MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017062	TCT	2	6	222701	222706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842995
6002	NC_017062	AT	3	6	222742	222747	50 %	50 %	0 %	0 %	383842995
6003	NC_017062	TAT	2	6	222772	222777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842995
6004	NC_017062	CCT	2	6	222783	222788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383842995
6005	NC_017062	TTG	2	6	222794	222799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842995
6006	NC_017062	CAT	2	6	222811	222816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842995
6007	NC_017062	AGC	2	6	222833	222838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842995
6008	NC_017062	T	6	6	222841	222846	0 %	100 %	0 %	0 %	383842995
6009	NC_017062	CAT	2	6	222862	222867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842995
6010	NC_017062	AGC	2	6	222869	222874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842995
6011	NC_017062	CTT	2	6	222890	222895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842995
6012	NC_017062	TAG	2	6	222913	222918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842995
6013	NC_017062	GAT	2	6	222925	222930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842995
6014	NC_017062	TAGC	2	8	222937	222944	25 %	25 %	25 %	25 %	383842995
6015	NC_017062	T	6	6	222956	222961	0 %	100 %	0 %	0 %	383842995
6016	NC_017062	ATTAT	2	10	223025	223034	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_017062	GTT	2	6	223039	223044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_017062	ACG	2	6	223049	223054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_017062	TAT	2	6	223103	223108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_017062	CTA	2	6	223175	223180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842996
6021	NC_017062	GCT	2	6	223264	223269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842996
6022	NC_017062	TCTTT	2	10	223283	223292	0 %	80 %	0 %	20 %	383842996
6023	NC_017062	AAG	2	6	223298	223303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842996
6024	NC_017062	CTT	2	6	223343	223348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842996
6025	NC_017062	GAT	2	6	223369	223374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842996
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6027	NC_017062	TAAAC	2	10	223414	223423	60 %	20 %	0 %	20 %	383842996
6028	NC_017062	CAG	2	6	223427	223432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842996
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6031	NC_017062	GCTT	2	8	223566	223573	0 %	50 %	25 %	25 %	383842996
6032	NC_017062	GGT	2	6	223654	223659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383842996
6033	NC_017062	TTA	2	6	223690	223695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842996
6034	NC_017062	T	6	6	223780	223785	0 %	100 %	0 %	0 %	383842996
6035	NC_017062	ACC	2	6	223827	223832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383842996
6036	NC_017062	AAT	2	6	223873	223878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842996
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6038	NC_017062	CTT	2	6	223889	223894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842996
6039	NC_017062	AC	3	6	223901	223906	50 %	0 %	0 %	50 %	383842996
6040	NC_017062	T	7	7	223980	223986	0 %	100 %	0 %	0 %	383842996
6041	NC_017062	CTT	2	6	223991	223996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842996
6042	NC_017062	CTA	2	6	224024	224029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842996
6043	NC_017062	TAC	2	6	224031	224036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842996
6044	NC_017062	T	6	6	224099	224104	0 %	100 %	0 %	0 %	383842996
6045	NC_017062	ATC	2	6	224112	224117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842996
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6047	NC_017062	CTG	2	6	224246	224251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842996
6048	NC_017062	CTT	2	6	224252	224257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842996
6049	NC_017062	T	6	6	224307	224312	0 %	100 %	0 %	0 %	383842996
6050	NC_017062	GAT	2	6	224327	224332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842996
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6052	NC_017062	TTG	2	6	224381	224386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842996
6053	NC_017062	TGA	2	6	224475	224480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842996
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6056	NC_017062	TTG	2	6	224567	224572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842996
6057	NC_017062	CAG	2	6	224648	224653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842996
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6059	NC_017062	T	6	6	224663	224668	0 %	100 %	0 %	0 %	383842996
6060	NC_017062	TAT	3	9	224705	224713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842996
6061	NC_017062	AT	3	6	224829	224834	50 %	50 %	0 %	0 %	383842996
6062	NC_017062	CAA	2	6	224879	224884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383842996
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6064	NC_017062	TC	3	6	224925	224930	0 %	50 %	0 %	50 %	383842996
6065	NC_017062	TTCC	2	8	224963	224970	0 %	50 %	0 %	50 %	383842996
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6068	NC_017062	TC	3	6	225098	225103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_017062	AT	3	6	225133	225138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_017062	GTT	2	6	225148	225153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_017062	ATA	2	6	225199	225204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_017062	CAA	2	6	225248	225253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_017062	ATT	2	6	225263	225268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_017062	TAT	2	6	225270	225275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_017062	TGC	2	6	225295	225300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6120	NC_017062	CAT	2	6	226858	226863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6122	NC_017062	ATTA	2	8	226898	226905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_017062	AATCTT	2	12	226911	226922	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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