MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017060	TGG	2	6	49353	49358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527626
1002	NC_017060	CGG	2	6	49703	49708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527626
1003	NC_017060	CTG	2	6	49913	49918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527626
1004	NC_017060	TAT	2	6	49991	49996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527626
1005	NC_017060	GCT	2	6	50030	50035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527626
1006	NC_017060	GCT	2	6	50113	50118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527626
1007	NC_017060	AGTG	2	8	50132	50139	25 %	25 %	50 %	0 %	384527626
1008	NC_017060	CGGCG	2	10	50295	50304	0 %	0 %	60 %	40 %	384527627
1009	NC_017060	TG	3	6	50309	50314	0 %	50 %	50 %	0 %	384527627
1010	NC_017060	TGA	2	6	50363	50368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527627
1011	NC_017060	CCG	2	6	50378	50383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527627
1012	NC_017060	CCA	2	6	50393	50398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527627
1013	NC_017060	CTG	3	9	50421	50429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527627
1014	NC_017060	TGGCG	2	10	50444	50453	0 %	20 %	60 %	20 %	384527627
1015	NC_017060	TGTC	2	8	50466	50473	0 %	50 %	25 %	25 %	384527627
1016	NC_017060	AGA	2	6	50474	50479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527627
1017	NC_017060	TGC	2	6	50482	50487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527627
1018	NC_017060	TCAG	2	8	50512	50519	25 %	25 %	25 %	25 %	384527627
1019	NC_017060	CCCG	2	8	50557	50564	0 %	0 %	25 %	75 %	384527627
1020	NC_017060	GATGG	2	10	50588	50597	20 %	20 %	60 %	0 %	384527627
1021	NC_017060	GAT	2	6	50691	50696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527627
1022	NC_017060	AGC	2	6	50767	50772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527628
1023	NC_017060	GCG	2	6	50911	50916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527628
1024	NC_017060	CTG	2	6	50972	50977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527628
1025	NC_017060	CAGG	2	8	51036	51043	25 %	0 %	50 %	25 %	384527628
1026	NC_017060	TGA	2	6	51102	51107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527628
1027	NC_017060	ATG	2	6	51109	51114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527628
1028	NC_017060	TGC	2	6	51167	51172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527628
1029	NC_017060	TCAG	2	8	51197	51204	25 %	25 %	25 %	25 %	384527628
1030	NC_017060	GGC	2	6	51327	51332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527628
1031	NC_017060	TGG	2	6	51460	51465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527628
1032	NC_017060	AG	3	6	51511	51516	50 %	0 %	50 %	0 %	384527628
1033	NC_017060	ATC	2	6	51527	51532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527628
1034	NC_017060	TTA	2	6	51538	51543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527628
1035	NC_017060	TGC	2	6	51560	51565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527628
1036	NC_017060	TGT	2	6	51764	51769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527628
1037	NC_017060	TG	3	6	51781	51786	0 %	50 %	50 %	0 %	384527628
1038	NC_017060	AAT	2	6	51819	51824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527628
1039	NC_017060	CAG	2	6	51903	51908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527628
1040	NC_017060	GAT	2	6	51924	51929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527628
1041	NC_017060	TGC	2	6	51989	51994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527628
1042	NC_017060	TGA	2	6	52004	52009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527628
1043	NC_017060	G	7	7	52056	52062	0 %	0 %	100 %	0 %	384527628
1044	NC_017060	CTG	2	6	52069	52074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527628
1045	NC_017060	GGT	2	6	52103	52108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017060	TGT	2	6	52121	52126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017060	GC	3	6	52178	52183	0 %	0 %	50 %	50 %	384527629
1048	NC_017060	TCG	2	6	52192	52197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527629
1049	NC_017060	T	6	6	52239	52244	0 %	100 %	0 %	0 %	384527629
1050	NC_017060	CAC	3	9	52302	52310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527629
1051	NC_017060	AAT	2	6	52370	52375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527629
1052	NC_017060	C	6	6	52385	52390	0 %	0 %	0 %	100 %	384527629
1053	NC_017060	GCAG	2	8	52438	52445	25 %	0 %	50 %	25 %	384527629
1054	NC_017060	CGT	2	6	52466	52471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527629
1055	NC_017060	CCA	2	6	52625	52630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527629
1056	NC_017060	CGG	2	6	52652	52657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527629
1057	NC_017060	TGG	2	6	52679	52684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527629
1058	NC_017060	TGG	2	6	52717	52722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527629
1059	NC_017060	GATG	2	8	52772	52779	25 %	25 %	50 %	0 %	384527629
1060	NC_017060	TCG	3	9	53032	53040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527629
1061	NC_017060	GCC	3	9	53055	53063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527629
1062	NC_017060	GGC	2	6	53175	53180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527629
1063	NC_017060	CGCTTC	2	12	53199	53210	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384527629
1064	NC_017060	ATG	2	6	53212	53217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527629
1065	NC_017060	TCA	2	6	53218	53223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527629
1066	NC_017060	TTC	2	6	53229	53234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527629
1067	NC_017060	TTCT	2	8	53271	53278	0 %	75 %	0 %	25 %	384527629
1068	NC_017060	CAC	2	6	53304	53309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527629
1069	NC_017060	CAAA	2	8	53423	53430	75 %	0 %	0 %	25 %	384527629
1070	NC_017060	GGCG	2	8	53478	53485	0 %	0 %	75 %	25 %	384527629
1071	NC_017060	CAGC	2	8	53513	53520	25 %	0 %	25 %	50 %	384527629
1072	NC_017060	GCT	2	6	53524	53529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527629
1073	NC_017060	C	6	6	53556	53561	0 %	0 %	0 %	100 %	384527629
1074	NC_017060	AAC	2	6	53590	53595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527629
1075	NC_017060	A	7	7	53659	53665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017060	A	8	8	53679	53686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017060	T	6	6	53763	53768	0 %	100 %	0 %	0 %	384527630
