MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017066	CTA	2	6	222758	222763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752160
6002	NC_017066	GCT	2	6	222847	222852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752160
6003	NC_017066	TCTTT	2	10	222866	222875	0 %	80 %	0 %	20 %	383752160
6004	NC_017066	AAG	2	6	222881	222886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752160
6005	NC_017066	CTT	2	6	222926	222931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752160
6006	NC_017066	GAT	2	6	222952	222957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752160
6007	NC_017066	CT	3	6	222972	222977	0 %	50 %	0 %	50 %	383752160
6008	NC_017066	TAAAC	2	10	222997	223006	60 %	20 %	0 %	20 %	383752160
6009	NC_017066	CAG	2	6	223010	223015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752160
6010	NC_017066	T	6	6	223018	223023	0 %	100 %	0 %	0 %	383752160
6011	NC_017066	ACC	2	6	223110	223115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752160
6012	NC_017066	GCTT	2	8	223149	223156	0 %	50 %	25 %	25 %	383752160
6013	NC_017066	GGT	2	6	223237	223242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752160
6014	NC_017066	TTA	2	6	223273	223278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752160
6015	NC_017066	T	6	6	223363	223368	0 %	100 %	0 %	0 %	383752160
6016	NC_017066	ACC	2	6	223410	223415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752160
6017	NC_017066	AAT	2	6	223456	223461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752160
6018	NC_017066	AT	3	6	223460	223465	50 %	50 %	0 %	0 %	383752160
6019	NC_017066	CTT	2	6	223472	223477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752160
6020	NC_017066	AC	3	6	223484	223489	50 %	0 %	0 %	50 %	383752160
6021	NC_017066	T	7	7	223563	223569	0 %	100 %	0 %	0 %	383752160
6022	NC_017066	CTT	2	6	223574	223579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752160
6023	NC_017066	CTA	2	6	223607	223612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752160
6024	NC_017066	TAC	2	6	223614	223619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752160
6025	NC_017066	T	6	6	223682	223687	0 %	100 %	0 %	0 %	383752160
6026	NC_017066	ATC	2	6	223695	223700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752160
6027	NC_017066	CAG	2	6	223763	223768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752160
6028	NC_017066	CTG	2	6	223829	223834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752160
6029	NC_017066	CTT	2	6	223835	223840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752160
6030	NC_017066	T	6	6	223890	223895	0 %	100 %	0 %	0 %	383752160
6031	NC_017066	GAT	2	6	223910	223915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752160
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6033	NC_017066	TTG	2	6	223964	223969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752160
6034	NC_017066	TGA	2	6	224058	224063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752160
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6037	NC_017066	TTG	2	6	224150	224155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752160
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6040	NC_017066	T	6	6	224246	224251	0 %	100 %	0 %	0 %	383752160
6041	NC_017066	TAT	3	9	224288	224296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752160
6042	NC_017066	AT	3	6	224412	224417	50 %	50 %	0 %	0 %	383752160
6043	NC_017066	CAA	2	6	224462	224467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752160
6044	NC_017066	ATT	2	6	224491	224496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752160
6045	NC_017066	TC	3	6	224508	224513	0 %	50 %	0 %	50 %	383752160
6046	NC_017066	TTCC	2	8	224546	224553	0 %	50 %	0 %	50 %	383752160
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6048	NC_017066	TAT	2	6	224634	224639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_017066	TC	3	6	224681	224686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_017066	AT	3	6	224716	224721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_017066	GTT	2	6	224731	224736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_017066	ATA	2	6	224782	224787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_017066	CAA	2	6	224831	224836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_017066	ATT	2	6	224846	224851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_017066	TAT	2	6	224853	224858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_017066	TGC	2	6	224878	224883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_017066	A	6	6	224912	224917	100 %	0 %	0 %	0 %	383752161
6058	NC_017066	TATT	2	8	224940	224947	25 %	75 %	0 %	0 %	383752161
6059	NC_017066	TGA	2	6	224961	224966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752161
6060	NC_017066	ATA	2	6	224967	224972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752161
6061	NC_017066	TCT	2	6	224984	224989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752161
6062	NC_017066	A	6	6	225020	225025	100 %	0 %	0 %	0 %	383752161
6063	NC_017066	ATG	2	6	225066	225071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752161
6064	NC_017066	AGT	2	6	225077	225082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752161
6065	NC_017066	TTA	2	6	225099	225104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752161
6066	NC_017066	TA	3	6	225122	225127	50 %	50 %	0 %	0 %	383752161
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6070	NC_017066	AG	3	6	225256	225261	50 %	0 %	50 %	0 %	383752161
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6072	NC_017066	TTAT	2	8	225379	225386	25 %	75 %	0 %	0 %	383752161
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6088	NC_017066	ATG	2	6	225921	225926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752161
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6099	NC_017066	ATGAT	2	10	226272	226281	40 %	40 %	20 %	0 %	383752161
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6101	NC_017066	CAT	2	6	226441	226446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_017066	AGA	2	6	226474	226479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_017066	ATTA	2	8	226481	226488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_017066	AATCTT	2	12	226494	226505	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6105	NC_017066	A	6	6	226515	226520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_017066	ATT	2	6	226530	226535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_017066	ATTT	2	8	226566	226573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_017066	TGAT	2	8	226597	226604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_017066	AG	3	6	226607	226612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_017066	ACAA	2	8	226623	226630	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_017066	A	6	6	226649	226654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_017066	ATGTA	2	10	226709	226718	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_017066	A	7	7	226757	226763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_017066	ATTT	2	8	226784	226791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_017066	TTA	2	6	226862	226867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_017066	ATT	2	6	226904	226909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_017066	TAAT	2	8	226939	226946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_017066	ATA	2	6	226976	226981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_017066	CAT	2	6	227030	227035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_017066	T	6	6	227087	227092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_017066	TAT	2	6	227100	227105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_017066	TTAA	2	8	227122	227129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_017066	TTTA	2	8	227131	227138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_017066	T	7	7	227161	227167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_017066	TAA	2	6	227193	227198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6127	NC_017066	TAA	2	6	227247	227252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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