MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017060	CAT	2	6	198945	198950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527763
4002	NC_017060	CAC	2	6	198963	198968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527763
4003	NC_017060	GAA	2	6	198984	198989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527763
4004	NC_017060	CCA	2	6	199001	199006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527763
4005	NC_017060	GA	3	6	199045	199050	50 %	0 %	50 %	0 %	384527763
4006	NC_017060	CGG	2	6	199065	199070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527763
4007	NC_017060	CAG	2	6	199104	199109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527763
4008	NC_017060	CAC	2	6	199116	199121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527763
4009	NC_017060	CAT	2	6	199182	199187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527763
4010	NC_017060	CAT	2	6	199200	199205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527763
4011	NC_017060	CGC	2	6	199223	199228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527763
4012	NC_017060	GAA	2	6	199242	199247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527763
4013	NC_017060	TAT	2	6	199277	199282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527763
4014	NC_017060	CAT	2	6	199341	199346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527763
4015	NC_017060	GCCA	2	8	199444	199451	25 %	0 %	25 %	50 %	384527763
4016	NC_017060	CAA	2	6	199544	199549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527763
4017	NC_017060	TAA	2	6	199597	199602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527763
4018	NC_017060	A	6	6	199731	199736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017060	GTCC	2	8	199741	199748	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_017060	TG	3	6	199829	199834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017060	GAG	2	6	199848	199853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017060	CCAC	2	8	199908	199915	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4023	NC_017060	TCAAGG	2	12	199923	199934	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4024	NC_017060	GCC	2	6	199945	199950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_017060	T	6	6	199997	200002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017060	GC	3	6	200008	200013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_017060	TC	3	6	200081	200086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_017060	T	6	6	200149	200154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017060	GCG	2	6	200280	200285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_017060	GC	3	6	200335	200340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_017060	GCG	2	6	200370	200375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_017060	GTGG	2	8	200398	200405	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017060	TGA	3	9	200571	200579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527764
4034	NC_017060	AC	3	6	200632	200637	50 %	0 %	0 %	50 %	384527764
4035	NC_017060	GCA	2	6	200647	200652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527764
4036	NC_017060	TGC	2	6	200727	200732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527764
4037	NC_017060	CAG	2	6	200749	200754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527764
4038	NC_017060	GC	3	6	200780	200785	0 %	0 %	50 %	50 %	384527764
4039	NC_017060	CG	3	6	200793	200798	0 %	0 %	50 %	50 %	384527764
4040	NC_017060	TTA	2	6	200844	200849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527764
4041	NC_017060	CGG	2	6	200856	200861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527764
4042	NC_017060	CAG	2	6	200900	200905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527764
4043	NC_017060	CTG	2	6	200963	200968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527764
4044	NC_017060	TGA	2	6	201019	201024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017060	ATA	2	6	201101	201106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017060	TTA	2	6	201124	201129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017060	CGG	2	6	201238	201243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527765
4048	NC_017060	ACA	3	9	201333	201341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527765
4049	NC_017060	GGT	2	6	201465	201470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527765
4050	NC_017060	T	6	6	201657	201662	0 %	100 %	0 %	0 %	384527765
4051	NC_017060	GAT	2	6	201681	201686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527765
4052	NC_017060	T	6	6	201747	201752	0 %	100 %	0 %	0 %	384527766
4053	NC_017060	ACAG	2	8	201795	201802	50 %	0 %	25 %	25 %	384527766
4054	NC_017060	ACC	2	6	201825	201830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527766
4055	NC_017060	TAC	2	6	201838	201843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527766
4056	NC_017060	G	6	6	201861	201866	0 %	0 %	100 %	0 %	384527766
4057	NC_017060	AGC	2	6	201878	201883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527766
4058	NC_017060	ATT	2	6	201936	201941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527766
4059	NC_017060	GAT	2	6	201946	201951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527766
4060	NC_017060	TTGA	2	8	201955	201962	25 %	50 %	25 %	0 %	384527766
4061	NC_017060	ACCA	2	8	202101	202108	50 %	0 %	0 %	50 %	384527766
4062	NC_017060	CAA	2	6	202121	202126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527766
4063	NC_017060	AT	3	6	202172	202177	50 %	50 %	0 %	0 %	384527767
4064	NC_017060	TGGC	2	8	202189	202196	0 %	25 %	50 %	25 %	384527767
4065	NC_017060	A	6	6	202273	202278	100 %	0 %	0 %	0 %	384527767
4066	NC_017060	GAAA	2	8	202387	202394	75 %	0 %	25 %	0 %	384527767
