MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 32591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017065	ATG	2	6	238840	238845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_017065	ATT	2	6	238846	238851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_017065	TAT	2	6	238910	238915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750872
6004	NC_017065	CTG	2	6	238934	238939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750872
6005	NC_017065	CT	3	6	238953	238958	0 %	50 %	0 %	50 %	383750872
6006	NC_017065	CTT	2	6	238991	238996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750872
6007	NC_017065	TA	3	6	239022	239027	50 %	50 %	0 %	0 %	383750872
6008	NC_017065	TTC	2	6	239052	239057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750872
6009	NC_017065	AAAT	2	8	239066	239073	75 %	25 %	0 %	0 %	383750872
6010	NC_017065	TAT	2	6	239084	239089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750872
6011	NC_017065	T	7	7	239091	239097	0 %	100 %	0 %	0 %	383750872
6012	NC_017065	T	8	8	239115	239122	0 %	100 %	0 %	0 %	383750872
6013	NC_017065	TAA	2	6	239147	239152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750872
6014	NC_017065	TTGT	2	8	239233	239240	0 %	75 %	25 %	0 %	383750872
6015	NC_017065	AGT	2	6	239277	239282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750872
6016	NC_017065	TAA	2	6	239328	239333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750872
6017	NC_017065	ATC	2	6	239370	239375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750872
6018	NC_017065	GTA	2	6	239416	239421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750872
6019	NC_017065	ACAT	2	8	239431	239438	50 %	25 %	0 %	25 %	383750872
6020	NC_017065	ATT	2	6	239439	239444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750872
6021	NC_017065	GCC	2	6	239449	239454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750872
6022	NC_017065	GCT	2	6	239562	239567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750872
6023	NC_017065	AAT	2	6	239586	239591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750872
6024	NC_017065	T	6	6	239641	239646	0 %	100 %	0 %	0 %	383750872
6025	NC_017065	ATT	2	6	239742	239747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750872
6026	NC_017065	TA	3	6	239754	239759	50 %	50 %	0 %	0 %	383750872
6027	NC_017065	GTA	2	6	239761	239766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750872
6028	NC_017065	AAGC	3	12	239855	239866	50 %	0 %	25 %	25 %	383750872
6029	NC_017065	AGCT	2	8	239874	239881	25 %	25 %	25 %	25 %	383750872
6030	NC_017065	CAAT	2	8	239896	239903	50 %	25 %	0 %	25 %	383750872
6031	NC_017065	T	7	7	240017	240023	0 %	100 %	0 %	0 %	383750872
6032	NC_017065	GTACGA	2	12	240049	240060	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383750872
6033	NC_017065	CTT	2	6	240095	240100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750872
6034	NC_017065	TTC	2	6	240150	240155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750872
6035	NC_017065	ATT	2	6	240174	240179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750872
6036	NC_017065	GTTT	2	8	240233	240240	0 %	75 %	25 %	0 %	383750872
6037	NC_017065	TAA	2	6	240242	240247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750872
6038	NC_017065	CTA	2	6	240323	240328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750872
6039	NC_017065	TGG	2	6	240371	240376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383750872
6040	NC_017065	CTA	2	6	240457	240462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750872
6041	NC_017065	GCA	2	6	240475	240480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750872
6042	NC_017065	ATT	2	6	240501	240506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750872
6043	NC_017065	CCG	2	6	240526	240531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750872
6044	NC_017065	AGC	2	6	240540	240545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750872
6045	NC_017065	AGC	2	6	240594	240599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750872
6046	NC_017065	TGC	2	6	240629	240634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750872
6047	NC_017065	TTGCT	2	10	240657	240666	0 %	60 %	20 %	20 %	383750872
6048	NC_017065	TCA	2	6	240808	240813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750872
6049	NC_017065	CTA	2	6	240866	240871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750872
6050	NC_017065	TTAG	2	8	240874	240881	25 %	50 %	25 %	0 %	383750872
6051	NC_017065	CAC	2	6	240983	240988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383750872
6052	NC_017065	TGTA	2	8	241023	241030	25 %	50 %	25 %	0 %	383750872
6053	NC_017065	CTTCTA	2	12	241046	241057	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383750872
