MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 32591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017065	AAAT	2	8	116969	116976	75 %	25 %	0 %	0 %	383750757
3002	NC_017065	TGC	2	6	116982	116987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750757
3003	NC_017065	A	6	6	117008	117013	100 %	0 %	0 %	0 %	383750757
3004	NC_017065	ATG	2	6	117025	117030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750757
3005	NC_017065	A	6	6	117037	117042	100 %	0 %	0 %	0 %	383750757
3006	NC_017065	GAA	2	6	117070	117075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750757
3007	NC_017065	TTC	2	6	117086	117091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750757
3008	NC_017065	GCT	3	9	117106	117114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750757
3009	NC_017065	AAAG	2	8	117117	117124	75 %	0 %	25 %	0 %	383750757
3010	NC_017065	TTG	2	6	117212	117217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750757
3011	NC_017065	GAA	3	9	117328	117336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750757
3012	NC_017065	CGT	2	6	117379	117384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750757
3013	NC_017065	AT	3	6	117389	117394	50 %	50 %	0 %	0 %	383750757
3014	NC_017065	TAG	2	6	117470	117475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750757
3015	NC_017065	GAT	2	6	117568	117573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750757
3016	NC_017065	GA	3	6	117604	117609	50 %	0 %	50 %	0 %	383750757
3017	NC_017065	T	6	6	117616	117621	0 %	100 %	0 %	0 %	383750757
3018	NC_017065	AGA	2	6	117633	117638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750757
3019	NC_017065	ATA	2	6	117650	117655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750757
3020	NC_017065	TTC	2	6	117691	117696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750757
3021	NC_017065	TTA	2	6	117809	117814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750757
3022	NC_017065	GAA	2	6	117844	117849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750757
3023	NC_017065	A	7	7	117848	117854	100 %	0 %	0 %	0 %	383750757
3024	NC_017065	GTT	2	6	117956	117961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017065	AAT	2	6	118103	118108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017065	A	6	6	118142	118147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017065	ACTC	2	8	118157	118164	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_017065	CAAA	2	8	118179	118186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_017065	TC	3	6	118232	118237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_017065	TAA	2	6	118259	118264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017065	T	6	6	118276	118281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017065	TAA	2	6	118288	118293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017065	TTA	3	9	118337	118345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017065	TGC	2	6	118389	118394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750758
3035	NC_017065	TGC	2	6	118404	118409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750758
3036	NC_017065	ATG	2	6	118448	118453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750758
3037	NC_017065	TTA	2	6	118469	118474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750758
3038	NC_017065	TA	3	6	118621	118626	50 %	50 %	0 %	0 %	383750758
3039	NC_017065	TAC	2	6	118719	118724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750758
3040	NC_017065	A	7	7	118761	118767	100 %	0 %	0 %	0 %	383750758
3041	NC_017065	GTC	2	6	118840	118845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750758
3042	NC_017065	CTA	2	6	118902	118907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750759
3043	NC_017065	GTT	2	6	118916	118921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750759
3044	NC_017065	TAC	2	6	119059	119064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750759
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3046	NC_017065	T	9	9	119146	119154	0 %	100 %	0 %	0 %	383750759
3047	NC_017065	AGT	2	6	119282	119287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750759
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3049	NC_017065	TAA	2	6	119466	119471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750760
3050	NC_017065	ATT	2	6	119512	119517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750760
3051	NC_017065	TTAGT	2	10	119535	119544	20 %	60 %	20 %	0 %	383750760
3052	NC_017065	GCT	2	6	119576	119581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750760
3053	NC_017065	ATA	2	6	119639	119644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750760
3054	NC_017065	TGC	2	6	119659	119664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750760
3055	NC_017065	CCG	2	6	119699	119704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750760
3056	NC_017065	A	7	7	119727	119733	100 %	0 %	0 %	0 %	383750760
3057	NC_017065	TA	3	6	119761	119766	50 %	50 %	0 %	0 %	383750760
3058	NC_017065	ATC	2	6	119770	119775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750760
