MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017060	AGA	2	6	249171	249176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527822
5003	NC_017060	GCA	2	6	249207	249212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527822
5004	NC_017060	TGG	2	6	249257	249262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527822
5005	NC_017060	CAC	2	6	249279	249284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527822
5006	NC_017060	CTG	2	6	249292	249297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527822
5007	NC_017060	CAG	2	6	249379	249384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527822
5008	NC_017060	CAG	2	6	249418	249423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527822
5009	NC_017060	GCC	2	6	249440	249445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527822
5010	NC_017060	CTGG	2	8	249516	249523	0 %	25 %	50 %	25 %	384527822
5011	NC_017060	GCTTT	2	10	249557	249566	0 %	60 %	20 %	20 %	384527822
5012	NC_017060	ACTT	2	8	249596	249603	25 %	50 %	0 %	25 %	384527822
5013	NC_017060	TCA	2	6	249685	249690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527823
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5015	NC_017060	CGC	2	6	249760	249765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527823
5016	NC_017060	TCAG	2	8	249780	249787	25 %	25 %	25 %	25 %	384527823
5017	NC_017060	GGC	2	6	249829	249834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527823
5018	NC_017060	TGC	2	6	249858	249863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527823
5019	NC_017060	GCG	2	6	250025	250030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527823
5020	NC_017060	CTGC	2	8	250057	250064	0 %	25 %	25 %	50 %	384527823
5021	NC_017060	A	6	6	250104	250109	100 %	0 %	0 %	0 %	384527823
5022	NC_017060	GC	3	6	250136	250141	0 %	0 %	50 %	50 %	384527823
5023	NC_017060	TGCC	2	8	250159	250166	0 %	25 %	25 %	50 %	384527823
5024	NC_017060	TCTG	2	8	250167	250174	0 %	50 %	25 %	25 %	384527823
5025	NC_017060	GCG	2	6	250376	250381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527823
5026	NC_017060	CTG	2	6	250427	250432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527823
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5029	NC_017060	GCTG	2	8	250626	250633	0 %	25 %	50 %	25 %	384527824
5030	NC_017060	GCA	2	6	250671	250676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527824
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5033	NC_017060	ATT	2	6	250717	250722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527824
5034	NC_017060	CTGC	2	8	250735	250742	0 %	25 %	25 %	50 %	384527824
5035	NC_017060	ACG	2	6	250749	250754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527824
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5038	NC_017060	CTG	2	6	250861	250866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527824
5039	NC_017060	GT	3	6	250902	250907	0 %	50 %	50 %	0 %	384527824
5040	NC_017060	CTG	2	6	250912	250917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527824
5041	NC_017060	TG	4	8	250992	250999	0 %	50 %	50 %	0 %	384527824
5042	NC_017060	GCG	2	6	251015	251020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527824
5043	NC_017060	TCA	2	6	251052	251057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527824
5044	NC_017060	GGC	3	9	251222	251230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527824
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5048	NC_017060	GCCA	3	12	251342	251353	25 %	0 %	25 %	50 %	384527824
5049	NC_017060	CGG	2	6	251373	251378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527824
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5051	NC_017060	T	6	6	251455	251460	0 %	100 %	0 %	0 %	384527825
5052	NC_017060	GTC	2	6	251520	251525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527825
5053	NC_017060	TGC	3	9	251568	251576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527825
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5059	NC_017060	GCT	2	6	251803	251808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527825
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5106	NC_017060	CAGG	2	8	253685	253692	25 %	0 %	50 %	25 %	384527826
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5122	NC_017060	CTTC	2	8	254699	254706	0 %	50 %	0 %	50 %	384527828
5123	NC_017060	TCT	2	6	254749	254754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527828
5124	NC_017060	GCCA	2	8	254755	254762	25 %	0 %	25 %	50 %	384527828
5125	NC_017060	CTG	2	6	254763	254768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527828
5126	NC_017060	TCA	2	6	254770	254775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527828
5127	NC_017060	CGG	2	6	254788	254793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527828
5128	NC_017060	T	6	6	254802	254807	0 %	100 %	0 %	0 %	384527828
5129	NC_017060	CGC	2	6	254874	254879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527828
5130	NC_017060	CAGC	2	8	255009	255016	25 %	0 %	25 %	50 %	384527828
5131	NC_017060	CTG	2	6	255024	255029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527828
5132	NC_017060	GCA	2	6	255032	255037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527828
5133	NC_017060	TTCAG	2	10	255094	255103	20 %	40 %	20 %	20 %	384527828
5134	NC_017060	TGG	2	6	255240	255245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527829
5135	NC_017060	AACA	2	8	255256	255263	75 %	0 %	0 %	25 %	384527829
5136	NC_017060	ACAG	2	8	255312	255319	50 %	0 %	25 %	25 %	384527829
5137	NC_017060	TCT	2	6	255326	255331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527829
5138	NC_017060	AC	3	6	255343	255348	50 %	0 %	0 %	50 %	384527829
5139	NC_017060	GCG	2	6	255441	255446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527829
5140	NC_017060	ACA	2	6	255480	255485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527829
5141	NC_017060	GGC	2	6	255505	255510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527829
5142	NC_017060	G	8	8	255532	255539	0 %	0 %	100 %	0 %	384527829
5143	NC_017060	CTG	2	6	255563	255568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527829
5144	NC_017060	GGC	2	6	255648	255653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527829
5145	NC_017060	TGC	2	6	255659	255664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527829
5146	NC_017060	GCA	2	6	255729	255734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527829
5147	NC_017060	TTC	2	6	255754	255759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527829
