	2	6	23208	23213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752008
621	NC_017066	TTA	2	6	23228	23233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752008
622	NC_017066	A	6	6	23250	23255	100 %	0 %	0 %	0 %	383752008
623	NC_017066	GCA	2	6	23288	23293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752008
624	NC_017066	ACT	2	6	23327	23332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752008
625	NC_017066	ATT	2	6	23347	23352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752008
626	NC_017066	TAG	2	6	23355	23360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752008
627	NC_017066	AAACC	2	10	23375	23384	60 %	0 %	0 %	40 %	383752008
628	NC_017066	CAG	2	6	23385	23390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752008
629	NC_017066	T	6	6	23419	23424	0 %	100 %	0 %	0 %	383752008
630	NC_017066	TTC	2	6	23452	23457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752008
631	NC_017066	CAC	2	6	23478	23483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752008
632	NC_017066	TAAA	2	8	23488	23495	75 %	25 %	0 %	0 %	383752008
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634	NC_017066	AAC	2	6	23652	23657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752008
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