MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_017066	GCT	2	6	166851	166856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752116
4503	NC_017066	TGG	2	6	166864	166869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752116
4504	NC_017066	AG	3	6	166914	166919	50 %	0 %	50 %	0 %	383752116
4505	NC_017066	TTGT	2	8	167020	167027	0 %	75 %	25 %	0 %	383752116
4506	NC_017066	ATG	2	6	167115	167120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
4507	NC_017066	ACAA	2	8	167124	167131	75 %	0 %	0 %	25 %	383752116
4508	NC_017066	TAT	2	6	167159	167164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
4509	NC_017066	TAT	2	6	167196	167201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
4510	NC_017066	GAT	2	6	167237	167242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
4511	NC_017066	TA	3	6	167275	167280	50 %	50 %	0 %	0 %	383752116
4512	NC_017066	TAC	2	6	167366	167371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752116
4513	NC_017066	TGGT	2	8	167386	167393	0 %	50 %	50 %	0 %	383752116
4514	NC_017066	TTA	2	6	167397	167402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
4515	NC_017066	TAA	2	6	167435	167440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752116
4516	NC_017066	CTAA	2	8	167445	167452	50 %	25 %	0 %	25 %	383752116
4517	NC_017066	A	6	6	167451	167456	100 %	0 %	0 %	0 %	383752116
4518	NC_017066	AT	3	6	167458	167463	50 %	50 %	0 %	0 %	383752116
4519	NC_017066	TTC	2	6	167558	167563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752116
4520	NC_017066	AAC	2	6	167653	167658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752116
4521	NC_017066	AGT	2	6	167702	167707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
4522	NC_017066	ATG	2	6	167748	167753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
4523	NC_017066	CCA	2	6	167769	167774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752116
4524	NC_017066	ATC	2	6	167791	167796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752116
4525	NC_017066	TA	4	8	167810	167817	50 %	50 %	0 %	0 %	383752116
4526	NC_017066	CAG	2	6	167850	167855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752116
4527	NC_017066	AGC	2	6	167860	167865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752116
4528	NC_017066	GGT	2	6	167868	167873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752116
4529	NC_017066	TAT	2	6	167921	167926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
4530	NC_017066	AAGG	2	8	167937	167944	50 %	0 %	50 %	0 %	383752116
4531	NC_017066	TAT	2	6	168068	168073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
4532	NC_017066	GA	3	6	168133	168138	50 %	0 %	50 %	0 %	383752116
4533	NC_017066	CTG	2	6	168175	168180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752116
4534	NC_017066	AT	3	6	168187	168192	50 %	50 %	0 %	0 %	383752116
4535	NC_017066	TTA	2	6	168235	168240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
4536	NC_017066	AGT	2	6	168315	168320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
4537	NC_017066	AGG	2	6	168458	168463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752116
4538	NC_017066	TGC	2	6	168464	168469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752116
4539	NC_017066	TCT	2	6	168489	168494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752116
4540	NC_017066	GTT	2	6	168540	168545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752116
4541	NC_017066	GAA	2	6	168555	168560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752116
4542	NC_017066	ATT	3	9	168590	168598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
4543	NC_017066	TGA	2	6	168602	168607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
4544	NC_017066	TTG	2	6	168658	168663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752116
4545	NC_017066	ATG	2	6	168664	168669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
4546	NC_017066	TATAC	2	10	168714	168723	40 %	40 %	0 %	20 %	383752116
4547	NC_017066	ATT	2	6	168726	168731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
4548	NC_017066	TGA	2	6	168797	168802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
4549	NC_017066	TTA	2	6	168826	168831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
4550	NC_017066	GTG	2	6	168853	168858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752116
4551	NC_017066	TTAC	2	8	168938	168945	25 %	50 %	0 %	25 %	383752116
4552	NC_017066	AGA	2	6	168968	168973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752116
4553	NC_017066	ACT	3	9	169026	169034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752116
4554	NC_017066	TGG	2	6	169046	169051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752116
4555	NC_017066	GTAGA	2	10	169123	169132	40 %	20 %	40 %	0 %	383752116
4556	NC_017066	TAT	3	9	169163	169171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
4557	NC_017066	AT	3	6	169202	169207	50 %	50 %	0 %	0 %	383752116
4558	NC_017066	TGT	2	6	169226	169231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752116
4559	NC_017066	A	6	6	169254	169259	100 %	0 %	0 %	0 %	383752116
4560	NC_017066	ATTG	2	8	169268	169275	25 %	50 %	25 %	0 %	383752116
4561	NC_017066	TAC	2	6	169288	169293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752116
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4563	NC_017066	TGA	2	6	169385	169390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
4564	NC_017066	TTA	2	6	169405	169410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
4565	NC_017066	GGT	2	6	169449	169454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752116
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4568	NC_017066	TGA	2	6	169496	169501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
4569	NC_017066	CTG	2	6	169537	169542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752116
4570	NC_017066	CAT	2	6	169609	169614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752116
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4572	NC_017066	CTG	2	6	169714	169719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752116
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4574	NC_017066	TGA	2	6	169766	169771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
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4577	NC_017066	T	6	6	169959	169964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_017066	GTA	2	6	169973	169978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_017066	ATT	2	6	170072	170077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_017066	AAT	2	6	170106	170111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_017066	TTA	2	6	170134	170139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_017066	ATA	2	6	170144	170149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_017066	TAAAG	2	10	170150	170159	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_017066	TAA	2	6	170177	170182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_017066	TAA	2	6	170185	170190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4587	NC_017066	AGT	3	9	170209	170217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_017066	AGAA	2	8	170258	170265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_017066	TAT	2	6	170299	170304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_017066	AGT	2	6	170331	170336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_017066	TA	3	6	170369	170374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_017066	ATGT	2	8	170376	170383	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_017066	ATA	2	6	170389	170394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_017066	TCTA	2	8	170406	170413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4595	NC_017066	TCT	2	6	170463	170468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_017066	ATC	2	6	170523	170528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_017066	AT	3	6	170540	170545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_017066	ATA	2	6	170547	170552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_017066	TTA	2	6	170578	170583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_017066	AT	3	6	170608	170613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_017066	TACTT	2	10	170643	170652	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4602	NC_017066	ATT	2	6	170705	170710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_017066	ATAA	2	8	170772	170779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_017066	TGAA	2	8	170836	170843	50 %	25 %	25 %	0 %	383752117
4605	NC_017066	ATC	2	6	170846	170851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752117
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4607	NC_017066	TTA	2	6	171010	171015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752117
4608	NC_017066	TAA	2	6	171037	171042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752117
4609	NC_017066	TAG	2	6	171043	171048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752117
4610	NC_017066	GGT	2	6	171096	171101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752117
4611	NC_017066	ACA	2	6	171110	171115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752117
4612	NC_017066	CTA	2	6	171136	171141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752117
4613	NC_017066	AATA	2	8	171164	171171	75 %	25 %	0 %	0 %	383752117
4614	NC_017066	GTG	2	6	171208	171213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752117
4615	NC_017066	CTT	2	6	171223	171228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752117
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4619	NC_017066	ATT	2	6	171326	171331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752117
4620	NC_017066	A	6	6	171339	171344	100 %	0 %	0 %	0 %	383752117
4621	NC_017066	T	6	6	171363	171368	0 %	100 %	0 %	0 %	383752117
4622	NC_017066	AGG	2	6	171569	171574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752117
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