MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017060	TCA	2	6	122834	122839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527698
2502	NC_017060	GT	3	6	122850	122855	0 %	50 %	50 %	0 %	384527698
2503	NC_017060	GGCG	2	8	122874	122881	0 %	0 %	75 %	25 %	384527698
2504	NC_017060	TGA	2	6	122954	122959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527698
2505	NC_017060	GAATTT	2	12	122974	122985	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384527698
2506	NC_017060	TAC	2	6	123013	123018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527698
2507	NC_017060	CTT	2	6	123039	123044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527698
2508	NC_017060	CAC	2	6	123189	123194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527698
2509	NC_017060	CGT	2	6	123202	123207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527698
2510	NC_017060	CTG	2	6	123208	123213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527698
2511	NC_017060	GAACTG	2	12	123214	123225	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384527698
2512	NC_017060	TGAC	2	8	123257	123264	25 %	25 %	25 %	25 %	384527698
2513	NC_017060	CGA	2	6	123270	123275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527698
2514	NC_017060	CTT	2	6	123342	123347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527698
2515	NC_017060	AAAGCG	2	12	123427	123438	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384527698
2516	NC_017060	CAG	2	6	123505	123510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527699
2517	NC_017060	CAG	3	9	123514	123522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527699
2518	NC_017060	GTT	2	6	123568	123573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527699
2519	NC_017060	TGA	2	6	123603	123608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527699
2520	NC_017060	GATA	2	8	123675	123682	50 %	25 %	25 %	0 %	384527699
2521	NC_017060	AGC	2	6	123688	123693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527699
2522	NC_017060	TCT	2	6	123696	123701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527699
2523	NC_017060	C	6	6	123702	123707	0 %	0 %	0 %	100 %	384527699
2524	NC_017060	CAG	2	6	123789	123794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527699
2525	NC_017060	GAA	2	6	123880	123885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527699
2526	NC_017060	AGAAC	2	10	123933	123942	60 %	0 %	20 %	20 %	384527699
2527	NC_017060	GGC	2	6	123991	123996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527699
2528	NC_017060	TCC	2	6	124020	124025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527699
2529	NC_017060	TCA	2	6	124044	124049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527699
2530	NC_017060	CA	3	6	124080	124085	50 %	0 %	0 %	50 %	384527699
2531	NC_017060	CGC	3	9	124099	124107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527699
2532	NC_017060	GCT	2	6	124179	124184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527699
2533	NC_017060	CTG	2	6	124288	124293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527699
2534	NC_017060	AGCC	2	8	124398	124405	25 %	0 %	25 %	50 %	384527699
2535	NC_017060	CG	3	6	124412	124417	0 %	0 %	50 %	50 %	384527699
2536	NC_017060	CAG	2	6	124450	124455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527699
2537	NC_017060	AAT	2	6	124591	124596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527699
2538	NC_017060	GAAAT	2	10	124807	124816	60 %	20 %	20 %	0 %	384527699
2539	NC_017060	TGA	2	6	124823	124828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527700
2540	NC_017060	AGA	2	6	124883	124888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527700
2541	NC_017060	CT	3	6	125105	125110	0 %	50 %	0 %	50 %	384527700
2542	NC_017060	CAGG	2	8	125112	125119	25 %	0 %	50 %	25 %	384527700
2543	NC_017060	TGC	2	6	125149	125154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527700
2544	NC_017060	CGC	2	6	125270	125275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527700
2545	NC_017060	CGGG	2	8	125282	125289	0 %	0 %	75 %	25 %	384527700
2546	NC_017060	GTG	2	6	125304	125309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527700
2547	NC_017060	ATT	2	6	125357	125362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527700
2548	NC_017060	TGG	2	6	125415	125420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527700
2549	NC_017060	TGT	2	6	125543	125548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527701
2550	NC_017060	GCC	2	6	125569	125574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527701
2551	NC_017060	TCA	2	6	125597	125602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527701
2552	NC_017060	ATG	2	6	125645	125650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527701
2553	NC_017060	TCG	2	6	125654	125659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527701
2554	NC_017060	GAC	2	6	125664	125669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527701
2555	NC_017060	TACGG	2	10	125757	125766	20 %	20 %	40 %	20 %	384527701
2556	NC_017060	AGAC	2	8	125792	125799	50 %	0 %	25 %	25 %	384527701
2557	NC_017060	TGCCG	2	10	125917	125926	0 %	20 %	40 %	40 %	384527701
2558	NC_017060	CAG	2	6	125944	125949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527701
2559	NC_017060	GCTG	2	8	126002	126009	0 %	25 %	50 %	25 %	384527701
2560	NC_017060	AACGG	2	10	126010	126019	40 %	0 %	40 %	20 %	384527701
2561	NC_017060	GAC	2	6	126067	126072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527701
