MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017060	CCA	2	6	543240	543245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528083
11002	NC_017060	TGG	2	6	543268	543273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_017060	CAA	2	6	543349	543354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528084
11004	NC_017060	CAA	2	6	543394	543399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528084
11005	NC_017060	AGC	2	6	543480	543485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528084
11006	NC_017060	TCA	2	6	543610	543615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528084
11007	NC_017060	GGT	2	6	543634	543639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528084
11008	NC_017060	AAT	2	6	543704	543709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528084
11009	NC_017060	TTC	2	6	543710	543715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528084
11010	NC_017060	TGA	2	6	543738	543743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528084
11011	NC_017060	GCC	2	6	543861	543866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528084
11012	NC_017060	CCA	2	6	543934	543939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528084
11013	NC_017060	GAT	2	6	543968	543973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528084
11014	NC_017060	AGTC	2	8	543988	543995	25 %	25 %	25 %	25 %	384528084
11015	NC_017060	TGT	2	6	544034	544039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_017060	GGC	2	6	544093	544098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_017060	CAA	2	6	544101	544106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_017060	GCC	2	6	544127	544132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528085
11019	NC_017060	GATA	2	8	544138	544145	50 %	25 %	25 %	0 %	384528085
11020	NC_017060	TGA	2	6	544170	544175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528085
11021	NC_017060	CTG	2	6	544195	544200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528085
11022	NC_017060	GGC	2	6	544204	544209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_017060	TGA	2	6	544300	544305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_017060	CAT	2	6	544315	544320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_017060	TAA	2	6	544400	544405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_017060	A	6	6	544474	544479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_017060	CGAA	2	8	544487	544494	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11028	NC_017060	ATC	2	6	544504	544509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_017060	ATT	2	6	544678	544683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_017060	TTA	2	6	544688	544693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_017060	TGC	2	6	544787	544792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528086
11032	NC_017060	GC	4	8	544852	544859	0 %	0 %	50 %	50 %	384528086
11033	NC_017060	ACG	2	6	544915	544920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528086
11034	NC_017060	CTT	2	6	545000	545005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_017060	CTGT	2	8	545041	545048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11036	NC_017060	A	6	6	545049	545054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_017060	GCC	2	6	545082	545087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11038	NC_017060	TTTCAT	2	12	545166	545177	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11039	NC_017060	GC	3	6	545216	545221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11040	NC_017060	TAA	2	6	545231	545236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_017060	A	6	6	545301	545306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_017060	AT	3	6	545383	545388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_017060	CCCAAT	2	12	545432	545443	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
11044	NC_017060	GCA	2	6	545453	545458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_017060	ACA	2	6	545472	545477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_017060	GTT	2	6	545515	545520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_017060	CTG	2	6	545598	545603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528087
11048	NC_017060	ACG	2	6	545675	545680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528087
11049	NC_017060	TAT	2	6	545729	545734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528087
11050	NC_017060	TGC	2	6	545744	545749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528087
11051	NC_017060	TGGC	2	8	545759	545766	0 %	25 %	50 %	25 %	384528087
11052	NC_017060	TGG	2	6	545773	545778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528087
11053	NC_017060	GCA	2	6	545851	545856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528087
11054	NC_017060	CGC	2	6	545868	545873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528087
11055	NC_017060	GC	3	6	545938	545943	0 %	0 %	50 %	50 %	384528087
11056	NC_017060	AGC	2	6	545972	545977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528087
11057	NC_017060	CTTC	2	8	546084	546091	0 %	50 %	0 %	50 %	384528087
11058	NC_017060	GCG	2	6	546154	546159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528087
11059	NC_017060	CTG	2	6	546180	546185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528087
11060	NC_017060	GAA	2	6	546254	546259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528087
11061	NC_017060	GCGTT	2	10	546264	546273	0 %	40 %	40 %	20 %	384528087
11062	NC_017060	CGGG	2	8	546284	546291	0 %	0 %	75 %	25 %	384528087
11063	NC_017060	ACG	2	6	546378	546383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528088
11064	NC_017060	GAC	2	6	546429	546434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528088
11065	NC_017060	TCT	2	6	546446	546451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528088
11066	NC_017060	CG	3	6	546486	546491	0 %	0 %	50 %	50 %	384528088
11067	NC_017060	CGG	2	6	546498	546503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528088
11068	NC_017060	TAA	2	6	546544	546549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528088
11069	NC_017060	GGT	2	6	546562	546567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528088
