MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017060	CGC	2	6	299226	299231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527865
6002	NC_017060	T	7	7	299275	299281	0 %	100 %	0 %	0 %	384527865
6003	NC_017060	CAT	2	6	299308	299313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527865
6004	NC_017060	CA	3	6	299365	299370	50 %	0 %	0 %	50 %	384527865
6005	NC_017060	CGT	2	6	299418	299423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527865
6006	NC_017060	CGG	2	6	299445	299450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527865
6007	NC_017060	GCG	2	6	299457	299462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527865
6008	NC_017060	GAC	2	6	299573	299578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527865
6009	NC_017060	GCT	2	6	299645	299650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527865
6010	NC_017060	ATC	2	6	299705	299710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527865
6011	NC_017060	GCTG	2	8	299731	299738	0 %	25 %	50 %	25 %	384527865
6012	NC_017060	T	6	6	299752	299757	0 %	100 %	0 %	0 %	384527865
6013	NC_017060	TCA	2	6	299773	299778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527865
6014	NC_017060	CACCGG	2	12	299876	299887	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384527865
6015	NC_017060	TGG	2	6	300003	300008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527865
6016	NC_017060	CGG	2	6	300013	300018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527865
6017	NC_017060	TAA	2	6	300019	300024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527865
6018	NC_017060	GATCT	2	10	300026	300035	20 %	40 %	20 %	20 %	384527865
6019	NC_017060	AAT	2	6	300067	300072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527865
6020	NC_017060	CCA	2	6	300102	300107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527865
6021	NC_017060	GAC	2	6	300139	300144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527865
6022	NC_017060	CAG	2	6	300254	300259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527865
6023	NC_017060	CAGC	2	8	300421	300428	25 %	0 %	25 %	50 %	384527865
6024	NC_017060	TGT	2	6	300519	300524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527865
6025	NC_017060	GCCGG	2	10	300554	300563	0 %	0 %	60 %	40 %	384527865
6026	NC_017060	AAAT	2	8	300633	300640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_017060	A	6	6	300677	300682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_017060	AAG	2	6	300797	300802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527866
6029	NC_017060	CGC	2	6	300806	300811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527866
6030	NC_017060	GTG	2	6	300812	300817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527866
6031	NC_017060	TG	3	6	300827	300832	0 %	50 %	50 %	0 %	384527866
6032	NC_017060	CGGG	2	8	300879	300886	0 %	0 %	75 %	25 %	384527866
6033	NC_017060	CA	4	8	300981	300988	50 %	0 %	0 %	50 %	384527866
6034	NC_017060	TTC	2	6	301081	301086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527866
6035	NC_017060	CAT	2	6	301152	301157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527866
6036	NC_017060	GCT	2	6	301188	301193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527866
6037	NC_017060	AGT	2	6	301215	301220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527866
6038	NC_017060	CAC	2	6	301296	301301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527866
6039	NC_017060	CGC	2	6	301349	301354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527866
6040	NC_017060	TGC	2	6	301362	301367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527866
6041	NC_017060	TGA	2	6	301466	301471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527866
6042	NC_017060	CGA	2	6	301476	301481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527866
6043	NC_017060	CGG	3	9	301575	301583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527866
6044	NC_017060	GC	3	6	301608	301613	0 %	0 %	50 %	50 %	384527866
6045	NC_017060	GGC	2	6	301639	301644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527866
6046	NC_017060	ATC	2	6	301705	301710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527866
6047	NC_017060	GAA	3	9	301711	301719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527866
6048	NC_017060	GC	3	6	301731	301736	0 %	0 %	50 %	50 %	384527866
6049	NC_017060	CTGA	2	8	301756	301763	25 %	25 %	25 %	25 %	384527866
6050	NC_017060	TGG	2	6	301799	301804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527866
6051	NC_017060	TGG	2	6	301826	301831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527866
6052	NC_017060	CTT	2	6	301865	301870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527866
6053	NC_017060	AAG	2	6	301994	301999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527866
6054	NC_017060	GCTG	2	8	302022	302029	0 %	25 %	50 %	25 %	384527866
6055	NC_017060	CAGA	2	8	302070	302077	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6056	NC_017060	AAT	2	6	302104	302109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_017060	A	7	7	302134	302140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_017060	CCGC	2	8	302167	302174	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6059	NC_017060	ATG	2	6	302236	302241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_017060	CAT	2	6	302242	302247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_017060	TCAGGC	2	12	302359	302370	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384527867
6062	NC_017060	TGG	2	6	302395	302400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527867
6063	NC_017060	GCA	2	6	302447	302452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527867