2562	NC_017060	CTG	2	6	126088	126093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527701
2563	NC_017060	TGA	2	6	126195	126200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527701
2564	NC_017060	GCA	2	6	126204	126209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527701
2565	NC_017060	TTC	2	6	126233	126238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527701
2566	NC_017060	CCGTGG	2	12	126239	126250	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384527701
2567	NC_017060	GCA	2	6	126298	126303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527701
2568	NC_017060	AG	3	6	126348	126353	50 %	0 %	50 %	0 %	384527701
2569	NC_017060	GCT	2	6	126390	126395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527701
2570	NC_017060	ATG	2	6	126454	126459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527701
2571	NC_017060	TGT	2	6	126486	126491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527701
2572	NC_017060	AAC	3	9	126493	126501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527701
2573	NC_017060	GCA	2	6	126696	126701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527701
2574	NC_017060	TCC	2	6	126720	126725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527701
2575	NC_017060	CCG	2	6	126733	126738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527701
2576	NC_017060	AC	3	6	126753	126758	50 %	0 %	0 %	50 %	384527701
2577	NC_017060	CTCA	2	8	126825	126832	25 %	25 %	0 %	50 %	384527701
2578	NC_017060	GGCT	2	8	126874	126881	0 %	25 %	50 %	25 %	384527701
2579	NC_017060	TGG	2	6	126887	126892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527701
2580	NC_017060	AC	3	6	126897	126902	50 %	0 %	0 %	50 %	384527701
2581	NC_017060	CAA	2	6	127043	127048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527701
2582	NC_017060	CGT	2	6	127078	127083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527701
2583	NC_017060	TCA	2	6	127141	127146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527701
2584	NC_017060	TGAT	2	8	127149	127156	25 %	50 %	25 %	0 %	384527701
2585	NC_017060	GAC	2	6	127218	127223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527702
2586	NC_017060	GCA	2	6	127270	127275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527702
2587	NC_017060	AAC	2	6	127320	127325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527702
2588	NC_017060	TCC	2	6	127386	127391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527702
2589	NC_017060	CTG	2	6	127438	127443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527702
2590	NC_017060	ACC	2	6	127576	127581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527702
2591	NC_017060	A	6	6	127606	127611	100 %	0 %	0 %	0 %	384527702
2592	NC_017060	CAT	2	6	127637	127642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527702
2593	NC_017060	GAAC	2	8	127658	127665	50 %	0 %	25 %	25 %	384527702
2594	NC_017060	TAC	2	6	127667	127672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527702
2595	NC_017060	CAG	2	6	127688	127693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_017060	CTG	2	6	127706	127711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_017060	CAAA	2	8	127746	127753	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2598	NC_017060	A	6	6	127826	127831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_017060	TCAG	2	8	127850	127857	25 %	25 %	25 %	25 %	384527703
2600	NC_017060	CGC	2	6	127869	127874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527703
2601	NC_017060	GCC	2	6	127905	127910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527703
2602	NC_017060	CTG	2	6	127971	127976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527703
2603	NC_017060	CGC	2	6	128010	128015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527703
2604	NC_017060	CTG	2	6	128049	128054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527703
2605	NC_017060	TGA	2	6	128122	128127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527703
2606	NC_017060	GCTG	2	8	128134	128141	0 %	25 %	50 %	25 %	384527703
2607	NC_017060	CTG	2	6	128187	128192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527703
2608	NC_017060	GAA	2	6	128259	128264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527703
2609	NC_017060	TGG	2	6	128524	128529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527703
2610	NC_017060	CGT	2	6	128541	128546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527703
2611	NC_017060	AAC	2	6	128553	128558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527703
2612	NC_017060	TGG	2	6	128599	128604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527703
2613	NC_017060	CTG	2	6	128775	128780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527703
2614	NC_017060	TAT	2	6	128801	128806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527703
2615	NC_017060	GCT	2	6	128838	128843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527703
2616	NC_017060	GTG	2	6	128869	128874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527703
2617	NC_017060	CGC	2	6	128888	128893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527703
2618	NC_017060	GCC	2	6	128934	128939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527703
2619	NC_017060	GAC	2	6	128979	128984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527703
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2621	NC_017060	TGC	2	6	129001	129006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527703
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