MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 32591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_017065	TAAA	2	8	1272512	1272519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32502	NC_017065	TAAT	2	8	1272673	1272680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32503	NC_017065	CCAA	2	8	1272698	1272705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32504	NC_017065	TTA	2	6	1272785	1272790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32505	NC_017065	AT	3	6	1272810	1272815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32506	NC_017065	CAA	2	6	1272886	1272891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383751986
32507	NC_017065	CAA	2	6	1273051	1273056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383751986
32508	NC_017065	TTA	2	6	1273075	1273080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751986
32509	NC_017065	AAAT	2	8	1273087	1273094	75 %	25 %	0 %	0 %	383751986
32510	NC_017065	TGATA	2	10	1273186	1273195	40 %	40 %	20 %	0 %	383751986
32511	NC_017065	AT	3	6	1273199	1273204	50 %	50 %	0 %	0 %	383751986
32512	NC_017065	TAAA	2	8	1273211	1273218	75 %	25 %	0 %	0 %	383751986
32513	NC_017065	GACT	2	8	1273256	1273263	25 %	25 %	25 %	25 %	383751986
32514	NC_017065	ATAG	2	8	1273270	1273277	50 %	25 %	25 %	0 %	383751986
32515	NC_017065	TTA	2	6	1273297	1273302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751987
32516	NC_017065	TTA	2	6	1273388	1273393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751987
32517	NC_017065	AT	3	6	1273407	1273412	50 %	50 %	0 %	0 %	383751987
32518	NC_017065	TAA	2	6	1273425	1273430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751987
32519	NC_017065	CTA	2	6	1273515	1273520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751987
32520	NC_017065	T	7	7	1273570	1273576	0 %	100 %	0 %	0 %	383751987
32521	NC_017065	CTACT	2	10	1273635	1273644	20 %	40 %	0 %	40 %	383751987
32522	NC_017065	TAT	2	6	1273744	1273749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751987
32523	NC_017065	T	6	6	1273749	1273754	0 %	100 %	0 %	0 %	383751987
32524	NC_017065	ATA	2	6	1273776	1273781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751987
32525	NC_017065	TAAT	2	8	1273812	1273819	50 %	50 %	0 %	0 %	383751987
32526	NC_017065	AATATC	2	12	1273879	1273890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383751987
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32529	NC_017065	GTA	2	6	1273928	1273933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751987
32530	NC_017065	AAT	2	6	1273958	1273963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751987
32531	NC_017065	ATT	2	6	1273964	1273969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751987
32532	NC_017065	T	7	7	1273984	1273990	0 %	100 %	0 %	0 %	383751987
32533	NC_017065	CTT	2	6	1274004	1274009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751987
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32536	NC_017065	AGA	2	6	1274122	1274127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751987
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32538	NC_017065	T	6	6	1274151	1274156	0 %	100 %	0 %	0 %	383751987
32539	NC_017065	T	6	6	1274161	1274166	0 %	100 %	0 %	0 %	383751987
32540	NC_017065	CT	3	6	1274167	1274172	0 %	50 %	0 %	50 %	383751987
32541	NC_017065	ATT	2	6	1274183	1274188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751987
32542	NC_017065	ATA	2	6	1274195	1274200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751987
32543	NC_017065	ATTA	2	8	1274221	1274228	50 %	50 %	0 %	0 %	383751987
32544	NC_017065	ATAGA	2	10	1274239	1274248	60 %	20 %	20 %	0 %	383751987
32545	NC_017065	T	6	6	1274279	1274284	0 %	100 %	0 %	0 %	383751987
32546	NC_017065	TTCTT	2	10	1274316	1274325	0 %	80 %	0 %	20 %	383751987
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32551	NC_017065	TAA	2	6	1274474	1274479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751988
32552	NC_017065	CACTC	2	10	1274518	1274527	20 %	20 %	0 %	60 %	383751988
32553	NC_017065	T	6	6	1274533	1274538	0 %	100 %	0 %	0 %	383751988
32554	NC_017065	CTT	2	6	1274581	1274586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751988
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32587	NC_017065	TATT	2	8	1275594	1275601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32588	NC_017065	TAA	2	6	1275632	1275637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32589	NC_017065	ATA	2	6	1275676	1275681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32591	NC_017065	A	6	6	1275689	1275694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.