MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017062	ATG	2	6	109636	109641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842905
3002	NC_017062	T	6	6	109655	109660	0 %	100 %	0 %	0 %	383842905
3003	NC_017062	TAACA	2	10	109714	109723	60 %	20 %	0 %	20 %	383842905
3004	NC_017062	AAT	2	6	109727	109732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842905
3005	NC_017062	ATT	3	9	109792	109800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017062	TTA	3	9	109820	109828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017062	ATTTT	2	10	109835	109844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017062	AAT	2	6	109849	109854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017062	AAC	2	6	109909	109914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_017062	A	6	6	109936	109941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017062	ATTA	2	8	109946	109953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017062	TTAT	2	8	110005	110012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017062	ATT	2	6	110039	110044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842906
3014	NC_017062	T	6	6	110043	110048	0 %	100 %	0 %	0 %	383842906
3015	NC_017062	GTA	2	6	110090	110095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842906
3016	NC_017062	GGTT	2	8	110108	110115	0 %	50 %	50 %	0 %	383842906
3017	NC_017062	CAA	2	6	110121	110126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383842906
3018	NC_017062	A	6	6	110159	110164	100 %	0 %	0 %	0 %	383842906
3019	NC_017062	AAT	2	6	110200	110205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842906
3020	NC_017062	TA	3	6	110235	110240	50 %	50 %	0 %	0 %	383842906
3021	NC_017062	CTA	2	6	110313	110318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842906
3022	NC_017062	AAT	2	6	110323	110328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842906
3023	NC_017062	TTAT	2	8	110338	110345	25 %	75 %	0 %	0 %	383842906
3024	NC_017062	T	6	6	110368	110373	0 %	100 %	0 %	0 %	383842906
3025	NC_017062	ATA	2	6	110387	110392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842906
3026	NC_017062	TGT	2	6	110398	110403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842906
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3028	NC_017062	TTA	2	6	110439	110444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842906
3029	NC_017062	T	7	7	110542	110548	0 %	100 %	0 %	0 %	383842906
3030	NC_017062	ATT	2	6	110560	110565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842906
3031	NC_017062	AT	3	6	110630	110635	50 %	50 %	0 %	0 %	383842906
3032	NC_017062	AAT	2	6	110659	110664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842906
3033	NC_017062	AG	3	6	110678	110683	50 %	0 %	50 %	0 %	383842906
3034	NC_017062	TTTTA	2	10	110701	110710	20 %	80 %	0 %	0 %	383842906
3035	NC_017062	AATT	2	8	110798	110805	50 %	50 %	0 %	0 %	383842907
3036	NC_017062	TAT	2	6	110872	110877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842907
3037	NC_017062	ATT	2	6	110950	110955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842907
3038	NC_017062	AG	3	6	110971	110976	50 %	0 %	50 %	0 %	383842907
3039	NC_017062	TTAGT	2	10	111005	111014	20 %	60 %	20 %	0 %	383842907
3040	NC_017062	TAC	2	6	111053	111058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842907
3041	NC_017062	CT	3	6	111090	111095	0 %	50 %	0 %	50 %	383842907
3042	NC_017062	TAA	2	6	111117	111122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842907
3043	NC_017062	TCA	2	6	111135	111140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842907
3044	NC_017062	AGA	2	6	111192	111197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842907
3045	NC_017062	CTA	2	6	111212	111217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842907
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3047	NC_017062	T	6	6	111235	111240	0 %	100 %	0 %	0 %	383842907
3048	NC_017062	AT	3	6	111261	111266	50 %	50 %	0 %	0 %	383842907
3049	NC_017062	TAA	2	6	111348	111353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842907
3050	NC_017062	GCA	2	6	111388	111393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842907
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3052	NC_017062	A	7	7	111462	111468	100 %	0 %	0 %	0 %	383842907
3053	NC_017062	TAA	2	6	111485	111490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842907
3054	NC_017062	GATAT	2	10	111500	111509	40 %	40 %	20 %	0 %	383842907
3055	NC_017062	T	6	6	111696	111701	0 %	100 %	0 %	0 %	383842907
3056	NC_017062	TTA	2	6	111718	111723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842907
3057	NC_017062	GCAA	2	8	111725	111732	50 %	0 %	25 %	25 %	383842907
3058	NC_017062	GAAA	2	8	111738	111745	75 %	0 %	25 %	0 %	383842907
3059	NC_017062	ATG	2	6	111752	111757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842907
3060	NC_017062	TAA	2	6	111767	111772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842907
3061	NC_017062	T	6	6	111874	111879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017062	ATTA	2	8	111936	111943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017062	TA	3	6	111950	111955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017062	TGA	2	6	111977	111982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017062	TTC	2	6	112007	112012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_017062	T	7	7	112034	112040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017062	T	7	7	112053	112059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017062	ATT	2	6	112080	112085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017062	AT	3	6	112088	112093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017062	T	6	6	112170	112175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_017062	AAT	2	6	112240	112245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017062	ATT	2	6	112268	112273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017062	TCT	2	6	112427	112432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842908
3074	NC_017062	TAT	2	6	112455	112460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842908
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3077	NC_017062	ATA	2	6	112569	112574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842908
