MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 1165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017065	TTTTA	2	10	2538	2547	20 %	80 %	0 %	0 %	383750645
2	NC_017065	ATTTA	2	10	2891	2900	40 %	60 %	0 %	0 %	383750645
3	NC_017065	GGTCA	2	10	4138	4147	20 %	20 %	40 %	20 %	383750646
4	NC_017065	TAAAT	2	10	4847	4856	60 %	40 %	0 %	0 %	383750646
5	NC_017065	TCAAT	2	10	5117	5126	40 %	40 %	0 %	20 %	383750646
6	NC_017065	GTAGT	2	10	5173	5182	20 %	40 %	40 %	0 %	383750646
7	NC_017065	TAATA	2	10	6033	6042	60 %	40 %	0 %	0 %	383750646
8	NC_017065	ACTTT	2	10	6831	6840	20 %	60 %	0 %	20 %	383750649
9	NC_017065	AATAC	2	10	7372	7381	60 %	20 %	0 %	20 %	383750649
10	NC_017065	ATCCA	2	10	7869	7878	40 %	20 %	0 %	40 %	383750650
11	NC_017065	AATTA	2	10	9435	9444	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017065	AGAAT	2	10	11208	11217	60 %	20 %	20 %	0 %	383750653
13	NC_017065	GAATT	2	10	11563	11572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017065	CGCTC	2	10	12987	12996	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_017065	GGCTC	2	10	13524	13533	0 %	20 %	40 %	40 %	383750655
16	NC_017065	AGCAG	2	10	13949	13958	40 %	0 %	40 %	20 %	383750655
17	NC_017065	TTAAT	2	10	14092	14101	40 %	60 %	0 %	0 %	383750655
18	NC_017065	TAACT	2	10	15375	15384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017065	ATTTA	2	10	17029	17038	40 %	60 %	0 %	0 %	383750660
20	NC_017065	TTTTA	2	10	17797	17806	20 %	80 %	0 %	0 %	383750660
21	NC_017065	TTTAA	2	10	20488	20497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017065	TCAAG	2	10	21522	21531	40 %	20 %	20 %	20 %	383750665
23	NC_017065	ATAAA	2	10	21576	21585	80 %	20 %	0 %	0 %	383750665
24	NC_017065	AGAAA	2	10	21838	21847	80 %	0 %	20 %	0 %	383750665
25	NC_017065	AAAGC	2	10	22094	22103	60 %	0 %	20 %	20 %	383750665
26	NC_017065	TAATA	2	10	23041	23050	60 %	40 %	0 %	0 %	383750665
27	NC_017065	CAAAG	2	10	23133	23142	60 %	0 %	20 %	20 %	383750665
28	NC_017065	AGCAG	2	10	23459	23468	40 %	0 %	40 %	20 %	383750665
29	NC_017065	TACCT	2	10	25048	25057	20 %	40 %	0 %	40 %	383750665
30	NC_017065	TATAA	2	10	26537	26546	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017065	ATATT	2	10	28028	28037	40 %	60 %	0 %	0 %	383750666
32	NC_017065	ATATT	2	10	28066	28075	40 %	60 %	0 %	0 %	383750666
33	NC_017065	AAATA	2	10	28516	28525	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017065	ATGTT	2	10	29227	29236	20 %	60 %	20 %	0 %	383750669
35	NC_017065	TTTGT	2	10	30180	30189	0 %	80 %	20 %	0 %	383750671
36	NC_017065	TCATT	2	10	31957	31966	20 %	60 %	0 %	20 %	383750676
37	NC_017065	TGCTA	2	10	32875	32884	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017065	AAATT	2	10	33067	33076	60 %	40 %	0 %	0 %	383750677
39	NC_017065	AAGTG	2	10	35423	35432	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017065	ATTTT	2	10	35435	35444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017065	TTAAT	2	10	37138	37147	40 %	60 %	0 %	0 %	383750682
42	NC_017065	TGAGT	2	10	37165	37174	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017065	TTAGT	2	10	39664	39673	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017065	CTTTT	2	10	41723	41732	0 %	80 %	0 %	20 %	383750688
45	NC_017065	TTATT	2	10	42126	42135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017065	TTTTA	2	10	42230	42239	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017065	TAAGT	2	10	45513	45522	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017065	GAGAG	2	10	46195	46204	40 %	0 %	60 %	0 %	383750693
