MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017062	AGA	3	9	166562	166570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842952
4502	NC_017062	ACA	2	6	166637	166642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383842952
4503	NC_017062	CTT	2	6	166705	166710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842952
4504	NC_017062	A	6	6	166725	166730	100 %	0 %	0 %	0 %	383842952
4505	NC_017062	GGA	2	6	166754	166759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383842952
4506	NC_017062	T	6	6	166760	166765	0 %	100 %	0 %	0 %	383842952
4507	NC_017062	GAT	2	6	166790	166795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952
4508	NC_017062	AGA	2	6	166890	166895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842952
4509	NC_017062	TAAT	2	8	166897	166904	50 %	50 %	0 %	0 %	383842952
4510	NC_017062	AAT	2	6	166908	166913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842952
4511	NC_017062	ATA	2	6	166950	166955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842952
4512	NC_017062	A	6	6	166966	166971	100 %	0 %	0 %	0 %	383842952
4513	NC_017062	AAG	2	6	166981	166986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842952
4514	NC_017062	GTC	2	6	167011	167016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842952
4515	NC_017062	AGC	2	6	167024	167029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842952
4516	NC_017062	TAA	2	6	167039	167044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842952
4517	NC_017062	ATT	2	6	167125	167130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842952
4518	NC_017062	GTA	2	6	167148	167153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952
4519	NC_017062	TCA	2	6	167171	167176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842952
4520	NC_017062	A	7	7	167190	167196	100 %	0 %	0 %	0 %	383842952
4521	NC_017062	TTTA	2	8	167220	167227	25 %	75 %	0 %	0 %	383842952
4522	NC_017062	GCT	2	6	167268	167273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842952
4523	NC_017062	TGG	2	6	167281	167286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383842952
4524	NC_017062	AG	3	6	167331	167336	50 %	0 %	50 %	0 %	383842952
4525	NC_017062	TTGT	2	8	167437	167444	0 %	75 %	25 %	0 %	383842952
4526	NC_017062	ATG	2	6	167532	167537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952
4527	NC_017062	ACAA	2	8	167541	167548	75 %	0 %	0 %	25 %	383842952
4528	NC_017062	TAT	2	6	167576	167581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842952
4529	NC_017062	TAT	2	6	167613	167618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842952
4530	NC_017062	GAT	2	6	167654	167659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952
4531	NC_017062	TA	3	6	167692	167697	50 %	50 %	0 %	0 %	383842952
4532	NC_017062	TAC	2	6	167783	167788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842952
4533	NC_017062	TGGT	2	8	167803	167810	0 %	50 %	50 %	0 %	383842952
4534	NC_017062	TTA	2	6	167814	167819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842952
4535	NC_017062	TAA	2	6	167852	167857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842952
4536	NC_017062	CTAA	2	8	167862	167869	50 %	25 %	0 %	25 %	383842952
4537	NC_017062	A	6	6	167868	167873	100 %	0 %	0 %	0 %	383842952
4538	NC_017062	AT	3	6	167875	167880	50 %	50 %	0 %	0 %	383842952
4539	NC_017062	TTC	2	6	167975	167980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842952
4540	NC_017062	AAC	2	6	168070	168075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383842952
4541	NC_017062	AGT	2	6	168119	168124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952
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4543	NC_017062	CCA	2	6	168186	168191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383842952
4544	NC_017062	ATC	2	6	168208	168213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842952
4545	NC_017062	TA	4	8	168227	168234	50 %	50 %	0 %	0 %	383842952
4546	NC_017062	CAG	2	6	168267	168272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842952
4547	NC_017062	AGC	2	6	168277	168282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842952
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4549	NC_017062	TAT	2	6	168338	168343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842952
4550	NC_017062	AAGG	2	8	168354	168361	50 %	0 %	50 %	0 %	383842952
4551	NC_017062	TAT	2	6	168485	168490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842952
4552	NC_017062	GA	3	6	168550	168555	50 %	0 %	50 %	0 %	383842952
4553	NC_017062	CTG	2	6	168592	168597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842952
4554	NC_017062	AT	3	6	168604	168609	50 %	50 %	0 %	0 %	383842952
4555	NC_017062	TTA	2	6	168652	168657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842952
4556	NC_017062	AGT	2	6	168732	168737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952
4557	NC_017062	AGG	2	6	168875	168880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383842952
4558	NC_017062	TGC	2	6	168881	168886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842952
4559	NC_017062	TCT	2	6	168906	168911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842952
4560	NC_017062	GTT	2	6	168957	168962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842952
