MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 2888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017065	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	383750642
2	NC_017065	TC	3	6	1523	1528	0 %	50 %	0 %	50 %	383750644
3	NC_017065	AT	3	6	1648	1653	50 %	50 %	0 %	0 %	383750644
4	NC_017065	TA	3	6	1766	1771	50 %	50 %	0 %	0 %	383750644
5	NC_017065	GA	3	6	2334	2339	50 %	0 %	50 %	0 %	383750645
6	NC_017065	TA	3	6	2498	2503	50 %	50 %	0 %	0 %	383750645
7	NC_017065	TG	3	6	2614	2619	0 %	50 %	50 %	0 %	383750645
8	NC_017065	AT	3	6	2758	2763	50 %	50 %	0 %	0 %	383750645
9	NC_017065	TC	3	6	3071	3076	0 %	50 %	0 %	50 %	383750646
10	NC_017065	TG	3	6	3439	3444	0 %	50 %	50 %	0 %	383750646
11	NC_017065	GA	3	6	3546	3551	50 %	0 %	50 %	0 %	383750646
12	NC_017065	AT	3	6	4008	4013	50 %	50 %	0 %	0 %	383750646
13	NC_017065	AT	3	6	4318	4323	50 %	50 %	0 %	0 %	383750646
14	NC_017065	AG	3	6	4337	4342	50 %	0 %	50 %	0 %	383750646
15	NC_017065	TA	3	6	4425	4430	50 %	50 %	0 %	0 %	383750646
16	NC_017065	TA	3	6	4677	4682	50 %	50 %	0 %	0 %	383750646
17	NC_017065	AT	3	6	4869	4874	50 %	50 %	0 %	0 %	383750646
18	NC_017065	AT	3	6	5903	5908	50 %	50 %	0 %	0 %	383750646
19	NC_017065	TA	3	6	6249	6254	50 %	50 %	0 %	0 %	383750647
20	NC_017065	AT	3	6	6478	6483	50 %	50 %	0 %	0 %	383750648
21	NC_017065	TA	3	6	8731	8736	50 %	50 %	0 %	0 %	383750651
22	NC_017065	TA	3	6	9162	9167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017065	AT	3	6	9445	9450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017065	GT	3	6	9993	9998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017065	TA	3	6	10094	10099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017065	TA	3	6	11903	11908	50 %	50 %	0 %	0 %	383750654
27	NC_017065	AC	3	6	12617	12622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017065	TA	3	6	12654	12659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017065	TA	3	6	12915	12920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017065	TA	3	6	14492	14497	50 %	50 %	0 %	0 %	383750656
31	NC_017065	AG	3	6	15265	15270	50 %	0 %	50 %	0 %	383750657
32	NC_017065	AT	3	6	15678	15683	50 %	50 %	0 %	0 %	383750658
33	NC_017065	AT	3	6	16092	16097	50 %	50 %	0 %	0 %	383750659
34	NC_017065	TA	3	6	16120	16125	50 %	50 %	0 %	0 %	383750659
35	NC_017065	AT	3	6	17593	17598	50 %	50 %	0 %	0 %	383750660
36	NC_017065	TG	3	6	18132	18137	0 %	50 %	50 %	0 %	383750660
37	NC_017065	TG	3	6	18261	18266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017065	CA	3	6	18407	18412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017065	AT	3	6	19274	19279	50 %	50 %	0 %	0 %	383750662
40	NC_017065	TA	3	6	19904	19909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017065	AT	3	6	20148	20153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017065	TA	4	8	20358	20365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017065	TA	3	6	20430	20435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017065	AG	3	6	23052	23057	50 %	0 %	50 %	0 %	383750665
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47	NC_017065	AT	3	6	23741	23746	50 %	50 %	0 %	0 %	383750665
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50	NC_017065	AT	3	6	24035	24040	50 %	50 %	0 %	0 %	383750665
51	NC_017065	TA	3	6	24770	24775	50 %	50 %	0 %	0 %	383750665
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54	NC_017065	AT	3	6	26013	26018	50 %	50 %	0 %	0 %	383750665
55	NC_017065	TA	3	6	26369	26374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017065	TA	3	6	26618	26623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017065	AT	3	6	27136	27141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017065	AG	3	6	27550	27555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017065	AT	3	6	28510	28515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_017065	AT	3	6	34620	34625	50 %	50 %	0 %	0 %	383750679
71	NC_017065	AT	3	6	35371	35376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75	NC_017065	AT	3	6	38162	38167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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77	NC_017065	AT	3	6	38281	38286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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99	NC_017065	AT	3	6	47367	47372	50 %	50 %	0 %	0 %	383750694
100	NC_017065	TA	4	8	47440	47447	50 %	50 %	0 %	0 %	383750694
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108	NC_017065	AT	3	6	50161	50166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017065	TA	3	6	50179	50184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_017065	AT	3	6	51543	51548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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115	NC_017065	AT	3	6	56113	56118	50 %	50 %	0 %	0 %	383750699
116	NC_017065	AT	3	6	58882	58887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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118	NC_017065	CT	4	8	59521	59528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017065	TA	3	6	59805	59810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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121	NC_017065	AT	3	6	61659	61664	50 %	50 %	0 %	0 %	383750707
122	NC_017065	TA	3	6	61800	61805	50 %	50 %	0 %	0 %	383750707
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124	NC_017065	TA	3	6	62569	62574	50 %	50 %	0 %	0 %	383750707
125	NC_017065	AT	3	6	62832	62837	50 %	50 %	0 %	0 %	383750707
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127	NC_017065	TA	3	6	65244	65249	50 %	50 %	0 %	0 %	383750710
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129	NC_017065	AG	3	6	65824	65829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_017065	TA	3	6	70278	70283	50 %	50 %	0 %	0 %	383750716
139	NC_017065	TA	3	6	70357	70362	50 %	50 %	0 %	0 %	383750716
140	NC_017065	AT	4	8	70461	70468	50 %	50 %	0 %	0 %	383750716
141	NC_017065	AT	3	6	70589	70594	50 %	50 %	0 %	0 %	383750716
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147	NC_017065	TA	3	6	72545	72550	50 %	50 %	0 %	0 %	383750718
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