49	NC_017065	CAAAC	2	10	46247	46256	60 %	0 %	0 %	40 %	383750693
50	NC_017065	ACGTA	2	10	46417	46426	40 %	20 %	20 %	20 %	383750693
51	NC_017065	AGAAA	2	10	47072	47081	80 %	0 %	20 %	0 %	383750694
52	NC_017065	GTTTC	2	10	47512	47521	0 %	60 %	20 %	20 %	383750694
53	NC_017065	ATTTT	2	10	48061	48070	20 %	80 %	0 %	0 %	383750694
54	NC_017065	AAGAG	2	10	49510	49519	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017065	AGTAC	2	10	49928	49937	40 %	20 %	20 %	20 %	383750697
56	NC_017065	TTTAA	2	10	50146	50155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017065	TTTCT	2	10	51218	51227	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017065	CATTA	2	10	52279	52288	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017065	TTGAT	2	10	54188	54197	20 %	60 %	20 %	0 %	383750698
60	NC_017065	TAAAG	2	10	55215	55224	60 %	20 %	20 %	0 %	383750698
61	NC_017065	ATTAT	2	10	55288	55297	40 %	60 %	0 %	0 %	383750698
62	NC_017065	ATTAT	2	10	58912	58921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017065	TCGGT	2	10	60770	60779	0 %	40 %	40 %	20 %	383750706
64	NC_017065	GCTTT	2	10	62358	62367	0 %	60 %	20 %	20 %	383750707
65	NC_017065	TAAAA	2	10	66584	66593	80 %	20 %	0 %	0 %	383750711
66	NC_017065	ACTTT	2	10	69635	69644	20 %	60 %	0 %	20 %	383750716
67	NC_017065	GCTTA	2	10	69824	69833	20 %	40 %	20 %	20 %	383750716
68	NC_017065	CATTT	2	10	70527	70536	20 %	60 %	0 %	20 %	383750716
69	NC_017065	TTAAA	2	10	70552	70561	60 %	40 %	0 %	0 %	383750716
70	NC_017065	TAAAT	2	10	70630	70639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017065	ACATA	2	10	73358	73367	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017065	GATTA	2	10	75001	75010	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017065	TTTCT	2	10	76635	76644	0 %	80 %	0 %	20 %	383750721
74	NC_017065	ATTTA	2	10	77049	77058	40 %	60 %	0 %	0 %	383750722
75	NC_017065	AAAAG	2	10	77825	77834	80 %	0 %	20 %	0 %	383750722
76	NC_017065	GGGTT	2	10	78035	78044	0 %	40 %	60 %	0 %	383750722
77	NC_017065	TTTAT	2	10	78411	78420	20 %	80 %	0 %	0 %	383750722
78	NC_017065	GCTTA	2	10	79720	79729	20 %	40 %	20 %	20 %	383750723
79	NC_017065	ACAAT	2	10	80084	80093	60 %	20 %	0 %	20 %	383750724
80	NC_017065	GTTAT	2	10	80709	80718	20 %	60 %	20 %	0 %	383750725
81	NC_017065	GTAGA	2	10	81015	81024	40 %	20 %	40 %	0 %	383750725
82	NC_017065	CAATG	2	10	83367	83376	40 %	20 %	20 %	20 %	383750727
83	NC_017065	ATAAA	2	10	83830	83839	80 %	20 %	0 %	0 %	383750728
84	NC_017065	ATTAT	2	10	84265	84274	40 %	60 %	0 %	0 %	383750728
85	NC_017065	TAAAT	2	10	84533	84542	60 %	40 %	0 %	0 %	383750728
86	NC_017065	ATACA	2	10	84740	84749	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017065	GAAAA	2	10	85088	85097	80 %	0 %	20 %	0 %	383750729
88	NC_017065	TAAAT	2	10	88548	88557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017065	CGCAT	3	15	92892	92906	20 %	20 %	20 %	40 %	383750737
90	NC_017065	TGAAA	2	10	96122	96131	60 %	20 %	20 %	0 %	383750739
91	NC_017065	TTGAT	2	10	97783	97792	20 %	60 %	20 %	0 %	383750741
92	NC_017065	TATAA	2	10	98416	98425	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017065	TTGTA	2	10	98556	98565	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017065	ATTTA	2	10	99495	99504	40 %	60 %	0 %	0 %	383750743
