MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

< Previous12...678910111213141516...6061Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017062	TTC	2	6	185820	185825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842965
5003	NC_017062	TCT	2	6	185835	185840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842965
5004	NC_017062	TCTT	2	8	185907	185914	0 %	75 %	0 %	25 %	383842965
5005	NC_017062	GA	4	8	186061	186068	50 %	0 %	50 %	0 %	383842965
5006	NC_017062	TCT	2	6	186197	186202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842965
5007	NC_017062	ATT	2	6	186222	186227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842965
5008	NC_017062	T	7	7	186226	186232	0 %	100 %	0 %	0 %	383842965
5009	NC_017062	TAC	2	6	186256	186261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_017062	AT	3	6	186271	186276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017062	TGT	2	6	186277	186282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017062	CAA	2	6	186325	186330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_017062	TAT	2	6	186337	186342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017062	TAT	2	6	186421	186426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842966
5015	NC_017062	TTG	2	6	186434	186439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842966
5016	NC_017062	TC	3	6	186518	186523	0 %	50 %	0 %	50 %	383842966
5017	NC_017062	T	6	6	186600	186605	0 %	100 %	0 %	0 %	383842966
5018	NC_017062	T	8	8	186616	186623	0 %	100 %	0 %	0 %	383842966
5019	NC_017062	TAA	2	6	186663	186668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842966
5020	NC_017062	GCA	2	6	186703	186708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842966
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5022	NC_017062	TAC	2	6	186753	186758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842966
5023	NC_017062	T	8	8	186762	186769	0 %	100 %	0 %	0 %	383842966
5024	NC_017062	TCA	2	6	186815	186820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842966
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5028	NC_017062	TGC	2	6	186948	186953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842966
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5032	NC_017062	TTGT	2	8	187071	187078	0 %	75 %	25 %	0 %	383842966
5033	NC_017062	T	6	6	187116	187121	0 %	100 %	0 %	0 %	383842966
5034	NC_017062	T	7	7	187175	187181	0 %	100 %	0 %	0 %	383842967
5035	NC_017062	TGA	2	6	187212	187217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842967
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5037	NC_017062	TAC	2	6	187305	187310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842967
5038	NC_017062	ATCT	2	8	187356	187363	25 %	50 %	0 %	25 %	383842967
5039	NC_017062	ATT	2	6	187381	187386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842967
5040	NC_017062	TAA	3	9	187419	187427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842967
5041	NC_017062	ATATA	2	10	187437	187446	60 %	40 %	0 %	0 %	383842967
5042	NC_017062	AATTT	2	10	187447	187456	40 %	60 %	0 %	0 %	383842967
5043	NC_017062	AACATT	2	12	187462	187473	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383842967
5044	NC_017062	TAG	2	6	187507	187512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842968
5045	NC_017062	TATAAA	2	12	187516	187527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842968
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5047	NC_017062	AT	3	6	187548	187553	50 %	50 %	0 %	0 %	383842968
5048	NC_017062	TATT	2	8	187554	187561	25 %	75 %	0 %	0 %	383842968
5049	NC_017062	CAT	2	6	187575	187580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842968
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5051	NC_017062	TAA	2	6	187642	187647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842968
5052	NC_017062	AT	3	6	187695	187700	50 %	50 %	0 %	0 %	383842968
5053	NC_017062	ATT	2	6	187754	187759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842968
5054	NC_017062	CTC	2	6	187773	187778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383842968
5055	NC_017062	T	6	6	187821	187826	0 %	100 %	0 %	0 %	383842968
5056	NC_017062	TAT	2	6	187851	187856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842968
5057	NC_017062	AAAAC	2	10	187867	187876	80 %	0 %	0 %	20 %	383842968
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5062	NC_017062	CAT	2	6	188071	188076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842968
5063	NC_017062	AT	3	6	188133	188138	50 %	50 %	0 %	0 %	383842968
5064	NC_017062	ATGA	2	8	188168	188175	50 %	25 %	25 %	0 %	383842968
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5074	NC_017062	TAC	2	6	188452	188457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842968
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5087	NC_017062	TAA	2	6	189049	189054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5092	NC_017062	TATTTA	2	12	189154	189165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5094	NC_017062	TA	3	6	189178	189183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5104	NC_017062	TCT	2	6	189550	189555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_017062	CAC	2	6	189561	189566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_017062	TA	3	6	189677	189682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017062	CTTT	2	8	189692	189699	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5108	NC_017062	T	6	6	189697	189702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017062	AT	3	6	189705	189710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017062	CTT	2	6	189716	189721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_017062	TA	3	6	189739	189744	50 %	50 %	0 %	0 %	383842970
5112	NC_017062	ATT	2	6	189765	189770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842970
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5116	NC_017062	ATA	2	6	189911	189916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017062	GTT	2	6	189969	189974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017062	AATTT	2	10	190020	190029	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017062	T	6	6	190058	190063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017062	TAA	2	6	190094	190099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017062	ATTAT	2	10	190100	190109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017062	TTA	2	6	190155	190160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017062	T	7	7	190173	190179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017062	TAAT	2	8	190211	190218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017062	TA	3	6	190259	190264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017062	TTA	2	6	190380	190385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5128	NC_017062	GTT	2	6	190444	190449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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