MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017060	CCA	2	6	73766	73771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527648
1502	NC_017060	A	7	7	73810	73816	100 %	0 %	0 %	0 %	384527648
1503	NC_017060	CTGT	2	8	73855	73862	0 %	50 %	25 %	25 %	384527648
1504	NC_017060	TGA	2	6	73959	73964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527648
1505	NC_017060	ATA	2	6	73968	73973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527648
1506	NC_017060	ACC	2	6	73977	73982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527648
1507	NC_017060	GCG	2	6	73998	74003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527648
1508	NC_017060	ATT	2	6	74004	74009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527648
1509	NC_017060	A	8	8	74158	74165	100 %	0 %	0 %	0 %	384527648
1510	NC_017060	CAGA	2	8	74180	74187	50 %	0 %	25 %	25 %	384527648
1511	NC_017060	CTT	2	6	74204	74209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527648
1512	NC_017060	CCA	2	6	74272	74277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527648
1513	NC_017060	CAA	2	6	74303	74308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527648
1514	NC_017060	ATA	2	6	74334	74339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527648
1515	NC_017060	TC	3	6	74356	74361	0 %	50 %	0 %	50 %	384527648
1516	NC_017060	GA	3	6	74429	74434	50 %	0 %	50 %	0 %	384527648
1517	NC_017060	CCT	2	6	74482	74487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527648
1518	NC_017060	GCA	2	6	74566	74571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527648
1519	NC_017060	ATA	2	6	74608	74613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527648
1520	NC_017060	ATA	2	6	74619	74624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017060	CCG	2	6	74632	74637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_017060	TTTA	2	8	74659	74666	25 %	75 %	0 %	0 %	384527649
1523	NC_017060	ATG	2	6	74708	74713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527649
1524	NC_017060	GCT	2	6	74748	74753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527649
1525	NC_017060	CGT	2	6	74780	74785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527649
1526	NC_017060	GTG	2	6	74819	74824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527649
1527	NC_017060	CACC	2	8	74894	74901	25 %	0 %	0 %	75 %	384527649
1528	NC_017060	GAT	2	6	74920	74925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527649
1529	NC_017060	TTA	2	6	74962	74967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527649
1530	NC_017060	GTC	2	6	75001	75006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527649
1531	NC_017060	TTA	2	6	75052	75057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527649
1532	NC_017060	GTC	2	6	75066	75071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527649
1533	NC_017060	TCA	2	6	75158	75163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527649
1534	NC_017060	GGC	2	6	75164	75169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527649
1535	NC_017060	CAT	2	6	75197	75202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527649
1536	NC_017060	ATGT	2	8	75298	75305	25 %	50 %	25 %	0 %	384527649
1537	NC_017060	CAT	2	6	75434	75439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527649
1538	NC_017060	TGA	2	6	75507	75512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527649
1539	NC_017060	TGC	2	6	75573	75578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527649
1540	NC_017060	TAC	2	6	75675	75680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527649
1541	NC_017060	TTCA	2	8	75837	75844	25 %	50 %	0 %	25 %	384527649
1542	NC_017060	CTT	2	6	76011	76016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527649
1543	NC_017060	GGAA	2	8	76049	76056	50 %	0 %	50 %	0 %	384527649
1544	NC_017060	CCATC	2	10	76196	76205	20 %	20 %	0 %	60 %	384527649
1545	NC_017060	GTT	2	6	76225	76230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527649
1546	NC_017060	ACAG	2	8	76276	76283	50 %	0 %	25 %	25 %	384527649
1547	NC_017060	GCT	2	6	76286	76291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527649
1548	NC_017060	CGG	2	6	76361	76366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527649
1549	NC_017060	AC	3	6	76418	76423	50 %	0 %	0 %	50 %	384527649
1550	NC_017060	ATA	2	6	76444	76449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527649
1551	NC_017060	TAT	2	6	76499	76504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527649
1552	NC_017060	TGC	2	6	76662	76667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527649
1553	NC_017060	CCT	2	6	76712	76717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527649
1554	NC_017060	TGC	2	6	76757	76762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527649
1555	NC_017060	ATTT	2	8	76797	76804	25 %	75 %	0 %	0 %	384527649
1556	NC_017060	AG	3	6	76806	76811	50 %	0 %	50 %	0 %	384527649
1557	NC_017060	GAT	2	6	76840	76845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527649
1558	NC_017060	AAT	2	6	76872	76877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527649
1559	NC_017060	CAT	2	6	76934	76939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527649
1560	NC_017060	CGT	2	6	76940	76945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527649
1561	NC_017060	TGAA	2	8	76964	76971	50 %	25 %	25 %	0 %	384527649
1562	NC_017060	AAT	2	6	77004	77009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527649
1563	NC_017060	TGA	2	6	77055	77060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527649
