MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017060	CGG	2	6	23556	23561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527606
502	NC_017060	GAA	2	6	23696	23701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527606
503	NC_017060	CG	3	6	23744	23749	0 %	0 %	50 %	50 %	384527606
504	NC_017060	GAT	2	6	23860	23865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527606
505	NC_017060	ATC	2	6	23928	23933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527606
506	NC_017060	CGG	2	6	23942	23947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527606
507	NC_017060	TCA	2	6	23974	23979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527606
508	NC_017060	TGC	2	6	23990	23995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527606
509	NC_017060	CTC	2	6	24002	24007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527606
510	NC_017060	CGG	2	6	24082	24087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527606
511	NC_017060	CCG	2	6	24154	24159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527606
512	NC_017060	CGT	2	6	24187	24192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527606
513	NC_017060	GCC	2	6	24209	24214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527606
514	NC_017060	CGC	2	6	24254	24259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527606
515	NC_017060	TGG	2	6	24322	24327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527606
516	NC_017060	TGAC	2	8	24344	24351	25 %	25 %	25 %	25 %	384527606
517	NC_017060	GTT	2	6	24555	24560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527607
518	NC_017060	GAC	2	6	24628	24633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527607
519	NC_017060	TTC	2	6	24673	24678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527607
520	NC_017060	GCCC	2	8	24717	24724	0 %	0 %	25 %	75 %	384527607
521	NC_017060	CAC	2	6	24751	24756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527607
522	NC_017060	CAGCGC	2	12	24808	24819	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384527607
523	NC_017060	CGA	2	6	24992	24997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527607
524	NC_017060	CGC	2	6	25059	25064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527607
525	NC_017060	TACCGA	2	12	25068	25079	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384527607
526	NC_017060	TGC	2	6	25118	25123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527607
527	NC_017060	GCA	2	6	25140	25145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527607
528	NC_017060	GCA	2	6	25254	25259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527607
529	NC_017060	GCT	2	6	25270	25275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527607
530	NC_017060	TCG	2	6	25290	25295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527607
531	NC_017060	GCA	2	6	25305	25310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527607
532	NC_017060	ATG	2	6	25316	25321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527607
533	NC_017060	CA	3	6	25365	25370	50 %	0 %	0 %	50 %	384527607
534	NC_017060	AC	3	6	25395	25400	50 %	0 %	0 %	50 %	384527607
535	NC_017060	TCT	2	6	25464	25469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527607
536	NC_017060	TCT	2	6	25487	25492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527607
537	NC_017060	AG	3	6	25510	25515	50 %	0 %	50 %	0 %	384527607
538	NC_017060	ACA	2	6	25518	25523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527607
539	NC_017060	CAT	2	6	25825	25830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527607
540	NC_017060	GAA	2	6	25852	25857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527607
541	NC_017060	CGG	3	9	25859	25867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527607
542	NC_017060	GA	3	6	25907	25912	50 %	0 %	50 %	0 %	384527607
543	NC_017060	GAT	2	6	25942	25947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527607
544	NC_017060	AGC	2	6	25979	25984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527607
545	NC_017060	CAG	2	6	26014	26019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527607
546	NC_017060	CCG	2	6	26063	26068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527607
547	NC_017060	TAAA	2	8	26088	26095	75 %	25 %	0 %	0 %	384527607
548	NC_017060	AG	3	6	26129	26134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017060	GTTTT	2	10	26156	26165	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017060	TA	3	6	26182	26187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017060	ATGA	2	8	26194	26201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017060	CAG	2	6	26230	26235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017060	GGC	2	6	26238	26243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_017060	G	6	6	26434	26439	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017060	TCA	2	6	26539	26544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527608
556	NC_017060	CAG	3	9	26808	26816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527608
557	NC_017060	AAC	2	6	26827	26832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527608
558	NC_017060	GCC	2	6	26898	26903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527608
559	NC_017060	TCC	2	6	26915	26920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527608
560	NC_017060	AGC	2	6	26959	26964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527608
561	NC_017060	TCC	2	6	26968	26973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527608
562	NC_017060	CAC	2	6	27030	27035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527608
