MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_017062	AAAAT	2	10	204421	204430	80 %	20 %	0 %	0 %	383842983
5503	NC_017062	TAA	2	6	204434	204439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842983
5504	NC_017062	TAC	2	6	204463	204468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842983
5505	NC_017062	TA	3	6	204537	204542	50 %	50 %	0 %	0 %	383842983
5506	NC_017062	TAG	2	6	204544	204549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842983
5507	NC_017062	T	6	6	204558	204563	0 %	100 %	0 %	0 %	383842983
5508	NC_017062	ATA	2	6	204614	204619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017062	AT	3	6	204635	204640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017062	ATA	2	6	204652	204657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017062	TCT	2	6	204671	204676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_017062	GCTAA	2	10	204689	204698	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5513	NC_017062	A	6	6	204705	204710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017062	GAA	2	6	204741	204746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_017062	A	6	6	204750	204755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_017062	GT	3	6	204763	204768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017062	AGT	3	9	204777	204785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017062	T	7	7	204811	204817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_017062	T	6	6	204840	204845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_017062	AAT	2	6	204861	204866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_017062	GTT	2	6	204872	204877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_017062	ACAA	2	8	204903	204910	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5523	NC_017062	ATTTTA	2	12	204912	204923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_017062	A	6	6	204927	204932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_017062	A	6	6	205005	205010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_017062	AAG	2	6	205014	205019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_017062	TAT	2	6	205031	205036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_017062	TAA	2	6	205051	205056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_017062	ATA	2	6	205072	205077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_017062	TTG	3	9	205078	205086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_017062	ATT	2	6	205116	205121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_017062	CAAA	2	8	205289	205296	75 %	0 %	0 %	25 %	383842984
5533	NC_017062	AGG	2	6	205309	205314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383842984
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5537	NC_017062	GAT	2	6	205367	205372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842984
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5539	NC_017062	ACC	2	6	205424	205429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383842984
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5543	NC_017062	A	6	6	205515	205520	100 %	0 %	0 %	0 %	383842984
5544	NC_017062	GCA	2	6	205554	205559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842984
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5547	NC_017062	A	6	6	205751	205756	100 %	0 %	0 %	0 %	383842984
5548	NC_017062	GTT	2	6	205815	205820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842984
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5551	NC_017062	GCA	2	6	205899	205904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842984
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5553	NC_017062	A	7	7	206039	206045	100 %	0 %	0 %	0 %	383842984
5554	NC_017062	GCG	2	6	206046	206051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383842984
5555	NC_017062	AGA	2	6	206066	206071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842984
5556	NC_017062	A	8	8	206147	206154	100 %	0 %	0 %	0 %	383842984
5557	NC_017062	ATT	2	6	206202	206207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842984
5558	NC_017062	ATCA	2	8	206218	206225	50 %	25 %	0 %	25 %	383842984
5559	NC_017062	TAG	2	6	206234	206239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842984
5560	NC_017062	ATT	2	6	206262	206267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842984
5561	NC_017062	TAAT	2	8	206305	206312	50 %	50 %	0 %	0 %	383842984
5562	NC_017062	GCT	2	6	206334	206339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842984
5563	NC_017062	TGA	2	6	206404	206409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842984
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5565	NC_017062	ATT	2	6	206482	206487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5567	NC_017062	ATG	2	6	206598	206603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5569	NC_017062	A	6	6	206681	206686	100 %	0 %	0 %	0 %	383842985
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5599	NC_017062	T	6	6	208091	208096	0 %	100 %	0 %	0 %	383842985
5600	NC_017062	ATA	2	6	208191	208196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842985
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5605	NC_017062	CATCT	2	10	208319	208328	20 %	40 %	0 %	40 %	383842985
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5609	NC_017062	T	8	8	208414	208421	0 %	100 %	0 %	0 %	383842985
5610	NC_017062	ATC	2	6	208517	208522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842985
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5617	NC_017062	TAA	2	6	208815	208820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_017062	TAA	2	6	208825	208830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_017062	AT	4	8	208879	208886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_017062	TAAA	2	8	208887	208894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_017062	T	6	6	208924	208929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5623	NC_017062	ATA	2	6	209027	209032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6000	NC_017062	CTTG	2	8	222683	222690	0 %	50 %	25 %	25 %	383842995

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