MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017060	GCCAGC	2	12	272300	272311	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384527843
5502	NC_017060	ATG	2	6	272354	272359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527843
5503	NC_017060	TGCG	2	8	272435	272442	0 %	25 %	50 %	25 %	384527844
5504	NC_017060	CGC	2	6	272608	272613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527844
5505	NC_017060	GCG	2	6	272624	272629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527844
5506	NC_017060	CGT	2	6	272632	272637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527844
5507	NC_017060	CAC	2	6	272860	272865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527844
5508	NC_017060	CAC	2	6	272873	272878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527844
5509	NC_017060	GCAC	2	8	272947	272954	25 %	0 %	25 %	50 %	384527844
5510	NC_017060	GGT	2	6	273053	273058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527844
5511	NC_017060	GC	4	8	273100	273107	0 %	0 %	50 %	50 %	384527844
5512	NC_017060	AGC	2	6	273108	273113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527844
5513	NC_017060	TGA	2	6	273117	273122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527844
5514	NC_017060	CA	3	6	273211	273216	50 %	0 %	0 %	50 %	384527844
5515	NC_017060	GCG	2	6	273244	273249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527844
5516	NC_017060	CGA	2	6	273250	273255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527844
5517	NC_017060	CGT	2	6	273277	273282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527844
5518	NC_017060	CG	3	6	273365	273370	0 %	0 %	50 %	50 %	384527845
5519	NC_017060	GCG	2	6	273390	273395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527845
5520	NC_017060	CGC	2	6	273600	273605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527845
5521	NC_017060	GCAG	2	8	273619	273626	25 %	0 %	50 %	25 %	384527845
5522	NC_017060	TG	3	6	273630	273635	0 %	50 %	50 %	0 %	384527845
5523	NC_017060	TGCG	2	8	273665	273672	0 %	25 %	50 %	25 %	384527845
5524	NC_017060	ATA	2	6	273677	273682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527845
5525	NC_017060	ACA	2	6	273684	273689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527845
5526	NC_017060	CCGG	2	8	273691	273698	0 %	0 %	50 %	50 %	384527845
5527	NC_017060	CAGG	2	8	273759	273766	25 %	0 %	50 %	25 %	384527845
5528	NC_017060	AAT	2	6	273846	273851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527845
5529	NC_017060	AGCG	2	8	273927	273934	25 %	0 %	50 %	25 %	384527845
5530	NC_017060	TGG	3	9	273957	273965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527845
5531	NC_017060	GTT	2	6	274035	274040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527845
5532	NC_017060	GCG	2	6	274077	274082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527845
5533	NC_017060	GCC	2	6	274150	274155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527845
5534	NC_017060	AC	3	6	274185	274190	50 %	0 %	0 %	50 %	384527845
5535	NC_017060	AAG	2	6	274197	274202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527845
5536	NC_017060	TC	4	8	274211	274218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5537	NC_017060	ACT	2	6	274228	274233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_017060	TACT	2	8	274297	274304	25 %	50 %	0 %	25 %	384527846
5539	NC_017060	TCG	2	6	274469	274474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527846
5540	NC_017060	GCA	2	6	274491	274496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527846
5541	NC_017060	CCG	2	6	274544	274549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527846
5542	NC_017060	CGC	2	6	274609	274614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527846
5543	NC_017060	ACG	2	6	274682	274687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527846
5544	NC_017060	ATG	2	6	274922	274927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527846
5545	NC_017060	T	6	6	274984	274989	0 %	100 %	0 %	0 %	384527846
5546	NC_017060	TGC	2	6	274998	275003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527846
5547	NC_017060	CCCG	2	8	275115	275122	0 %	0 %	25 %	75 %	384527846
5548	NC_017060	GCC	2	6	275171	275176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527846
5549	NC_017060	ACG	2	6	275264	275269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527846
5550	NC_017060	GCCGG	2	10	275361	275370	0 %	0 %	60 %	40 %	384527846
5551	NC_017060	GTT	2	6	275392	275397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527846
5552	NC_017060	TAA	2	6	275401	275406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527846
5553	NC_017060	T	6	6	275504	275509	0 %	100 %	0 %	0 %	384527846
5554	NC_017060	GGT	2	6	275608	275613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527846
5555	NC_017060	TGA	2	6	275619	275624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527846
5556	NC_017060	TGT	2	6	275657	275662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527846
5557	NC_017060	AT	3	6	275691	275696	50 %	50 %	0 %	0 %	384527846
5558	NC_017060	GC	3	6	275698	275703	0 %	0 %	50 %	50 %	384527846
5559	NC_017060	CCG	2	6	275720	275725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527846
5560	NC_017060	CAG	2	6	275781	275786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527846
5561	NC_017060	TCAT	2	8	275856	275863	25 %	50 %	0 %	25 %	384527846
5562	NC_017060	ATT	2	6	275874	275879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017060	CCG	3	9	276061	276069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527847
5564	NC_017060	ATG	2	6	276075	276080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527847
5565	NC_017060	GACG	2	8	276156	276163	25 %	0 %	50 %	25 %	384527847
5566	NC_017060	CG	3	6	276175	276180	0 %	0 %	50 %	50 %	384527847
5567	NC_017060	CGA	2	6	276251	276256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527847
5568	NC_017060	GCG	2	6	276300	276305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527847
5569	NC_017060	GCC	2	6	276335	276340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527847
5570	NC_017060	ACG	2	6	276390	276395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527847
5571	NC_017060	ACG	2	6	276427	276432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527847
5572	NC_017060	TGCCGT	2	12	276497	276508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527847
5573	NC_017060	CAC	2	6	276514	276519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527847
5574	NC_017060	TAT	2	6	276578	276583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527847
5575	NC_017060	CGC	2	6	276598	276603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527847
5576	NC_017060	TGA	2	6	276625	276630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527847
5577	NC_017060	GCC	2	6	276631	276636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527847
5578	NC_017060	TA	3	6	276643	276648	50 %	50 %	0 %	0 %	384527847
5579	NC_017060	TTG	2	6	276680	276685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527847