6064	NC_017060	GC	3	6	302495	302500	0 %	0 %	50 %	50 %	384527867
6065	NC_017060	CGT	2	6	302539	302544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527867
6066	NC_017060	TGA	2	6	302578	302583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527867
6067	NC_017060	CTGGA	2	10	302600	302609	20 %	20 %	40 %	20 %	384527867
6068	NC_017060	A	6	6	302714	302719	100 %	0 %	0 %	0 %	384527867
6069	NC_017060	A	6	6	302888	302893	100 %	0 %	0 %	0 %	384527867
6070	NC_017060	GATCA	2	10	302897	302906	40 %	20 %	20 %	20 %	384527867
6071	NC_017060	GTG	2	6	302920	302925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527867
6072	NC_017060	ACA	2	6	303045	303050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527867
6073	NC_017060	CAA	2	6	303130	303135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527867
6074	NC_017060	CCGA	2	8	303179	303186	25 %	0 %	25 %	50 %	384527867
6075	NC_017060	CTG	2	6	303237	303242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527867
6076	NC_017060	TCT	2	6	303329	303334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527867
6077	NC_017060	AGT	2	6	303336	303341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527867
6078	NC_017060	CGC	2	6	303433	303438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6079	NC_017060	TGC	2	6	303441	303446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_017060	CAG	2	6	303554	303559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527868
6081	NC_017060	GCG	2	6	303598	303603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527868
6082	NC_017060	CGT	2	6	303610	303615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527868
6083	NC_017060	CGC	2	6	303632	303637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527868
6084	NC_017060	TGTT	2	8	303644	303651	0 %	75 %	25 %	0 %	384527868
6085	NC_017060	GCA	2	6	303821	303826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527868
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6087	NC_017060	TATT	2	8	304024	304031	25 %	75 %	0 %	0 %	384527868
6088	NC_017060	TGC	3	9	304112	304120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527868
6089	NC_017060	TGG	2	6	304139	304144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527868
6090	NC_017060	TGC	2	6	304153	304158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527868
6091	NC_017060	CTGG	2	8	304185	304192	0 %	25 %	50 %	25 %	384527868
6092	NC_017060	AAC	2	6	304196	304201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527868
6093	NC_017060	CG	3	6	304210	304215	0 %	0 %	50 %	50 %	384527868
6094	NC_017060	TGA	2	6	304223	304228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527868
6095	NC_017060	TGC	2	6	304238	304243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527868
6096	NC_017060	CGT	2	6	304253	304258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527868
6097	NC_017060	CAGC	2	8	304271	304278	25 %	0 %	25 %	50 %	384527868
6098	NC_017060	GGC	2	6	304300	304305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527868
6099	NC_017060	CG	3	6	304315	304320	0 %	0 %	50 %	50 %	384527868
6100	NC_017060	CAT	2	6	304398	304403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527868
6101	NC_017060	TCCT	2	8	304418	304425	0 %	50 %	0 %	50 %	384527868
6102	NC_017060	TGA	2	6	304436	304441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527868
6103	NC_017060	CGC	2	6	304467	304472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527868
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6105	NC_017060	TAC	2	6	304582	304587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527868
6106	NC_017060	CAGT	2	8	304692	304699	25 %	25 %	25 %	25 %	384527868
6107	NC_017060	TGC	2	6	304715	304720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527868
6108	NC_017060	GCG	2	6	304860	304865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527869
6109	NC_017060	CTG	2	6	304869	304874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527869
6110	NC_017060	ATC	2	6	304896	304901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527869
6111	NC_017060	CGCTG	2	10	304957	304966	0 %	20 %	40 %	40 %	384527869
6112	NC_017060	AATG	2	8	304989	304996	50 %	25 %	25 %	0 %	384527869
6113	NC_017060	CTG	2	6	305019	305024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527869
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6117	NC_017060	CGC	3	9	305309	305317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527869
6118	NC_017060	GTTTGC	2	12	305399	305410	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384527869
6119	NC_017060	CGA	2	6	305420	305425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527869
6120	NC_017060	GTG	3	9	305427	305435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527869
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6122	NC_017060	GCG	4	12	305520	305531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527869
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6494	NC_017060	GCA	3	9	324308	324316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527886
6495	NC_017060	T	6	6	324351	324356	0 %	100 %	0 %	0 %	384527886
6496	NC_017060	GGC	2	6	324374	324379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527886
6497	NC_017060	GCG	2	6	324380	324385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527886
6498	NC_017060	AAT	2	6	324458	324463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527886
6499	NC_017060	CCAGT	2	10	324467	324476	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6500	NC_017060	CA	3	6	324491	324496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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