MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 32591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017065	ATA	2	6	218442	218447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750844
5502	NC_017065	AAT	2	6	218449	218454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750844
5503	NC_017065	T	6	6	218513	218518	0 %	100 %	0 %	0 %	383750844
5504	NC_017065	GAA	2	6	218531	218536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750844
5505	NC_017065	ATT	2	6	218540	218545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750844
5506	NC_017065	ATT	2	6	218731	218736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750844
5507	NC_017065	TAAAG	2	10	218740	218749	60 %	20 %	20 %	0 %	383750844
5508	NC_017065	AAT	2	6	218835	218840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750844
5509	NC_017065	ATTT	2	8	218876	218883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017065	T	7	7	218881	218887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017065	GAT	2	6	218910	218915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750845
5512	NC_017065	TGT	2	6	218932	218937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750845
5513	NC_017065	ATT	2	6	218977	218982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750845
5514	NC_017065	GTTTCA	2	12	219008	219019	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383750845
5515	NC_017065	TA	3	6	219030	219035	50 %	50 %	0 %	0 %	383750845
5516	NC_017065	ATT	2	6	219037	219042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750845
5517	NC_017065	T	6	6	219041	219046	0 %	100 %	0 %	0 %	383750845
5518	NC_017065	TGC	2	6	219079	219084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750845
5519	NC_017065	ATC	2	6	219091	219096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750845
5520	NC_017065	TTC	2	6	219169	219174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750845
5521	NC_017065	TTTG	2	8	219219	219226	0 %	75 %	25 %	0 %	383750845
5522	NC_017065	TA	3	6	219234	219239	50 %	50 %	0 %	0 %	383750845
5523	NC_017065	ATG	2	6	219243	219248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750845
5524	NC_017065	TTC	2	6	219253	219258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750845
5525	NC_017065	GTT	2	6	219272	219277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750845
5526	NC_017065	T	7	7	219276	219282	0 %	100 %	0 %	0 %	383750845
5527	NC_017065	TTG	2	6	219297	219302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750845
5528	NC_017065	TTA	2	6	219317	219322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750845
5529	NC_017065	TAA	2	6	219330	219335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750845
5530	NC_017065	TA	3	6	219351	219356	50 %	50 %	0 %	0 %	383750845
5531	NC_017065	TAGC	2	8	219369	219376	25 %	25 %	25 %	25 %	383750845
5532	NC_017065	GTT	2	6	219389	219394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750845
5533	NC_017065	TAAA	2	8	219405	219412	75 %	25 %	0 %	0 %	383750845
5534	NC_017065	T	7	7	219413	219419	0 %	100 %	0 %	0 %	383750845
5535	NC_017065	TTA	2	6	219473	219478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750845
5536	NC_017065	CTA	2	6	219504	219509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750845
5537	NC_017065	ATT	2	6	219524	219529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750845
5538	NC_017065	GCC	2	6	219583	219588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750845
5539	NC_017065	ATT	2	6	219599	219604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750845
5540	NC_017065	AGTT	2	8	219628	219635	25 %	50 %	25 %	0 %	383750845
5541	NC_017065	TAG	2	6	219636	219641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750845
5542	NC_017065	AGT	2	6	219645	219650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750845
5543	NC_017065	GTC	2	6	219667	219672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_017065	TAA	2	6	219673	219678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017065	AT	4	8	219682	219689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017065	CTT	2	6	219720	219725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_017065	TTTA	2	8	219733	219740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_017065	CAGT	2	8	219795	219802	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5549	NC_017065	ATC	2	6	219868	219873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_017065	TA	3	6	219898	219903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_017065	T	6	6	219990	219995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_017065	A	6	6	219998	220003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017065	GTCAA	2	10	220005	220014	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5554	NC_017065	TAAA	2	8	220030	220037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_017065	TA	3	6	220062	220067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_017065	ATT	2	6	220124	220129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750846