11070	NC_017060	CAGC	2	8	546603	546610	25 %	0 %	25 %	50 %	384528088
11071	NC_017060	GC	3	6	546631	546636	0 %	0 %	50 %	50 %	384528088
11072	NC_017060	GTT	2	6	546682	546687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528088
11073	NC_017060	ATG	2	6	546830	546835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528088
11074	NC_017060	GAT	2	6	546840	546845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528088
11075	NC_017060	GAT	2	6	546868	546873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528088
11076	NC_017060	TGGT	2	8	546918	546925	0 %	50 %	50 %	0 %	384528088
11077	NC_017060	ATG	2	6	546931	546936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528088
11078	NC_017060	CAC	2	6	546937	546942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528088
11079	NC_017060	CAG	2	6	547048	547053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528088
11080	NC_017060	CCA	2	6	547065	547070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528088
11081	NC_017060	GC	3	6	547084	547089	0 %	0 %	50 %	50 %	384528088
11082	NC_017060	CCA	2	6	547113	547118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528088
11083	NC_017060	GAT	2	6	547126	547131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528088
11084	NC_017060	GGC	2	6	547216	547221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528088
11085	NC_017060	CCG	2	6	547242	547247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528088
11086	NC_017060	ATC	2	6	547261	547266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528088
11087	NC_017060	CTC	2	6	547282	547287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528088
11088	NC_017060	TGAA	2	8	547376	547383	50 %	25 %	25 %	0 %	384528088
11089	NC_017060	TCG	2	6	547451	547456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528088
11090	NC_017060	GCC	2	6	547567	547572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528088
11091	NC_017060	GCA	2	6	547653	547658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528088
11092	NC_017060	CGG	2	6	547709	547714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528088
11093	NC_017060	TA	3	6	547715	547720	50 %	50 %	0 %	0 %	384528088
11094	NC_017060	GCA	2	6	547770	547775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528088
11095	NC_017060	TTC	2	6	547777	547782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528088
11096	NC_017060	GCA	2	6	547932	547937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528088
11097	NC_017060	AGC	2	6	547994	547999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528088
11098	NC_017060	TAA	2	6	548011	548016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528088
11099	NC_017060	T	7	7	548047	548053	0 %	100 %	0 %	0 %	384528088
11100	NC_017060	CAT	2	6	548056	548061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528088
11101	NC_017060	AGC	2	6	548189	548194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_017060	GAT	2	6	548203	548208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_017060	TAT	2	6	548213	548218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_017060	T	6	6	548222	548227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_017060	T	6	6	548284	548289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_017060	TGA	2	6	548292	548297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_017060	TTA	2	6	548413	548418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_017060	ATT	2	6	548423	548428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_017060	TTA	2	6	548430	548435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_017060	ATG	2	6	548468	548473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_017060	ATA	2	6	548485	548490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_017060	TAAC	2	8	548491	548498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11113	NC_017060	TCA	2	6	548523	548528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_017060	AAT	2	6	548531	548536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_017060	ATT	2	6	548577	548582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528089
11116	NC_017060	TAT	2	6	548595	548600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528089
11117	NC_017060	GGCT	2	8	548608	548615	0 %	25 %	50 %	25 %	384528089
11118	NC_017060	TTG	2	6	548788	548793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528089
11119	NC_017060	GC	3	6	548888	548893	0 %	0 %	50 %	50 %	384528089
11120	NC_017060	TGA	2	6	548966	548971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528089
11121	NC_017060	GAT	2	6	549045	549050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528089
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11123	NC_017060	CTGG	2	8	549121	549128	0 %	25 %	50 %	25 %	384528089
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11224	NC_017060	GCCT	2	8	553191	553198	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11225	NC_017060	ATTA	2	8	553200	553207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11226	NC_017060	A	6	6	553252	553257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11231	NC_017060	ATT	2	6	553426	553431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11232	NC_017060	GTTAA	2	10	553468	553477	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11233	NC_017060	TTAA	2	8	553489	553496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11234	NC_017060	TAA	2	6	553503	553508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11235	NC_017060	AAT	2	6	553572	553577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11237	NC_017060	ATT	2	6	553657	553662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11238	NC_017060	ACCA	2	8	553669	553676	50 %	0 %	0 %	50 %	384528092
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11243	NC_017060	TTG	2	6	553835	553840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528092
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11489	NC_017060	TTG	2	6	565506	565511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528101
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11491	NC_017060	CAA	2	6	565573	565578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528101
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