1078	NC_017060	CAA	2	6	53785	53790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527630
1079	NC_017060	GGA	2	6	53842	53847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527630
1080	NC_017060	GCC	2	6	53874	53879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527630
1081	NC_017060	TTTC	2	8	53911	53918	0 %	75 %	0 %	25 %	384527630
1082	NC_017060	ATC	2	6	53943	53948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527630
1083	NC_017060	CCA	3	9	53950	53958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527630
1084	NC_017060	GTT	2	6	53991	53996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527630
1085	NC_017060	CGC	2	6	54008	54013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527630
1086	NC_017060	GC	3	6	54067	54072	0 %	0 %	50 %	50 %	384527630
1087	NC_017060	CAG	2	6	54155	54160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527630
1088	NC_017060	ATCAC	2	10	54180	54189	40 %	20 %	0 %	40 %	384527630
1089	NC_017060	TGC	2	6	54235	54240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527630
1090	NC_017060	GAT	2	6	54242	54247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527630
1091	NC_017060	ATG	2	6	54318	54323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527630
1092	NC_017060	GAT	3	9	54326	54334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527630
1093	NC_017060	CAG	2	6	54395	54400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527630
1094	NC_017060	GTA	2	6	54404	54409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527630
1095	NC_017060	GCC	2	6	54454	54459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527630
1096	NC_017060	TGC	2	6	54543	54548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527630
1097	NC_017060	TTC	2	6	54563	54568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527630
1098	NC_017060	GCG	2	6	54604	54609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527630
1099	NC_017060	GAA	2	6	54617	54622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527630
1100	NC_017060	ACG	2	6	54684	54689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527630
1101	NC_017060	CCAG	2	8	54727	54734	25 %	0 %	25 %	50 %	384527630
1102	NC_017060	CCAC	2	8	54804	54811	25 %	0 %	0 %	75 %	384527630
1103	NC_017060	ATG	4	12	54915	54926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527630
1104	NC_017060	GAA	2	6	54974	54979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527630
1105	NC_017060	GCC	2	6	54983	54988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527630
1106	NC_017060	GGC	2	6	55028	55033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527630
1107	NC_017060	AC	3	6	55102	55107	50 %	0 %	0 %	50 %	384527630
1108	NC_017060	TGC	2	6	55139	55144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527630
1109	NC_017060	T	6	6	55157	55162	0 %	100 %	0 %	0 %	384527630
1110	NC_017060	GTC	2	6	55172	55177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527630
1111	NC_017060	T	7	7	55217	55223	0 %	100 %	0 %	0 %	384527630
1112	NC_017060	ATC	2	6	55300	55305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017060	TAAT	2	8	55468	55475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017060	ACT	2	6	55508	55513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017060	AATTT	2	10	55549	55558	40 %	60 %	0 %	0 %	384527631
1116	NC_017060	CGC	2	6	55606	55611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527631
1117	NC_017060	TGTGT	2	10	55616	55625	0 %	60 %	40 %	0 %	384527631
1118	NC_017060	ATT	2	6	55633	55638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527631
1119	NC_017060	TGT	2	6	55675	55680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527631
1120	NC_017060	CTG	2	6	55716	55721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527631
1121	NC_017060	CT	3	6	55788	55793	0 %	50 %	0 %	50 %	384527631
1122	NC_017060	TAC	2	6	55812	55817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527631
1123	NC_017060	GAA	2	6	55890	55895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527631
1124	NC_017060	TGG	2	6	55942	55947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527631
1125	NC_017060	TGA	2	6	56120	56125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527631
1126	NC_017060	TGAA	2	8	56188	56195	50 %	25 %	25 %	0 %	384527631
1127	NC_017060	GCA	2	6	56200	56205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527631
1128	NC_017060	CA	3	6	56246	56251	50 %	0 %	0 %	50 %	384527631
1129	NC_017060	ATGT	2	8	56283	56290	25 %	50 %	25 %	0 %	384527631
1130	NC_017060	CCG	2	6	56324	56329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527631
1131	NC_017060	TGTC	2	8	56354	56361	0 %	50 %	25 %	25 %	384527631
1132	NC_017060	TGA	2	6	56362	56367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527631
1133	NC_017060	TGA	2	6	56389	56394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527631
1134	NC_017060	GCT	2	6	56411	56416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527631
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1143	NC_017060	GAA	2	6	56904	56909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527632
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1147	NC_017060	GT	3	6	56986	56991	0 %	50 %	50 %	0 %	384527632
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1151	NC_017060	A	6	6	57047	57052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1152	NC_017060	T	7	7	57072	57078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1159	NC_017060	GGT	2	6	57603	57608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527633
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1247	NC_017060	TGG	3	9	62158	62166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527637
1248	NC_017060	GAG	2	6	62187	62192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527637
1249	NC_017060	TG	3	6	62269	62274	0 %	50 %	50 %	0 %	384527637
1250	NC_017060	TGC	2	6	62407	62412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527637
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1253	NC_017060	TG	3	6	62587	62592	0 %	50 %	50 %	0 %	384527637
1254	NC_017060	CGG	2	6	62593	62598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527637
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1375	NC_017060	A	9	9	68717	68725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1376	NC_017060	GATT	2	8	68744	68751	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1377	NC_017060	GAA	2	6	68757	68762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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