3078	NC_017062	TAC	2	6	112723	112728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842908
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3080	NC_017062	AT	3	6	112767	112772	50 %	50 %	0 %	0 %	383842908
3081	NC_017062	ATCT	2	8	112936	112943	25 %	50 %	0 %	25 %	383842908
3082	NC_017062	TAG	2	6	112956	112961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842908
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3085	NC_017062	T	7	7	113047	113053	0 %	100 %	0 %	0 %	383842908
3086	NC_017062	ACT	2	6	113054	113059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842908
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3088	NC_017062	ATTT	2	8	113106	113113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017062	TATT	2	8	113138	113145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_017062	ATAG	2	8	113163	113170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017062	ATT	2	6	113194	113199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017062	ATT	2	6	113208	113213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017062	T	6	6	113220	113225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017062	ATT	2	6	113242	113247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_017062	ATT	2	6	113264	113269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_017062	GTT	2	6	113358	113363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842909
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3098	NC_017062	CAT	2	6	113410	113415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842909
3099	NC_017062	ATTT	2	8	113425	113432	25 %	75 %	0 %	0 %	383842909
3100	NC_017062	TAA	2	6	113581	113586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842909
3101	NC_017062	T	8	8	113587	113594	0 %	100 %	0 %	0 %	383842909
3102	NC_017062	TGT	2	6	113643	113648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842909
3103	NC_017062	CATA	2	8	113653	113660	50 %	25 %	0 %	25 %	383842909
3104	NC_017062	TCA	2	6	113661	113666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842909
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3107	NC_017062	TCA	2	6	113871	113876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842909
3108	NC_017062	CTA	2	6	113968	113973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842909
3109	NC_017062	TCC	2	6	113981	113986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383842909
3110	NC_017062	ACG	2	6	114035	114040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842909
3111	NC_017062	CTT	2	6	114070	114075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842909
3112	NC_017062	CATG	2	8	114082	114089	25 %	25 %	25 %	25 %	383842909
3113	NC_017062	CTT	2	6	114094	114099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842909
3114	NC_017062	T	6	6	114098	114103	0 %	100 %	0 %	0 %	383842909
3115	NC_017062	GCA	2	6	114114	114119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842909
3116	NC_017062	AGC	2	6	114125	114130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842909
3117	NC_017062	TTCA	2	8	114131	114138	25 %	50 %	0 %	25 %	383842909
3118	NC_017062	AAT	2	6	114185	114190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842909
3119	NC_017062	TAT	2	6	114208	114213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842909
3120	NC_017062	T	8	8	114220	114227	0 %	100 %	0 %	0 %	383842909
3121	NC_017062	GTA	2	6	114307	114312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842909
3122	NC_017062	ACA	2	6	114357	114362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383842909
3123	NC_017062	CCAT	2	8	114381	114388	25 %	25 %	0 %	50 %	383842909
3124	NC_017062	TCA	2	6	114423	114428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842909
3125	NC_017062	ACC	2	6	114431	114436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383842909
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3127	NC_017062	ATA	2	6	114489	114494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842909
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3247	NC_017062	AAC	2	6	118695	118700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3248	NC_017062	TTTTCG	2	12	118784	118795	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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3253	NC_017062	TTA	2	6	118968	118973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842914
3254	NC_017062	TAA	2	6	118977	118982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842914
3255	NC_017062	ATAAA	2	10	119030	119039	80 %	20 %	0 %	0 %	383842914
3256	NC_017062	GTTAT	2	10	119062	119071	20 %	60 %	20 %	0 %	383842914
3257	NC_017062	CAT	2	6	119125	119130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842914
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3261	NC_017062	TAG	2	6	119222	119227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842914
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3325	NC_017062	AT	4	8	121345	121352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3333	NC_017062	ATT	2	6	121689	121694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3334	NC_017062	TAT	2	6	121735	121740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3335	NC_017062	ATTT	2	8	121780	121787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3339	NC_017062	A	6	6	121890	121895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3343	NC_017062	ACT	2	6	122013	122018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842916
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3361	NC_017062	AT	3	6	122620	122625	50 %	50 %	0 %	0 %	383842916
3362	NC_017062	ATC	2	6	122658	122663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842916
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3365	NC_017062	ACGCTC	2	12	122859	122870	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383842916
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3371	NC_017062	TCATA	2	10	123152	123161	40 %	40 %	0 %	20 %	383842916
3372	NC_017062	TTC	2	6	123186	123191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842916
3373	NC_017062	TCA	2	6	123223	123228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842916
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