MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017060	GA	3	6	150615	150620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017060	TCC	2	6	150647	150652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_017060	CTG	2	6	150664	150669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_017060	CCG	2	6	150779	150784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_017060	TGC	2	6	150814	150819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_017060	A	6	6	150899	150904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017060	CGG	2	6	150920	150925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_017060	AAT	2	6	151032	151037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527716
3009	NC_017060	CAG	2	6	151085	151090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527716
3010	NC_017060	CAT	2	6	151116	151121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527716
3011	NC_017060	GAA	2	6	151141	151146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527716
3012	NC_017060	GCA	2	6	151203	151208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527716
3013	NC_017060	TTG	2	6	151352	151357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527716
3014	NC_017060	ATGG	2	8	151367	151374	25 %	25 %	50 %	0 %	384527716
3015	NC_017060	A	6	6	151394	151399	100 %	0 %	0 %	0 %	384527716
3016	NC_017060	A	6	6	151423	151428	100 %	0 %	0 %	0 %	384527716
3017	NC_017060	CAA	2	6	151445	151450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527716
3018	NC_017060	CAG	2	6	151553	151558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527716
3019	NC_017060	TGA	2	6	151572	151577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527716
3020	NC_017060	TTC	2	6	151620	151625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527716
3021	NC_017060	TGC	2	6	151638	151643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527716
3022	NC_017060	ACC	2	6	151656	151661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527716
3023	NC_017060	GA	3	6	151731	151736	50 %	0 %	50 %	0 %	384527716
3024	NC_017060	CCG	2	6	151770	151775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527716
3025	NC_017060	GAA	2	6	151834	151839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527716
3026	NC_017060	GCG	2	6	151903	151908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_017060	AAAG	2	8	152007	152014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017060	CTG	2	6	152040	152045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_017060	GAT	2	6	152052	152057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017060	AAT	2	6	152168	152173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527717
3031	NC_017060	CAG	2	6	152221	152226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527717
3032	NC_017060	CAT	2	6	152252	152257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527717
3033	NC_017060	GAA	2	6	152277	152282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527717
3034	NC_017060	GCA	2	6	152339	152344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527717
3035	NC_017060	TTG	2	6	152488	152493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527717
3036	NC_017060	ATGG	2	8	152503	152510	25 %	25 %	50 %	0 %	384527717
3037	NC_017060	GAA	3	9	152517	152525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527717
3038	NC_017060	ATCA	2	8	152683	152690	50 %	25 %	0 %	25 %	384527717
3039	NC_017060	CCAG	2	8	152716	152723	25 %	0 %	25 %	50 %	384527717
3040	NC_017060	ATTG	2	8	152745	152752	25 %	50 %	25 %	0 %	384527717
3041	NC_017060	GCTG	2	8	152860	152867	0 %	25 %	50 %	25 %	384527717
3042	NC_017060	GCC	2	6	152933	152938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527717
3043	NC_017060	T	6	6	152945	152950	0 %	100 %	0 %	0 %	384527717
3044	NC_017060	GAA	2	6	152967	152972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527717
3045	NC_017060	TTA	2	6	153000	153005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527717
3046	NC_017060	ACCC	2	8	153017	153024	25 %	0 %	0 %	75 %	384527717
3047	NC_017060	AGA	2	6	153113	153118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527717
3048	NC_017060	AAG	2	6	153145	153150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527717
3049	NC_017060	CTG	2	6	153177	153182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527717
3050	NC_017060	GAT	2	6	153189	153194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527717
3051	NC_017060	ATAA	2	8	153288	153295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017060	A	6	6	153294	153299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017060	AAT	2	6	153307	153312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527718
3054	NC_017060	CAG	2	6	153360	153365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527718
3055	NC_017060	ATT	2	6	153392	153397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527718
3056	NC_017060	GAA	2	6	153416	153421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527718
3057	NC_017060	GCA	2	6	153478	153483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527718
3058	NC_017060	TTG	2	6	153627	153632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527718
3059	NC_017060	ATGG	2	8	153642	153649	25 %	25 %	50 %	0 %	384527718
3060	NC_017060	GAA	3	9	153656	153664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527718
3061	NC_017060	ATCA	2	8	153822	153829	50 %	25 %	0 %	25 %	384527718