3059	NC_017065	TAGCGG	2	12	119805	119816	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383750760
3060	NC_017065	ATA	2	6	119882	119887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750760
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3062	NC_017065	A	6	6	120157	120162	100 %	0 %	0 %	0 %	383750760
3063	NC_017065	TAG	2	6	120217	120222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750760
3064	NC_017065	ATA	2	6	120329	120334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750760
3065	NC_017065	TATC	2	8	120336	120343	25 %	50 %	0 %	25 %	383750760
3066	NC_017065	AAG	2	6	120411	120416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750760
3067	NC_017065	AACG	2	8	120426	120433	50 %	0 %	25 %	25 %	383750760
3068	NC_017065	TAT	2	6	120453	120458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750760
3069	NC_017065	TGCT	2	8	120492	120499	0 %	50 %	25 %	25 %	383750760
3070	NC_017065	TTA	2	6	120632	120637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750760
3071	NC_017065	TTGTC	2	10	120665	120674	0 %	60 %	20 %	20 %	383750760
3072	NC_017065	TCT	2	6	120716	120721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750760
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3074	NC_017065	ATAAA	2	10	120752	120761	80 %	20 %	0 %	0 %	383750760
3075	NC_017065	TAA	2	6	120766	120771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750760
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3078	NC_017065	CAT	2	6	120799	120804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750760
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3081	NC_017065	TA	3	6	121040	121045	50 %	50 %	0 %	0 %	383750761
3082	NC_017065	TAT	2	6	121074	121079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750761
3083	NC_017065	TAG	2	6	121139	121144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750761
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3086	NC_017065	AAGTA	2	10	121358	121367	60 %	20 %	20 %	0 %	383750761
3087	NC_017065	TATT	2	8	121417	121424	25 %	75 %	0 %	0 %	383750761
3088	NC_017065	T	6	6	121426	121431	0 %	100 %	0 %	0 %	383750761
3089	NC_017065	T	6	6	121437	121442	0 %	100 %	0 %	0 %	383750761
3090	NC_017065	ATT	2	6	121456	121461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750761
3091	NC_017065	T	7	7	121460	121466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017065	AAGT	2	8	121516	121523	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017065	TC	3	6	121632	121637	0 %	50 %	0 %	50 %	383750762
3094	NC_017065	TAC	2	6	121725	121730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750762
3095	NC_017065	CTT	2	6	121742	121747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750762
3096	NC_017065	AAT	2	6	121782	121787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750762
3097	NC_017065	T	7	7	121912	121918	0 %	100 %	0 %	0 %	383750762
3098	NC_017065	TA	3	6	121941	121946	50 %	50 %	0 %	0 %	383750762
3099	NC_017065	AGC	2	6	121974	121979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750762
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3101	NC_017065	T	6	6	122128	122133	0 %	100 %	0 %	0 %	383750762
3102	NC_017065	ATC	2	6	122172	122177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750762
3103	NC_017065	ATC	2	6	122199	122204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750762
3104	NC_017065	TTC	2	6	122259	122264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750762
3105	NC_017065	TAA	3	9	122303	122311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750762
3106	NC_017065	AAT	2	6	122454	122459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750762
3107	NC_017065	TA	4	8	122498	122505	50 %	50 %	0 %	0 %	383750762
3108	NC_017065	CCG	2	6	122515	122520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750762
3109	NC_017065	TAT	2	6	122529	122534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750762
3110	NC_017065	TCA	2	6	122536	122541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750762
3111	NC_017065	TAT	2	6	122555	122560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750762
3112	NC_017065	TTGC	2	8	122585	122592	0 %	50 %	25 %	25 %	383750762
3113	NC_017065	CGC	2	6	122655	122660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750762
3114	NC_017065	ATA	2	6	122713	122718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750762
3115	NC_017065	T	6	6	122730	122735	0 %	100 %	0 %	0 %	383750762
3116	NC_017065	T	7	7	122747	122753	0 %	100 %	0 %	0 %	383750762
3117	NC_017065	AAT	2	6	122802	122807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750762
3118	NC_017065	AAAT	2	8	122864	122871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017065	TA	3	6	122899	122904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017065	TTC	3	9	122958	122966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750763
3121	NC_017065	AAT	2	6	122976	122981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750763
3122	NC_017065	TTCT	2	8	122992	122999	0 %	75 %	0 %	25 %	383750763
3123	NC_017065	TAA	2	6	123002	123007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750763
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