5580	NC_017060	TG	3	6	276684	276689	0 %	50 %	50 %	0 %	384527847
5581	NC_017060	AAT	2	6	276699	276704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527847
5582	NC_017060	GTG	2	6	276717	276722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527847
5583	NC_017060	TCA	2	6	276727	276732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527847
5584	NC_017060	CGC	2	6	276811	276816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527847
5585	NC_017060	TGG	2	6	276835	276840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527847
5586	NC_017060	TTTAT	2	10	277041	277050	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_017060	ATAA	2	8	277082	277089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_017060	TAATC	2	10	277090	277099	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5589	NC_017060	TAA	2	6	277102	277107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_017060	TAA	2	6	277196	277201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_017060	GGT	2	6	277204	277209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_017060	TCA	2	6	277230	277235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_017060	CAA	3	9	277289	277297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_017060	CTC	2	6	277315	277320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_017060	GTC	2	6	277342	277347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527848
5596	NC_017060	GGT	2	6	277369	277374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527848
5597	NC_017060	AGG	2	6	277392	277397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527848
5598	NC_017060	CTG	2	6	277411	277416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527848
5599	NC_017060	CCG	2	6	277439	277444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527848
5600	NC_017060	TAT	2	6	277506	277511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527848
5601	NC_017060	TGG	2	6	277589	277594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527848
5602	NC_017060	CG	3	6	277621	277626	0 %	0 %	50 %	50 %	384527848
5603	NC_017060	TGG	2	6	277631	277636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527848
5604	NC_017060	GGC	2	6	277662	277667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527848
5605	NC_017060	ATC	2	6	277723	277728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527848
5606	NC_017060	GCAGA	2	10	277774	277783	40 %	0 %	40 %	20 %	384527848
5607	NC_017060	TGC	2	6	277827	277832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527848
5608	NC_017060	GATCA	2	10	277837	277846	40 %	20 %	20 %	20 %	384527848
5609	NC_017060	CGC	2	6	277940	277945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527848
5610	NC_017060	TG	3	6	277968	277973	0 %	50 %	50 %	0 %	384527848
5611	NC_017060	GCGCC	2	10	278096	278105	0 %	0 %	40 %	60 %	384527848
5612	NC_017060	GCA	2	6	278116	278121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527848
5613	NC_017060	GCC	2	6	278128	278133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527848
5614	NC_017060	CTG	3	9	278138	278146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527848
5615	NC_017060	GCCA	2	8	278184	278191	25 %	0 %	25 %	50 %	384527848
5616	NC_017060	CTG	2	6	278210	278215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527848
5617	NC_017060	CGG	2	6	278220	278225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527848
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5619	NC_017060	CTA	2	6	278379	278384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527848
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5621	NC_017060	CGG	2	6	278670	278675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527848
5622	NC_017060	TTC	2	6	278706	278711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527848
5623	NC_017060	TGT	2	6	278712	278717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527848
5624	NC_017060	ACC	2	6	278761	278766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527848
5625	NC_017060	GCT	2	6	278805	278810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527848
5626	NC_017060	GCA	2	6	278837	278842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527848
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5634	NC_017060	CTG	2	6	279535	279540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527848
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5640	NC_017060	T	8	8	279808	279815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5643	NC_017060	TCA	2	6	279954	279959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527849
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5668	NC_017060	TCC	2	6	281381	281386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5671	NC_017060	CCT	2	6	281540	281545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5672	NC_017060	CACG	2	8	281565	281572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5673	NC_017060	A	7	7	281587	281593	100 %	0 %	0 %	0 %	384527851
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5682	NC_017060	TGCC	2	8	281993	282000	0 %	25 %	25 %	50 %	384527851
5683	NC_017060	AGA	2	6	282023	282028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527851
5684	NC_017060	CATTC	2	10	282037	282046	20 %	40 %	0 %	40 %	384527851
5685	NC_017060	A	6	6	282145	282150	100 %	0 %	0 %	0 %	384527851
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5689	NC_017060	TGT	2	6	282300	282305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5690	NC_017060	GGC	2	6	282334	282339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527852
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5693	NC_017060	CTG	2	6	282473	282478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527852
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5719	NC_017060	AAT	2	6	283783	283788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5720	NC_017060	T	6	6	283792	283797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5721	NC_017060	AAT	2	6	283825	283830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527853
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5734	NC_017060	ACCG	2	8	284428	284435	25 %	0 %	25 %	50 %	384527853
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5743	NC_017060	GCG	2	6	284915	284920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527853
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5994	NC_017060	TTA	2	6	298909	298914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5995	NC_017060	T	6	6	298951	298956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5996	NC_017060	A	6	6	298970	298975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5997	NC_017060	GA	3	6	298983	298988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5998	NC_017060	TTATTT	2	12	299016	299027	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5999	NC_017060	CAC	2	6	299125	299130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527865
6000	NC_017060	TCT	2	6	299187	299192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527865

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