4561	NC_017062	GAA	2	6	168972	168977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842952
4562	NC_017062	ATT	3	9	169007	169015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842952
4563	NC_017062	TGA	2	6	169019	169024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952
4564	NC_017062	TTG	2	6	169075	169080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842952
4565	NC_017062	ATG	2	6	169081	169086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952
4566	NC_017062	TATAC	2	10	169131	169140	40 %	40 %	0 %	20 %	383842952
4567	NC_017062	ATT	2	6	169143	169148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842952
4568	NC_017062	TGA	2	6	169214	169219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952
4569	NC_017062	TTA	2	6	169243	169248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842952
4570	NC_017062	GTG	2	6	169270	169275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383842952
4571	NC_017062	TTAC	2	8	169355	169362	25 %	50 %	0 %	25 %	383842952
4572	NC_017062	AGA	2	6	169385	169390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842952
4573	NC_017062	ACT	3	9	169443	169451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842952
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4575	NC_017062	GTAGA	2	10	169540	169549	40 %	20 %	40 %	0 %	383842952
4576	NC_017062	TAT	3	9	169580	169588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842952
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4578	NC_017062	TGT	2	6	169643	169648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842952
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4580	NC_017062	ATTG	2	8	169685	169692	25 %	50 %	25 %	0 %	383842952
4581	NC_017062	TAC	2	6	169705	169710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842952
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4585	NC_017062	GGT	2	6	169866	169871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383842952
4586	NC_017062	TAG	2	6	169882	169887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952
4587	NC_017062	A	6	6	169891	169896	100 %	0 %	0 %	0 %	383842952
4588	NC_017062	TGA	2	6	169913	169918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952
4589	NC_017062	CTG	2	6	169954	169959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842952
4590	NC_017062	CAT	2	6	170026	170031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842952
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4592	NC_017062	CTG	2	6	170131	170136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842952
4593	NC_017062	AGC	2	6	170168	170173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842952
4594	NC_017062	TGA	2	6	170183	170188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952
4595	NC_017062	ATTGTC	2	12	170270	170281	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4596	NC_017062	T	6	6	170364	170369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_017062	T	6	6	170376	170381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_017062	GTA	2	6	170390	170395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_017062	ATT	2	6	170489	170494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_017062	AAT	2	6	170523	170528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_017062	TTA	2	6	170551	170556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_017062	ATA	2	6	170561	170566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_017062	TAAAG	2	10	170567	170576	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_017062	TAA	2	6	170594	170599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_017062	TAA	2	6	170602	170607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_017062	TC	3	6	170610	170615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4607	NC_017062	AGT	3	9	170626	170634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_017062	AGAA	2	8	170675	170682	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_017062	TAT	2	6	170716	170721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_017062	AGT	2	6	170748	170753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_017062	TA	3	6	170786	170791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_017062	ATGT	2	8	170793	170800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_017062	ATA	2	6	170806	170811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_017062	TCTA	2	8	170823	170830	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4615	NC_017062	TCT	2	6	170880	170885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_017062	ATC	2	6	170940	170945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_017062	AT	3	6	170957	170962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_017062	ATA	2	6	170964	170969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_017062	TTA	2	6	170995	171000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_017062	AT	3	6	171025	171030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_017062	TACTT	2	10	171060	171069	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4622	NC_017062	ATT	2	6	171122	171127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_017062	ATAA	2	8	171189	171196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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