563	NC_017060	CAG	2	6	27260	27265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527608
564	NC_017060	GCAC	2	8	27362	27369	25 %	0 %	25 %	50 %	384527608
565	NC_017060	AGA	2	6	27379	27384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527608
566	NC_017060	T	7	7	27410	27416	0 %	100 %	0 %	0 %	384527608
567	NC_017060	GT	3	6	27421	27426	0 %	50 %	50 %	0 %	384527608
568	NC_017060	AAT	2	6	27503	27508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017060	TGA	2	6	27652	27657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017060	CAT	2	6	27674	27679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017060	TGA	2	6	27746	27751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017060	CAG	2	6	27757	27762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_017060	TGA	2	6	27777	27782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527609
574	NC_017060	ATT	2	6	27785	27790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527609
575	NC_017060	ACT	2	6	27791	27796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527609
576	NC_017060	ACC	2	6	27854	27859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527609
577	NC_017060	CTA	2	6	27871	27876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527609
578	NC_017060	A	6	6	27880	27885	100 %	0 %	0 %	0 %	384527609
579	NC_017060	GCT	2	6	27910	27915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527609
580	NC_017060	CCA	2	6	27920	27925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527609
581	NC_017060	T	6	6	27946	27951	0 %	100 %	0 %	0 %	384527609
582	NC_017060	GTC	2	6	27978	27983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527609
583	NC_017060	TGC	2	6	27984	27989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527609
584	NC_017060	GGC	2	6	28012	28017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527609
585	NC_017060	AGA	2	6	28018	28023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527609
586	NC_017060	GTG	2	6	28041	28046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527609
587	NC_017060	CTG	2	6	28115	28120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527609
588	NC_017060	ACC	2	6	28223	28228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527609
589	NC_017060	CG	3	6	28411	28416	0 %	0 %	50 %	50 %	384527609
590	NC_017060	TCG	2	6	28419	28424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527609
591	NC_017060	AGT	2	6	28432	28437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527609
592	NC_017060	AGA	2	6	28489	28494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527609
593	NC_017060	AGC	2	6	28503	28508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527609
594	NC_017060	TC	3	6	28575	28580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_017060	T	6	6	28607	28612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017060	ACT	2	6	28729	28734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527610
597	NC_017060	TCA	2	6	28849	28854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527610
598	NC_017060	CCA	2	6	28914	28919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527610
599	NC_017060	GGA	2	6	28975	28980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527610
600	NC_017060	GCGT	2	8	29007	29014	0 %	25 %	50 %	25 %	384527610
601	NC_017060	GAT	2	6	29188	29193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527611
602	NC_017060	CA	3	6	29297	29302	50 %	0 %	0 %	50 %	384527611
603	NC_017060	TTG	2	6	29361	29366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527611
604	NC_017060	GAT	2	6	29477	29482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527611
605	NC_017060	GTT	2	6	29611	29616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527611
606	NC_017060	TTTTTA	2	12	29734	29745	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384527612
607	NC_017060	TAC	2	6	29751	29756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527612
608	NC_017060	CTG	2	6	29757	29762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527612
609	NC_017060	GGCT	2	8	29775	29782	0 %	25 %	50 %	25 %	384527612
610	NC_017060	GATT	2	8	29783	29790	25 %	50 %	25 %	0 %	384527612
611	NC_017060	ATT	2	6	29821	29826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527612
612	NC_017060	TGA	2	6	29836	29841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527612
613	NC_017060	C	7	7	29857	29863	0 %	0 %	0 %	100 %	384527612
614	NC_017060	GAT	2	6	29880	29885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527612
615	NC_017060	TTG	2	6	29928	29933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527612
616	NC_017060	AGGC	2	8	29962	29969	25 %	0 %	50 %	25 %	384527612
617	NC_017060	TTAT	2	8	30054	30061	25 %	75 %	0 %	0 %	384527613
618	NC_017060	GTT	2	6	30089	30094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527613
619	NC_017060	TCA	2	6	30175	30180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527613
620	NC_017060	CTG	2	6	30246	30251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527613
621	NC_017060	CAC	2	6	30252	30257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527613
622	NC_017060	TTGA	2	8	30264	30271	25 %	50 %	25 %	0 %	384527613
623	NC_017060	GC	3	6	30275	30280	0 %	0 %	50 %	50 %	384527613
624	NC_017060	GCCC	2	8	30401	30408	0 %	0 %	25 %	75 %	384527613
625	NC_017060	CCG	2	6	30415	30420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527613
626	NC_017060	AAT	2	6	30426	30431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527613
627	NC_017060	CGCTT	2	10	30492	30501	0 %	40 %	20 %	40 %	384527613
628	NC_017060	ACC	2	6	30589	30594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527613
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