4067	NC_017060	CGG	2	6	202409	202414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_017060	GAA	2	6	202449	202454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017060	T	6	6	202527	202532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017060	ATC	2	6	202546	202551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_017060	AAC	2	6	202588	202593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_017060	ATT	2	6	202601	202606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017060	GTC	2	6	202607	202612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_017060	ACC	2	6	202620	202625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_017060	GATG	2	8	202664	202671	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017060	AGG	2	6	202695	202700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017060	ATG	2	6	202714	202719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017060	GAA	2	6	202746	202751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527768
4079	NC_017060	CGG	2	6	202780	202785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527768
4080	NC_017060	CTG	2	6	202875	202880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527768
4081	NC_017060	ACG	2	6	202883	202888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527768
4082	NC_017060	TGGCC	2	10	202903	202912	0 %	20 %	40 %	40 %	384527768
4083	NC_017060	TCTG	2	8	202929	202936	0 %	50 %	25 %	25 %	384527768
4084	NC_017060	GCGG	2	8	202964	202971	0 %	0 %	75 %	25 %	384527768
4085	NC_017060	CTG	2	6	203262	203267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527768
4086	NC_017060	TGC	2	6	203296	203301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527769
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4089	NC_017060	GAA	2	6	203388	203393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527769
4090	NC_017060	GGC	2	6	203460	203465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527769
4091	NC_017060	CGAA	2	8	203495	203502	50 %	0 %	25 %	25 %	384527769
4092	NC_017060	CCAC	2	8	203507	203514	25 %	0 %	0 %	75 %	384527769
4093	NC_017060	GCC	2	6	203590	203595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527769
4094	NC_017060	A	6	6	203616	203621	100 %	0 %	0 %	0 %	384527769
4095	NC_017060	TTC	2	6	203622	203627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527769
4096	NC_017060	GC	3	6	203709	203714	0 %	0 %	50 %	50 %	384527769
4097	NC_017060	CAC	2	6	203760	203765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527769
4098	NC_017060	A	6	6	203804	203809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017060	T	7	7	203937	203943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017060	CAA	2	6	203954	203959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_017060	TCA	2	6	204030	204035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_017060	GAA	2	6	204075	204080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017060	CTT	2	6	204094	204099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_017060	T	7	7	204107	204113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017060	CACAA	2	10	204136	204145	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4106	NC_017060	GAA	2	6	204175	204180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017060	CT	3	6	204194	204199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_017060	AGG	2	6	204254	204259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017060	AACA	2	8	204281	204288	75 %	0 %	0 %	25 %	384527770
4110	NC_017060	ATT	2	6	204305	204310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527770
4111	NC_017060	TC	3	6	204375	204380	0 %	50 %	0 %	50 %	384527770
4112	NC_017060	TAA	2	6	204399	204404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527770
4113	NC_017060	CAT	2	6	204408	204413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527770
4114	NC_017060	A	6	6	204521	204526	100 %	0 %	0 %	0 %	384527770
4115	NC_017060	GAT	2	6	204545	204550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017060	GAC	2	6	204632	204637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527771
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4118	NC_017060	AGC	2	6	204745	204750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527771
4119	NC_017060	T	6	6	204792	204797	0 %	100 %	0 %	0 %	384527771
4120	NC_017060	GCC	2	6	204901	204906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527771
4121	NC_017060	GC	3	6	204927	204932	0 %	0 %	50 %	50 %	384527771
4122	NC_017060	CCG	2	6	204986	204991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527771
4123	NC_017060	CGC	2	6	205002	205007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527771
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4125	NC_017060	CAG	2	6	205143	205148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527771
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4127	NC_017060	TGT	2	6	205189	205194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527771
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4152	NC_017060	CAT	2	6	206042	206047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4243	NC_017060	GGCT	2	8	210756	210763	0 %	25 %	50 %	25 %	384527777
4244	NC_017060	GTT	2	6	210870	210875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527777
4245	NC_017060	GC	3	6	210917	210922	0 %	0 %	50 %	50 %	384527777
4246	NC_017060	TGC	2	6	211042	211047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527777
4247	NC_017060	TC	3	6	211073	211078	0 %	50 %	0 %	50 %	384527777
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4249	NC_017060	ACTGGC	2	12	211121	211132	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384527777
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4373	NC_017060	CGG	2	6	216707	216712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4376	NC_017060	AAAT	2	8	216820	216827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4497	NC_017060	CTT	2	6	222867	222872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527788
4498	NC_017060	AAT	2	6	222927	222932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527789
4499	NC_017060	ACA	2	6	222956	222961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527789
4500	NC_017060	AAT	2	6	222969	222974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527789

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