5557	NC_017065	TAA	2	6	220151	220156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750846
5558	NC_017065	TTAC	2	8	220162	220169	25 %	50 %	0 %	25 %	383750846
5559	NC_017065	AAAAGC	2	12	220184	220195	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383750846
5560	NC_017065	T	6	6	220233	220238	0 %	100 %	0 %	0 %	383750846
5561	NC_017065	AGTA	2	8	220244	220251	50 %	25 %	25 %	0 %	383750846
5562	NC_017065	GTTT	2	8	220252	220259	0 %	75 %	25 %	0 %	383750846
5563	NC_017065	TAG	2	6	220265	220270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750846
5564	NC_017065	TAA	2	6	220291	220296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750846
5565	NC_017065	AT	3	6	220481	220486	50 %	50 %	0 %	0 %	383750846
5566	NC_017065	ATA	2	6	220506	220511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750846
5567	NC_017065	TGG	2	6	220577	220582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383750846
5568	NC_017065	TAG	2	6	220591	220596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750846
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5570	NC_017065	TTC	2	6	220678	220683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750846
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5572	NC_017065	CAG	2	6	220704	220709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750846
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5574	NC_017065	AAGT	2	8	220826	220833	50 %	25 %	25 %	0 %	383750846
5575	NC_017065	AGT	2	6	220868	220873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750846
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5577	NC_017065	GAA	2	6	220923	220928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750846
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5582	NC_017065	T	6	6	221124	221129	0 %	100 %	0 %	0 %	383750847
5583	NC_017065	TAA	2	6	221133	221138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750847
5584	NC_017065	T	6	6	221172	221177	0 %	100 %	0 %	0 %	383750847
5585	NC_017065	AT	3	6	221341	221346	50 %	50 %	0 %	0 %	383750847
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5588	NC_017065	AAT	2	6	221449	221454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750847
5589	NC_017065	GT	3	6	221549	221554	0 %	50 %	50 %	0 %	383750847
5590	NC_017065	AAGGC	2	10	221557	221566	40 %	0 %	40 %	20 %	383750847
5591	NC_017065	TGC	2	6	221593	221598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750848
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5593	NC_017065	TTTTCT	2	12	221662	221673	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383750848
5594	NC_017065	AT	3	6	221675	221680	50 %	50 %	0 %	0 %	383750848
5595	NC_017065	TGC	2	6	221771	221776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750848
5596	NC_017065	CT	3	6	221799	221804	0 %	50 %	0 %	50 %	383750848
5597	NC_017065	TAT	2	6	221828	221833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750848
5598	NC_017065	T	6	6	221835	221840	0 %	100 %	0 %	0 %	383750848
5599	NC_017065	AT	3	6	221858	221863	50 %	50 %	0 %	0 %	383750849
5600	NC_017065	ATC	2	6	221929	221934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750849
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5604	NC_017065	AATA	2	8	222146	222153	75 %	25 %	0 %	0 %	383750849
5605	NC_017065	ATT	2	6	222180	222185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750849
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5608	NC_017065	AAT	3	9	222330	222338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750849
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5612	NC_017065	GGAG	2	8	222437	222444	25 %	0 %	75 %	0 %	383750849
5613	NC_017065	ATG	2	6	222454	222459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750849
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5615	NC_017065	AT	3	6	222514	222519	50 %	50 %	0 %	0 %	383750849
5616	NC_017065	CAG	2	6	222532	222537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750849
5617	NC_017065	GTT	2	6	222563	222568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750849
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5619	NC_017065	TA	3	6	222766	222771	50 %	50 %	0 %	0 %	383750850
5620	NC_017065	AAT	2	6	222784	222789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750850
5621	NC_017065	AAATTA	2	12	222818	222829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750850
5622	NC_017065	AAT	2	6	222830	222835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750850
5623	NC_017065	AGA	2	6	222865	222870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750850
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5625	NC_017065	AGT	2	6	222883	222888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750850
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5749	NC_017065	TAAAT	2	10	228154	228163	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5750	NC_017065	AGTT	2	8	228214	228221	25 %	50 %	25 %	0 %	383750854
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