1564	NC_017060	CCA	2	6	77065	77070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527649
1565	NC_017060	GAA	2	6	77080	77085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527649
1566	NC_017060	ATC	2	6	77103	77108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527649
1567	NC_017060	TGA	2	6	77160	77165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527649
1568	NC_017060	GT	3	6	77171	77176	0 %	50 %	50 %	0 %	384527649
1569	NC_017060	TGA	2	6	77397	77402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527649
1570	NC_017060	CAT	2	6	77430	77435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527649
1571	NC_017060	CAGCAA	2	12	77462	77473	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384527649
1572	NC_017060	CGA	2	6	77597	77602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527649
1573	NC_017060	ATG	3	9	77676	77684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527649
1574	NC_017060	GGAT	2	8	77712	77719	25 %	25 %	50 %	0 %	384527649
1575	NC_017060	GAA	2	6	77782	77787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527650
1576	NC_017060	GCG	2	6	77817	77822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527650
1577	NC_017060	CAT	2	6	77927	77932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527650
1578	NC_017060	ATC	2	6	77963	77968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527650
1579	NC_017060	CA	3	6	77994	77999	50 %	0 %	0 %	50 %	384527650
1580	NC_017060	TC	3	6	78012	78017	0 %	50 %	0 %	50 %	384527650
1581	NC_017060	TTCA	2	8	78023	78030	25 %	50 %	0 %	25 %	384527650
1582	NC_017060	GA	3	6	78126	78131	50 %	0 %	50 %	0 %	384527651
1583	NC_017060	GT	3	6	78157	78162	0 %	50 %	50 %	0 %	384527651
1584	NC_017060	GCA	2	6	78483	78488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527651
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1586	NC_017060	ATT	2	6	78555	78560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527651
1587	NC_017060	TGA	2	6	78572	78577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527651
1588	NC_017060	ATA	2	6	78638	78643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527652
1589	NC_017060	C	6	6	78672	78677	0 %	0 %	0 %	100 %	384527652
1590	NC_017060	T	6	6	78892	78897	0 %	100 %	0 %	0 %	384527652
1591	NC_017060	CTGC	2	8	78915	78922	0 %	25 %	25 %	50 %	384527652
1592	NC_017060	ATA	2	6	79048	79053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527652
1593	NC_017060	TC	3	6	79070	79075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_017060	TGC	2	6	79085	79090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_017060	TTC	2	6	79121	79126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527653
1596	NC_017060	GTGAC	2	10	79187	79196	20 %	20 %	40 %	20 %	384527653
1597	NC_017060	AAT	2	6	79292	79297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527653
1598	NC_017060	GC	3	6	79318	79323	0 %	0 %	50 %	50 %	384527653
1599	NC_017060	CTCG	2	8	79382	79389	0 %	25 %	25 %	50 %	384527653
1600	NC_017060	CAA	2	6	79398	79403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527653
1601	NC_017060	GCG	2	6	79495	79500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527653
1602	NC_017060	CAA	2	6	79517	79522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527653
1603	NC_017060	AAT	2	6	79704	79709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527653
1604	NC_017060	TGT	2	6	79720	79725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527653
1605	NC_017060	CTG	2	6	79869	79874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527653
1606	NC_017060	TTC	2	6	79942	79947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527653
1607	NC_017060	GCT	2	6	80072	80077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527653
1608	NC_017060	TTCC	2	8	80096	80103	0 %	50 %	0 %	50 %	384527653
1609	NC_017060	CCT	2	6	80117	80122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527653
1610	NC_017060	CTG	2	6	80139	80144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527653
1611	NC_017060	GCTTCC	2	12	80278	80289	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384527653
1612	NC_017060	TGC	2	6	80335	80340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527653
1613	NC_017060	GAA	2	6	80342	80347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527653
1614	NC_017060	T	7	7	80450	80456	0 %	100 %	0 %	0 %	384527653
1615	NC_017060	GCC	2	6	80458	80463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527653
1616	NC_017060	TTC	2	6	80539	80544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527653
1617	NC_017060	TGG	2	6	80657	80662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527653
1618	NC_017060	GTT	2	6	80684	80689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527653
1619	NC_017060	GATC	2	8	80717	80724	25 %	25 %	25 %	25 %	384527653
1620	NC_017060	T	6	6	80776	80781	0 %	100 %	0 %	0 %	384527653
1621	NC_017060	TGG	2	6	80966	80971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527653
1622	NC_017060	CAC	2	6	81059	81064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527653
1623	NC_017060	TGA	2	6	81083	81088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527653
1624	NC_017060	CGC	2	6	81171	81176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527653
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1626	NC_017060	CTG	2	6	81255	81260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527653
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