MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_017062	ATA	2	6	57055	57060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842866
1503	NC_017062	A	6	6	57082	57087	100 %	0 %	0 %	0 %	383842866
1504	NC_017062	TTA	2	6	57089	57094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842866
1505	NC_017062	AAT	2	6	57110	57115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842866
1506	NC_017062	CAT	2	6	57117	57122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842866
1507	NC_017062	TA	3	6	57135	57140	50 %	50 %	0 %	0 %	383842866
1508	NC_017062	GA	3	6	57180	57185	50 %	0 %	50 %	0 %	383842866
1509	NC_017062	TA	3	6	57205	57210	50 %	50 %	0 %	0 %	383842866
1510	NC_017062	TAA	2	6	57237	57242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842866
1511	NC_017062	TATT	2	8	57252	57259	25 %	75 %	0 %	0 %	383842866
1512	NC_017062	ATA	2	6	57268	57273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842866
1513	NC_017062	TATTT	2	10	57287	57296	20 %	80 %	0 %	0 %	383842866
1514	NC_017062	ATT	2	6	57333	57338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017062	TAA	2	6	57347	57352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017062	TAAA	2	8	57373	57380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017062	TAT	2	6	57408	57413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017062	TTA	3	9	57417	57425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017062	ATGA	2	8	57498	57505	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017062	TAAT	2	8	57517	57524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017062	AAT	2	6	57543	57548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842867
1522	NC_017062	A	6	6	57616	57621	100 %	0 %	0 %	0 %	383842867
1523	NC_017062	ATA	2	6	57677	57682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842867
1524	NC_017062	AGCA	2	8	57758	57765	50 %	0 %	25 %	25 %	383842867
1525	NC_017062	A	6	6	57768	57773	100 %	0 %	0 %	0 %	383842867
1526	NC_017062	ATA	2	6	57791	57796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842867
1527	NC_017062	TGA	2	6	57810	57815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842867
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1529	NC_017062	AGTA	2	8	57822	57829	50 %	25 %	25 %	0 %	383842867
1530	NC_017062	GGT	2	6	57832	57837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383842867
1531	NC_017062	AT	3	6	57847	57852	50 %	50 %	0 %	0 %	383842867
1532	NC_017062	TGA	2	6	57882	57887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842867
1533	NC_017062	ATT	2	6	57892	57897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842867
1534	NC_017062	AAT	2	6	57979	57984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842867
1535	NC_017062	TTA	3	9	58040	58048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842867
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1537	NC_017062	TGA	2	6	58173	58178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842867
1538	NC_017062	AGAA	2	8	58221	58228	75 %	0 %	25 %	0 %	383842867
1539	NC_017062	GCT	2	6	58372	58377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842867
1540	NC_017062	TA	3	6	58405	58410	50 %	50 %	0 %	0 %	383842867
1541	NC_017062	A	8	8	58433	58440	100 %	0 %	0 %	0 %	383842867
1542	NC_017062	AT	3	6	58474	58479	50 %	50 %	0 %	0 %	383842867
1543	NC_017062	ACTAAA	2	12	58543	58554	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383842867
1544	NC_017062	ATT	2	6	58564	58569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842867
1545	NC_017062	GAA	2	6	58603	58608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842867
1546	NC_017062	GTA	2	6	58621	58626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842867
1547	NC_017062	ATA	2	6	58789	58794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017062	A	6	6	58871	58876	100 %	0 %	0 %	0 %	383842868
1549	NC_017062	A	6	6	58882	58887	100 %	0 %	0 %	0 %	383842868
1550	NC_017062	CTTA	2	8	58897	58904	25 %	50 %	0 %	25 %	383842868
1551	NC_017062	ATA	2	6	59037	59042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842868
1552	NC_017062	CAC	2	6	59100	59105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383842868
1553	NC_017062	TAG	2	6	59133	59138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842868
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1555	NC_017062	ATA	2	6	59234	59239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842868
1556	NC_017062	TA	3	6	59268	59273	50 %	50 %	0 %	0 %	383842868
1557	NC_017062	A	6	6	59315	59320	100 %	0 %	0 %	0 %	383842868
1558	NC_017062	TAA	2	6	59379	59384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842868
1559	NC_017062	ATA	2	6	59411	59416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842868
1560	NC_017062	A	6	6	59452	59457	100 %	0 %	0 %	0 %	383842868
1561	NC_017062	AG	3	6	59494	59499	50 %	0 %	50 %	0 %	383842868
1562	NC_017062	ATG	2	6	59509	59514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842868
1563	NC_017062	TTA	2	6	59515	59520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842869
1564	NC_017062	TAT	2	6	59521	59526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842869
1565	NC_017062	TAT	2	6	59540	59545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842869
1566	NC_017062	TTTAT	2	10	59552	59561	20 %	80 %	0 %	0 %	383842869
1567	NC_017062	AGA	2	6	59592	59597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842869
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1569	NC_017062	TACA	2	8	59725	59732	50 %	25 %	0 %	25 %	383842869
1570	NC_017062	AGAA	2	8	59766	59773	75 %	0 %	25 %	0 %	383842869
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1573	NC_017062	CGTT	2	8	59871	59878	0 %	50 %	25 %	25 %	383842869
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1578	NC_017062	CTA	2	6	60082	60087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842869
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1581	NC_017062	T	6	6	60142	60147	0 %	100 %	0 %	0 %	383842869
1582	NC_017062	A	6	6	60159	60164	100 %	0 %	0 %	0 %	383842869
1583	NC_017062	ATT	2	6	60175	60180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842869
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1592	NC_017062	TA	3	6	60538	60543	50 %	50 %	0 %	0 %	383842869
1593	NC_017062	T	7	7	60571	60577	0 %	100 %	0 %	0 %	383842869
1594	NC_017062	GGT	2	6	60601	60606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383842869
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1598	NC_017062	AAT	2	6	60787	60792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842869
1599	NC_017062	TTG	2	6	60833	60838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842869
1600	NC_017062	A	6	6	60848	60853	100 %	0 %	0 %	0 %	383842869
1601	NC_017062	TTC	2	6	60887	60892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842869
1602	NC_017062	TCA	2	6	60905	60910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_017062	TAA	2	6	60937	60942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017062	GTA	2	6	61024	61029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017062	GAA	2	6	61037	61042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017062	AGC	2	6	61051	61056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_017062	GCAT	2	8	61063	61070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_017062	AT	3	6	61069	61074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017062	TAAA	2	8	61114	61121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017062	TAT	2	6	61155	61160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017062	TAC	2	6	61232	61237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_017062	AAT	2	6	61269	61274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017062	ATA	2	6	61328	61333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017062	TAC	2	6	61336	61341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_017062	ATG	2	6	61366	61371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017062	AAT	2	6	61384	61389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017062	TACT	2	8	61393	61400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1618	NC_017062	AT	3	6	61420	61425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017062	TTAG	2	8	61495	61502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017062	AAT	2	6	61552	61557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017062	TAT	2	6	61623	61628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017062	TA	3	6	61646	61651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017062	A	6	6	61671	61676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017062	ATA	2	6	61742	61747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017062	TCTA	2	8	61796	61803	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_017062	ACA	3	9	61805	61813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_017062	CAA	2	6	61869	61874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_017062	AAAT	2	8	61883	61890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017062	TTG	2	6	61921	61926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017062	ATT	2	6	61958	61963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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