MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 7949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017060	AAT	2	6	96	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017060	ATC	2	6	148	153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017060	CCG	2	6	182	187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017060	TGG	2	6	227	232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527588
5	NC_017060	CGC	2	6	269	274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527588
6	NC_017060	GCC	2	6	276	281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527588
7	NC_017060	GCG	2	6	335	340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527588
8	NC_017060	AGC	3	9	422	430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527588
9	NC_017060	TTC	2	6	484	489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527588
10	NC_017060	TGC	2	6	734	739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527588
11	NC_017060	GTG	2	6	775	780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527588
12	NC_017060	GTG	2	6	832	837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527588
13	NC_017060	TGA	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527588
14	NC_017060	GGC	2	6	962	967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527588
15	NC_017060	CGG	2	6	1049	1054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527588
16	NC_017060	CAA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527588
17	NC_017060	GGC	2	6	1206	1211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527588
18	NC_017060	TGG	2	6	1234	1239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527588
19	NC_017060	GCG	3	9	1337	1345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527588
20	NC_017060	GAA	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527588
21	NC_017060	AGT	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527589
22	NC_017060	GTT	2	6	1647	1652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527589
23	NC_017060	CCA	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527589
24	NC_017060	TGC	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
25	NC_017060	CCG	3	9	1795	1803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527589
26	NC_017060	CAT	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527589
27	NC_017060	TGC	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
28	NC_017060	GAC	2	6	2099	2104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527589
29	NC_017060	GGT	2	6	2148	2153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527589
30	NC_017060	CCG	2	6	2257	2262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527589
31	NC_017060	TGT	2	6	2273	2278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527589
32	NC_017060	TGC	2	6	2288	2293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
33	NC_017060	GCT	2	6	2295	2300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
34	NC_017060	GGC	2	6	2528	2533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
35	NC_017060	CGT	2	6	2664	2669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
36	NC_017060	CGG	2	6	2819	2824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
37	NC_017060	GCC	2	6	2883	2888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527589
38	NC_017060	GGT	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527589
39	NC_017060	CCA	2	6	2966	2971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527589
40	NC_017060	AGA	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527589
41	NC_017060	GGC	2	6	3186	3191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
42	NC_017060	TCA	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527589
43	NC_017060	CAC	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527589
44	NC_017060	CGG	2	6	3266	3271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
45	NC_017060	GTC	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
46	NC_017060	ATT	2	6	3327	3332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527589
47	NC_017060	GGT	2	6	3396	3401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527589
48	NC_017060	GTG	2	6	3517	3522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527589
49	NC_017060	GCG	2	6	3556	3561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
50	NC_017060	CTG	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
51	NC_017060	GCG	2	6	3604	3609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
52	NC_017060	GTC	2	6	3625	3630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
53	NC_017060	CTG	2	6	3729	3734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
54	NC_017060	ATT	2	6	3855	3860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017060	TAA	2	6	3893	3898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017060	GAA	2	6	3947	3952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017060	ATG	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017060	CAG	2	6	4015	4020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527590
59	NC_017060	TGC	3	9	4197	4205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527590
60	NC_017060	AAT	2	6	4228	4233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527590
61	NC_017060	ACA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527590
62	NC_017060	CTC	2	6	4303	4308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527590
63	NC_017060	CAA	2	6	4371	4376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527590
64	NC_017060	CGC	2	6	4389	4394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527590
65	NC_017060	TAC	2	6	4429	4434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527590
66	NC_017060	CCG	2	6	4500	4505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527590
67	NC_017060	CGC	2	6	4516	4521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527590
68	NC_017060	CCT	2	6	4535	4540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527590
69	NC_017060	GGT	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527590
70	NC_017060	CCG	2	6	4795	4800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527590
71	NC_017060	GGT	2	6	4906	4911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527590
72	NC_017060	TGC	2	6	4964	4969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527590
73	NC_017060	TGA	2	6	5012	5017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527590
74	NC_017060	CAC	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527590
75	NC_017060	CTT	2	6	5157	5162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527590
76	NC_017060	GCC	2	6	5200	5205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527590
77	NC_017060	ATA	2	6	5301	5306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527590
78	NC_017060	CTG	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017060	TGC	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017060	TAA	2	6	5507	5512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017060	ACG	2	6	5693	5698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527591
82	NC_017060	CAT	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527591
83	NC_017060	CAA	2	6	5892	5897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527591
84	NC_017060	CCA	2	6	5952	5957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527591
85	NC_017060	CCG	2	6	5980	5985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527591
86	NC_017060	CTG	2	6	6005	6010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527591
87	NC_017060	GCA	2	6	6044	6049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527591
88	NC_017060	AAG	2	6	6116	6121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527591
89	NC_017060	GCA	2	6	6264	6269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527592
90	NC_017060	CAG	2	6	6277	6282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527592
91	NC_017060	CTT	2	6	6301	6306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527592
92	NC_017060	CTG	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527592
93	NC_017060	GCG	2	6	6333	6338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527592
94	NC_017060	CTT	2	6	6523	6528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527592
95	NC_017060	CAA	2	6	6571	6576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527592
96	NC_017060	AAT	2	6	6633	6638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017060	CAT	2	6	6651	6656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017060	GCG	2	6	6676	6681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017060	GTT	2	6	6962	6967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017060	CGA	2	6	6968	6973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017060	GAA	2	6	7045	7050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017060	TCA	2	6	7368	7373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017060	CGG	2	6	7665	7670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527593
104	NC_017060	ACG	2	6	7681	7686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527593
105	NC_017060	GCT	2	6	7717	7722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527593
106	NC_017060	TCC	2	6	7747	7752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527593
107	NC_017060	ACC	2	6	7900	7905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527593
108	NC_017060	GGC	2	6	7951	7956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527593
109	NC_017060	GCA	2	6	7994	7999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527593
110	NC_017060	TGC	2	6	8008	8013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527593
111	NC_017060	TGC	2	6	8055	8060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527593
112	NC_017060	GTC	2	6	8243	8248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527593
113	NC_017060	CAG	2	6	8283	8288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527593
114	NC_017060	AGC	2	6	8537	8542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527594
115	NC_017060	TGC	2	6	8693	8698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527594
116	NC_017060	CGC	2	6	8837	8842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527594
117	NC_017060	GCG	2	6	8911	8916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527594
118	NC_017060	CTG	2	6	8969	8974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527594
119	NC_017060	ACA	2	6	8977	8982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527594
120	NC_017060	TGG	2	6	8986	8991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527594
121	NC_017060	CTG	2	6	9012	9017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527594
122	NC_017060	CGG	2	6	9050	9055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527594
123	NC_017060	GCA	2	6	9107	9112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527594
124	NC_017060	AGA	2	6	9128	9133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527594
125	NC_017060	GAT	3	9	9246	9254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527594
126	NC_017060	GAT	2	6	9275	9280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527594
127	NC_017060	TCG	2	6	9301	9306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527594
128	NC_017060	TGC	2	6	9320	9325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527594
129	NC_017060	TGA	2	6	9516	9521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017060	CGG	2	6	9638	9643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527595
131	NC_017060	GCA	2	6	9681	9686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527595
132	NC_017060	ACC	2	6	9749	9754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527595
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