95	NC_017065	AATTA	2	10	99724	99733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017065	TCAAA	2	10	101012	101021	60 %	20 %	0 %	20 %	383750745
97	NC_017065	TTAAT	2	10	101795	101804	40 %	60 %	0 %	0 %	383750746
98	NC_017065	AAACT	2	10	104368	104377	60 %	20 %	0 %	20 %	383750748
99	NC_017065	TTAGT	2	10	104719	104728	20 %	60 %	20 %	0 %	383750749
100	NC_017065	TACTA	2	10	105835	105844	40 %	40 %	0 %	20 %	383750750
101	NC_017065	CCAAA	2	10	107158	107167	60 %	0 %	0 %	40 %	383750752
102	NC_017065	CGGAT	2	10	107705	107714	20 %	20 %	40 %	20 %	383750753
103	NC_017065	TAATA	2	10	108462	108471	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017065	TTGAT	2	10	109093	109102	20 %	60 %	20 %	0 %	383750754
105	NC_017065	ATTAT	2	10	109274	109283	40 %	60 %	0 %	0 %	383750754
106	NC_017065	AGTTC	2	10	110408	110417	20 %	40 %	20 %	20 %	383750754
107	NC_017065	TTTGA	2	10	112980	112989	20 %	60 %	20 %	0 %	383750754
108	NC_017065	GCAAA	2	10	114825	114834	60 %	0 %	20 %	20 %	383750755
109	NC_017065	TTAGT	2	10	119535	119544	20 %	60 %	20 %	0 %	383750760
110	NC_017065	TTGTC	2	10	120665	120674	0 %	60 %	20 %	20 %	383750760
111	NC_017065	ATAAA	2	10	120752	120761	80 %	20 %	0 %	0 %	383750760
112	NC_017065	AAGTA	2	10	121358	121367	60 %	20 %	20 %	0 %	383750761
113	NC_017065	TAAAA	2	10	123240	123249	80 %	20 %	0 %	0 %	383750764
114	NC_017065	AAAAC	2	10	123936	123945	80 %	0 %	0 %	20 %	383750764
115	NC_017065	TTTAA	2	10	124012	124021	40 %	60 %	0 %	0 %	383750764
116	NC_017065	GTTAC	2	10	125101	125110	20 %	40 %	20 %	20 %	383750766
117	NC_017065	TGAAA	2	10	125462	125471	60 %	20 %	20 %	0 %	383750766
118	NC_017065	GCAAG	2	10	126116	126125	40 %	0 %	40 %	20 %	383750767
119	NC_017065	TTAAA	2	10	128059	128068	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017065	CTTGT	2	10	128549	128558	0 %	60 %	20 %	20 %	383750771
121	NC_017065	ATGAT	2	10	129613	129622	40 %	40 %	20 %	0 %	383750772
122	NC_017065	CTTGT	2	10	129951	129960	0 %	60 %	20 %	20 %	383750773
123	NC_017065	TATTT	2	10	130377	130386	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017065	TCTTT	2	10	131449	131458	0 %	80 %	0 %	20 %	383750775
125	NC_017065	TTGCT	2	10	131689	131698	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017065	AACCT	2	10	132471	132480	40 %	20 %	0 %	40 %	383750776
127	NC_017065	AAATC	2	10	133403	133412	60 %	20 %	0 %	20 %	383750778
128	NC_017065	TTAAC	2	10	134540	134549	40 %	40 %	0 %	20 %	383750779
129	NC_017065	TATAA	2	10	134632	134641	60 %	40 %	0 %	0 %	383750779
130	NC_017065	TTATA	2	10	135006	135015	40 %	60 %	0 %	0 %	383750780
131	NC_017065	TTTTA	2	10	136659	136668	20 %	80 %	0 %	0 %	383750781
132	NC_017065	GCTTT	2	10	138235	138244	0 %	60 %	20 %	20 %	383750782
133	NC_017065	TATGT	2	10	138885	138894	20 %	60 %	20 %	0 %	383750782
134	NC_017065	GTTTT	2	10	141417	141426	0 %	80 %	20 %	0 %	383750783
135	NC_017065	CTTGG	2	10	142234	142243	0 %	40 %	40 %	20 %	383750783
136	NC_017065	ACAAG	2	10	145948	145957	60 %	0 %	20 %	20 %	383750784
137	NC_017065	AGTTT	2	10	146286	146295	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017065	TTAGT	2	10	146809	146818	20 %	60 %	20 %	0 %	383750785
139	NC_017065	ATATA	2	10	147715	147724	60 %	40 %	0 %	0 %	383750785
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263	NC_017065	TAAAA	2	10	293828	293837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017065	TCAAA	2	10	294653	294662	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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