6054	NC_017065	T	7	7	241076	241082	0 %	100 %	0 %	0 %	383750872
6055	NC_017065	AGA	2	6	241089	241094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750872
6056	NC_017065	TTA	2	6	241117	241122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750872
6057	NC_017065	TA	3	6	241121	241126	50 %	50 %	0 %	0 %	383750872
6058	NC_017065	T	6	6	241132	241137	0 %	100 %	0 %	0 %	383750872
6059	NC_017065	TCT	2	6	241267	241272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750872
6060	NC_017065	T	6	6	241321	241326	0 %	100 %	0 %	0 %	383750872
6061	NC_017065	AGA	2	6	241431	241436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750872
6062	NC_017065	ATT	3	9	241440	241448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750872
6063	NC_017065	T	7	7	241458	241464	0 %	100 %	0 %	0 %	383750872
6064	NC_017065	TCA	2	6	241468	241473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750872
6065	NC_017065	ATT	2	6	241480	241485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750872
6066	NC_017065	TAT	3	9	241511	241519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750872
6067	NC_017065	A	6	6	241533	241538	100 %	0 %	0 %	0 %	383750872
6068	NC_017065	TA	3	6	241586	241591	50 %	50 %	0 %	0 %	383750872
6069	NC_017065	CAA	2	6	241598	241603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750872
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6071	NC_017065	T	7	7	241634	241640	0 %	100 %	0 %	0 %	383750872
6072	NC_017065	TCT	2	6	241645	241650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750872
6073	NC_017065	ATT	2	6	241656	241661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_017065	GTT	2	6	241676	241681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_017065	TTC	2	6	241733	241738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_017065	TTA	2	6	241782	241787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_017065	TA	3	6	241815	241820	50 %	50 %	0 %	0 %	383750873
6078	NC_017065	T	6	6	241835	241840	0 %	100 %	0 %	0 %	383750873
6079	NC_017065	TAA	2	6	241860	241865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750873
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6081	NC_017065	ATT	2	6	241917	241922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750873
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6083	NC_017065	T	6	6	241983	241988	0 %	100 %	0 %	0 %	383750873
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6089	NC_017065	AAT	2	6	242490	242495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750873
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6092	NC_017065	TTTA	2	8	242718	242725	25 %	75 %	0 %	0 %	383750873
6093	NC_017065	T	6	6	242742	242747	0 %	100 %	0 %	0 %	383750873
6094	NC_017065	A	6	6	242756	242761	100 %	0 %	0 %	0 %	383750873
6095	NC_017065	CTT	2	6	242858	242863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750873
6096	NC_017065	TTG	2	6	242880	242885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750873
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6099	NC_017065	TC	3	6	243015	243020	0 %	50 %	0 %	50 %	383750873
6100	NC_017065	TC	3	6	243023	243028	0 %	50 %	0 %	50 %	383750873
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6104	NC_017065	GTT	3	9	243267	243275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750873
6105	NC_017065	TAT	2	6	243287	243292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_017065	CAA	2	6	243353	243358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750874
6107	NC_017065	TGC	2	6	243365	243370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750874
6108	NC_017065	TCC	2	6	243420	243425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383750874
6109	NC_017065	TTTC	2	8	243466	243473	0 %	75 %	0 %	25 %	383750874
6110	NC_017065	TAA	2	6	243538	243543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750874
6111	NC_017065	CTA	2	6	243561	243566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750874
6112	NC_017065	T	7	7	243569	243575	0 %	100 %	0 %	0 %	383750874
6113	NC_017065	TCA	2	6	243627	243632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750874
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6116	NC_017065	CCG	2	6	243705	243710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750874
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6119	NC_017065	ATCTCA	2	12	243810	243821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750874
6120	NC_017065	GCT	2	6	243844	243849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750874
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6122	NC_017065	CAA	2	6	243886	243891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750874
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