MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017062	AGT	2	6	146706	146711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842934
4002	NC_017062	AGA	2	6	146712	146717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842934
4003	NC_017062	GGT	2	6	146725	146730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383842934
4004	NC_017062	AAT	2	6	146749	146754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842934
4005	NC_017062	CA	3	6	146765	146770	50 %	0 %	0 %	50 %	383842934
4006	NC_017062	TTA	2	6	146774	146779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842934
4007	NC_017062	TAC	2	6	146817	146822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_017062	TCT	2	6	146886	146891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_017062	ATA	2	6	146922	146927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017062	CAA	2	6	146942	146947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383842935
4011	NC_017062	AT	3	6	146951	146956	50 %	50 %	0 %	0 %	383842935
4012	NC_017062	GGT	2	6	147034	147039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383842935
4013	NC_017062	T	6	6	147119	147124	0 %	100 %	0 %	0 %	383842935
4014	NC_017062	GCT	2	6	147170	147175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842935
4015	NC_017062	TAA	2	6	147220	147225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842935
4016	NC_017062	ATC	2	6	147295	147300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842935
4017	NC_017062	AGT	2	6	147332	147337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842935
4018	NC_017062	GTA	2	6	147354	147359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842935
4019	NC_017062	TGT	2	6	147418	147423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842935
4020	NC_017062	TCG	2	6	147478	147483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842935
4021	NC_017062	AAG	2	6	147504	147509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842935
4022	NC_017062	AAG	2	6	147534	147539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842935
4023	NC_017062	AAAG	2	8	147569	147576	75 %	0 %	25 %	0 %	383842935
4024	NC_017062	ATA	2	6	147581	147586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842935
4025	NC_017062	GGTGAT	2	12	147623	147634	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383842935
4026	NC_017062	GCA	2	6	147641	147646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842935
4027	NC_017062	AT	3	6	147650	147655	50 %	50 %	0 %	0 %	383842935
4028	NC_017062	TGC	2	6	147658	147663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842935
4029	NC_017062	TA	3	6	147711	147716	50 %	50 %	0 %	0 %	383842935
4030	NC_017062	AAAG	2	8	147727	147734	75 %	0 %	25 %	0 %	383842935
4031	NC_017062	AGT	2	6	147795	147800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842935
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4033	NC_017062	ATT	2	6	147866	147871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842936
4034	NC_017062	AGT	2	6	147901	147906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842936
4035	NC_017062	AAG	2	6	147912	147917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842936
4036	NC_017062	TAG	2	6	147918	147923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842936
4037	NC_017062	AAG	2	6	147927	147932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842936
4038	NC_017062	GAAT	2	8	147934	147941	50 %	25 %	25 %	0 %	383842936
4039	NC_017062	AGC	2	6	147979	147984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842936
4040	NC_017062	CAA	2	6	148041	148046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383842936
4041	NC_017062	AGA	2	6	148159	148164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842936
4042	NC_017062	TAT	2	6	148207	148212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842936
4043	NC_017062	ATA	2	6	148287	148292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842936
4044	NC_017062	CT	3	6	148341	148346	0 %	50 %	0 %	50 %	383842936
4045	NC_017062	ATAG	2	8	148352	148359	50 %	25 %	25 %	0 %	383842936
4046	NC_017062	GAA	2	6	148361	148366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842936
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4048	NC_017062	ATG	2	6	148398	148403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842936
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4050	NC_017062	TAT	2	6	148474	148479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842936
4051	NC_017062	TGC	2	6	148546	148551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842936
4052	NC_017062	TAA	2	6	148555	148560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842936
4053	NC_017062	T	6	6	148623	148628	0 %	100 %	0 %	0 %	383842936
4054	NC_017062	CAC	2	6	148629	148634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383842936
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4057	NC_017062	AGTA	2	8	148717	148724	50 %	25 %	25 %	0 %	383842936
4058	NC_017062	GAA	2	6	148760	148765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842936
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4065	NC_017062	TAA	3	9	149058	149066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842936
4066	NC_017062	ATCT	2	8	149082	149089	25 %	50 %	0 %	25 %	383842936
4067	NC_017062	ATA	2	6	149100	149105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842936
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4071	NC_017062	TGA	2	6	149188	149193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842936
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4080	NC_017062	GCTA	2	8	149589	149596	25 %	25 %	25 %	25 %	383842937
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4092	NC_017062	GAT	2	6	150172	150177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842937
4093	NC_017062	ATAG	3	12	150206	150217	50 %	25 %	25 %	0 %	383842937
4094	NC_017062	TG	3	6	150237	150242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4096	NC_017062	TAT	2	6	150332	150337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017062	TAAAA	2	10	150360	150369	80 %	20 %	0 %	0 %	383842938
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4100	NC_017062	T	6	6	150475	150480	0 %	100 %	0 %	0 %	383842938
4101	NC_017062	TGGTG	2	10	150494	150503	0 %	40 %	60 %	0 %	383842938
4102	NC_017062	ATA	2	6	150524	150529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842938
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4104	NC_017062	TAT	2	6	150555	150560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842938
4105	NC_017062	TAG	2	6	150572	150577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842938
4106	NC_017062	ATTT	2	8	150623	150630	25 %	75 %	0 %	0 %	383842938
4107	NC_017062	GT	3	6	150681	150686	0 %	50 %	50 %	0 %	383842938
4108	NC_017062	GTA	2	6	150688	150693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842938
4109	NC_017062	TAT	2	6	150701	150706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842938
4110	NC_017062	TTA	2	6	150715	150720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842938
4111	NC_017062	TAA	2	6	150831	150836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017062	AAT	2	6	150841	150846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017062	AT	3	6	150890	150895	50 %	50 %	0 %	0 %	383842939
4114	NC_017062	TTC	2	6	150934	150939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842939
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4118	NC_017062	CAA	2	6	151030	151035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383842939
4119	NC_017062	AAT	2	6	151037	151042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842939
4120	NC_017062	ATT	2	6	151052	151057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842939
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4122	NC_017062	ATTA	2	8	151096	151103	50 %	50 %	0 %	0 %	383842939
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4500	NC_017062	GTA	2	6	166512	166517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952

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