MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 32591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017065	AT	3	6	198428	198433	50 %	50 %	0 %	0 %	383750825
5003	NC_017065	TAA	2	6	198470	198475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750825
5004	NC_017065	T	7	7	198557	198563	0 %	100 %	0 %	0 %	383750825
5005	NC_017065	GTT	2	6	198621	198626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750825
5006	NC_017065	CAA	2	6	198643	198648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750825
5007	NC_017065	CTT	2	6	198748	198753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750825
5008	NC_017065	TTTC	2	8	198754	198761	0 %	75 %	0 %	25 %	383750825
5009	NC_017065	TTG	2	6	198788	198793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750825
5010	NC_017065	T	6	6	198809	198814	0 %	100 %	0 %	0 %	383750825
5011	NC_017065	ATT	2	6	198842	198847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750825
5012	NC_017065	TTA	2	6	198891	198896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750825
5013	NC_017065	AACC	2	8	198948	198955	50 %	0 %	0 %	50 %	383750825
5014	NC_017065	CTT	2	6	199018	199023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750825
5015	NC_017065	ATC	2	6	199073	199078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750825
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5017	NC_017065	T	6	6	199110	199115	0 %	100 %	0 %	0 %	383750825
5018	NC_017065	T	7	7	199130	199136	0 %	100 %	0 %	0 %	383750825
5019	NC_017065	T	6	6	199147	199152	0 %	100 %	0 %	0 %	383750825
5020	NC_017065	TCA	2	6	199179	199184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750825
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5022	NC_017065	TTGA	2	8	199300	199307	25 %	50 %	25 %	0 %	383750825
5023	NC_017065	A	6	6	199338	199343	100 %	0 %	0 %	0 %	383750825
5024	NC_017065	AGC	2	6	199433	199438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750825
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5034	NC_017065	T	6	6	199815	199820	0 %	100 %	0 %	0 %	383750825
5035	NC_017065	TAGCA	2	10	199865	199874	40 %	20 %	20 %	20 %	383750825
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5041	NC_017065	ATT	2	6	200061	200066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750825
5042	NC_017065	AT	3	6	200121	200126	50 %	50 %	0 %	0 %	383750825
5043	NC_017065	CAG	2	6	200134	200139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750825
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5045	NC_017065	TTG	2	6	200270	200275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750825
5046	NC_017065	GTT	2	6	200333	200338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017065	TCA	2	6	200355	200360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5049	NC_017065	T	7	7	200421	200427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017065	ATT	2	6	200428	200433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017065	T	6	6	200432	200437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017065	AAT	2	6	200469	200474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017065	CA	3	6	200486	200491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5055	NC_017065	A	6	6	200626	200631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5061	NC_017065	AAAG	2	8	201027	201034	75 %	0 %	25 %	0 %	383750826
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5069	NC_017065	T	6	6	201441	201446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5090	NC_017065	TTA	2	6	202301	202306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5093	NC_017065	T	6	6	202376	202381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5095	NC_017065	A	6	6	202427	202432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5097	NC_017065	A	6	6	202449	202454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5110	NC_017065	T	7	7	202973	202979	0 %	100 %	0 %	0 %	383750829
5111	NC_017065	ATTA	2	8	203006	203013	50 %	50 %	0 %	0 %	383750829
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5121	NC_017065	AT	3	6	203358	203363	50 %	50 %	0 %	0 %	383750829
5122	NC_017065	T	6	6	203454	203459	0 %	100 %	0 %	0 %	383750829
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5129	NC_017065	T	8	8	203597	203604	0 %	100 %	0 %	0 %	383750829
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5371	NC_017065	TGT	2	6	213131	213136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5372	NC_017065	T	6	6	213147	213152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_017065	TC	4	8	213162	213169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5374	NC_017065	TAT	2	6	213211	213216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5377	NC_017065	ATA	2	6	213353	213358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5378	NC_017065	T	7	7	213380	213386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5379	NC_017065	ATT	2	6	213435	213440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5380	NC_017065	AGA	2	6	213492	213497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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