3062	NC_017060	CCAG	2	8	153855	153862	25 %	0 %	25 %	50 %	384527718
3063	NC_017060	ATTG	2	8	153884	153891	25 %	50 %	25 %	0 %	384527718
3064	NC_017060	GCTG	2	8	153999	154006	0 %	25 %	50 %	25 %	384527718
3065	NC_017060	GCC	2	6	154072	154077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527718
3066	NC_017060	T	6	6	154084	154089	0 %	100 %	0 %	0 %	384527718
3067	NC_017060	GAA	2	6	154106	154111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527718
3068	NC_017060	A	6	6	154215	154220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017060	TTG	2	6	154230	154235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017060	AC	3	6	154362	154367	50 %	0 %	0 %	50 %	384527719
3071	NC_017060	AT	3	6	154400	154405	50 %	50 %	0 %	0 %	384527719
3072	NC_017060	AGC	2	6	154462	154467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527719
3073	NC_017060	GAT	2	6	154501	154506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527719
3074	NC_017060	GAA	2	6	154522	154527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527719
3075	NC_017060	TAA	2	6	154530	154535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527719
3076	NC_017060	TTA	2	6	154620	154625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527719
3077	NC_017060	GTT	2	6	154716	154721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527719
3078	NC_017060	A	6	6	154731	154736	100 %	0 %	0 %	0 %	384527719
3079	NC_017060	TGGC	2	8	154759	154766	0 %	25 %	50 %	25 %	384527719
3080	NC_017060	TTA	2	6	154862	154867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527719
3081	NC_017060	CAT	2	6	154868	154873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527719
3082	NC_017060	ATG	2	6	154910	154915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527719
3083	NC_017060	TGG	2	6	154941	154946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527719
3084	NC_017060	GTT	2	6	154957	154962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527719
3085	NC_017060	GCG	2	6	154973	154978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527719
3086	NC_017060	GGCT	2	8	155104	155111	0 %	25 %	50 %	25 %	384527719
3087	NC_017060	TGA	2	6	155126	155131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527719
3088	NC_017060	ACC	2	6	155199	155204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527719
3089	NC_017060	CAA	2	6	155245	155250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527719
3090	NC_017060	CTGG	2	8	155310	155317	0 %	25 %	50 %	25 %	384527719
3091	NC_017060	TGC	2	6	155408	155413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527719
3092	NC_017060	TTC	2	6	155567	155572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527719
3093	NC_017060	GCAG	2	8	155595	155602	25 %	0 %	50 %	25 %	384527719
3094	NC_017060	GCT	2	6	155685	155690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527719
3095	NC_017060	A	6	6	155718	155723	100 %	0 %	0 %	0 %	384527719
3096	NC_017060	ACTT	2	8	155738	155745	25 %	50 %	0 %	25 %	384527719
3097	NC_017060	CTG	2	6	155800	155805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527719
3098	NC_017060	ACG	2	6	155820	155825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527719
3099	NC_017060	CTG	2	6	155833	155838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527719
3100	NC_017060	GCG	2	6	155855	155860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527719
3101	NC_017060	GC	4	8	155929	155936	0 %	0 %	50 %	50 %	384527719
3102	NC_017060	CT	3	6	155992	155997	0 %	50 %	0 %	50 %	384527720
3103	NC_017060	CGG	2	6	156025	156030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527720
3104	NC_017060	CT	3	6	156071	156076	0 %	50 %	0 %	50 %	384527720
3105	NC_017060	CG	3	6	156110	156115	0 %	0 %	50 %	50 %	384527720
3106	NC_017060	GCT	2	6	156196	156201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527720
3107	NC_017060	TGC	2	6	156264	156269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527720
3108	NC_017060	ACA	2	6	156388	156393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527720
3109	NC_017060	T	6	6	156432	156437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017060	GAG	2	6	156457	156462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017060	TAAA	2	8	156488	156495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017060	TAA	2	6	156549	156554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017060	TA	3	6	156563	156568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017060	T	7	7	156581	156587	0 %	100 %	0 %	0 %	384527721
3115	NC_017060	ACC	2	6	156592	156597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527721
3116	NC_017060	ATT	2	6	156603	156608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527721
3117	NC_017060	GC	3	6	156617	156622	0 %	0 %	50 %	50 %	384527721
3118	NC_017060	GAT	2	6	156664	156669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527721
3119	NC_017060	ATTAT	2	10	156728	156737	40 %	60 %	0 %	0 %	384527721
3120	NC_017060	A	6	6	156757	156762	100 %	0 %	0 %	0 %	384527721
3121	NC_017060	CAA	2	6	156821	156826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527721
3122	NC_017060	CAA	2	6	156830	156835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527721
3123	NC_017060	CAA	2	6	156860	156865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527721
3124	NC_017060	CCA	2	6	156880	156885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527721
3125	NC_017060	A	6	6	156903	156908	100 %	0 %	0 %	0 %	384527721
3126	NC_017060	AT	3	6	157019	157024	50 %	50 %	0 %	0 %	384527721
3127	NC_017060	TA	4	8	157056	157063	50 %	50 %	0 %	0 %	384527721
3128	NC_017060	ATCAT	2	10	157091	157100	40 %	40 %	0 %	20 %	384527721
3129	NC_017060	A	6	6	157134	157139	100 %	0 %	0 %	0 %	384527721
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3134	NC_017060	CGCAT	2	10	157345	157354	20 %	20 %	20 %	40 %	384527721
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3239	NC_017060	GGA	2	6	162546	162551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_017060	AAGC	2	8	162576	162583	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3241	NC_017060	ACCCC	2	10	162609	162618	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3242	NC_017060	GGGA	2	8	162636	162643	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_017060	CTC	2	6	162695	162700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3244	NC_017060	T	6	6	162761	162766	0 %	100 %	0 %	0 %	384527727
3245	NC_017060	CCCG	2	8	162779	162786	0 %	0 %	25 %	75 %	384527727
3246	NC_017060	GCG	3	9	162823	162831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527727
3247	NC_017060	ATG	2	6	162868	162873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527727
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3249	NC_017060	CGC	2	6	162920	162925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527727
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3371	NC_017060	CGG	2	6	168756	168761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527732
3372	NC_017060	AGA	2	6	168862	168867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527732
3373	NC_017060	GC	3	6	168906	168911	0 %	0 %	50 %	50 %	384527732
3374	NC_017060	CCATCG	2	12	168986	168997	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384527732
3375	NC_017060	GAT	2	6	169035	169040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527732
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3377	NC_017060	GCC	2	6	169113	169118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527732
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3379	NC_017060	C	6	6	169205	169210	0 %	0 %	0 %	100 %	384527732
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3382	NC_017060	CTG	2	6	169389	169394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527732
3383	NC_017060	CAGT	2	8	169486	169493	25 %	25 %	25 %	25 %	384527733
3384	NC_017060	CAC	2	6	169541	169546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527733
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3402	NC_017060	GC	3	6	170304	170309	0 %	0 %	50 %	50 %	384527733
3403	NC_017060	GCA	2	6	170350	170355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527733
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3453	NC_017060	ATGG	2	8	173186	173193	25 %	25 %	50 %	0 %	384527736
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3458	NC_017060	ATC	2	6	173435	173440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3474	NC_017060	GCGG	2	8	174255	174262	0 %	0 %	75 %	25 %	384527737
3475	NC_017060	GGAT	2	8	174321	174328	25 %	25 %	50 %	0 %	384527737
3476	NC_017060	GAT	2	6	174395	174400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527737
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3479	NC_017060	AGG	2	6	174527	174532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527737
3480	NC_017060	TGG	3	9	174535	174543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527737
3481	NC_017060	TCT	2	6	174555	174560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527737
3482	NC_017060	G	7	7	174602	174608	0 %	0 %	100 %	0 %	384527737
3483	NC_017060	TGC	2	6	174650	174655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527737
3484	NC_017060	TGA	2	6	174748	174753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3485	NC_017060	CA	3	6	174792	174797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3486	NC_017060	ATC	2	6	174832	174837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3487	NC_017060	TTA	2	6	174892	174897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3488	NC_017060	CGG	2	6	174934	174939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3489	NC_017060	A	6	6	174943	174948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3490	NC_017060	A	7	7	175058	175064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3491	NC_017060	CAA	2	6	175065	175070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3492	NC_017060	ATA	2	6	175156	175161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3493	NC_017060	TATG	2	8	175210	175217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3494	NC_017060	TTAATT	2	12	175218	175229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3495	NC_017060	CAT	2	6	175327	175332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527738
3496	NC_017060	TGT	2	6	175611	175616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527738
3497	NC_017060	GCCTG	2	10	175636	175645	0 %	20 %	40 %	40 %	384527738
3498	NC_017060	TGG	2	6	175665	175670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527738
3499	NC_017060	CGT	2	6	175756	175761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527738
3500	NC_017060	TCG	2	6	175950	175955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527738

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