5148	NC_017060	GCA	2	6	255765	255770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527829
5149	NC_017060	GTC	2	6	255772	255777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527829
5150	NC_017060	CCA	2	6	255816	255821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527829
5151	NC_017060	CAA	2	6	255904	255909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527829
5152	NC_017060	CAT	2	6	255984	255989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527829
5153	NC_017060	GCA	2	6	256059	256064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527829
5154	NC_017060	TGC	2	6	256082	256087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527829
5155	NC_017060	TGGCGG	2	12	256088	256099	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384527829
5156	NC_017060	AG	3	6	256311	256316	50 %	0 %	50 %	0 %	384527829
5157	NC_017060	CTG	2	6	256318	256323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527829
5158	NC_017060	CAG	3	9	256336	256344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527829
5159	NC_017060	CAA	2	6	256350	256355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527829
5160	NC_017060	C	6	6	256358	256363	0 %	0 %	0 %	100 %	384527829
5161	NC_017060	GTC	2	6	256447	256452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527830
5162	NC_017060	TTC	2	6	256541	256546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527830
5163	NC_017060	GGC	3	9	256626	256634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527830
5164	NC_017060	TAT	2	6	256660	256665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527830
5165	NC_017060	CGC	2	6	256681	256686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527830
5166	NC_017060	ATA	2	6	256762	256767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527830
5167	NC_017060	GGTTTA	2	12	256770	256781	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384527830
5168	NC_017060	GCG	2	6	256852	256857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527830
5169	NC_017060	TGG	2	6	256942	256947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527830
5170	NC_017060	ATG	2	6	256953	256958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527830
5171	NC_017060	TG	3	6	256965	256970	0 %	50 %	50 %	0 %	384527830
5172	NC_017060	TGA	2	6	256982	256987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527830
5173	NC_017060	TTC	2	6	257009	257014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527830
5174	NC_017060	CTG	2	6	257036	257041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527830
5175	NC_017060	AAT	2	6	257073	257078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527830
5176	NC_017060	AAC	2	6	257169	257174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527830
5177	NC_017060	CAA	2	6	257203	257208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527830
5178	NC_017060	CGG	2	6	257220	257225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527830
5179	NC_017060	CCA	2	6	257320	257325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527830
5180	NC_017060	CATT	2	8	257364	257371	25 %	50 %	0 %	25 %	384527830
5181	NC_017060	CAG	2	6	257399	257404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527830
5182	NC_017060	TCT	2	6	257412	257417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527830
5183	NC_017060	CGTT	2	8	257484	257491	0 %	50 %	25 %	25 %	384527830
5184	NC_017060	CCG	2	6	257515	257520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527830
5185	NC_017060	GAT	2	6	257543	257548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527830
5186	NC_017060	CGG	2	6	257578	257583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527830
5187	NC_017060	TCA	2	6	257592	257597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527830
5188	NC_017060	T	7	7	257600	257606	0 %	100 %	0 %	0 %	384527830
5189	NC_017060	CAG	2	6	257615	257620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527830
5190	NC_017060	GTG	2	6	257643	257648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527830
5191	NC_017060	CGTCA	2	10	257735	257744	20 %	20 %	20 %	40 %	384527830
5192	NC_017060	AGC	2	6	257760	257765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527830
5193	NC_017060	TCA	3	9	257793	257801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527830
5194	NC_017060	T	8	8	257816	257823	0 %	100 %	0 %	0 %	384527830
5195	NC_017060	GCC	2	6	257848	257853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5196	NC_017060	ATT	2	6	257877	257882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527831
5197	NC_017060	AGG	2	6	257997	258002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527831
5198	NC_017060	AAG	2	6	258044	258049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527831
5199	NC_017060	AAT	2	6	258080	258085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527831
5200	NC_017060	AGCATC	2	12	258101	258112	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384527831
5201	NC_017060	TTGA	2	8	258172	258179	25 %	50 %	25 %	0 %	384527831
5202	NC_017060	GCC	2	6	258212	258217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527831
5203	NC_017060	GACCA	2	10	258229	258238	40 %	0 %	20 %	40 %	384527831
5204	NC_017060	AAC	2	6	258239	258244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527831
5205	NC_017060	CGG	2	6	258273	258278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527831
5206	NC_017060	CGC	2	6	258412	258417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527831
5207	NC_017060	AGCG	2	8	258431	258438	25 %	0 %	50 %	25 %	384527831
5208	NC_017060	GGCC	2	8	258473	258480	0 %	0 %	50 %	50 %	384527831
5209	NC_017060	ATGA	2	8	258481	258488	50 %	25 %	25 %	0 %	384527831
5210	NC_017060	CAC	2	6	258496	258501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527831
5211	NC_017060	ATC	2	6	258526	258531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527831
5212	NC_017060	ACC	3	9	258608	258616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527831
5213	NC_017060	CTG	2	6	258641	258646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527831
5214	NC_017060	CAT	2	6	258711	258716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527831
5215	NC_017060	TGT	2	6	258747	258752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527831
5216	NC_017060	TGG	2	6	258807	258812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527831
5217	NC_017060	T	6	6	258822	258827	0 %	100 %	0 %	0 %	384527831
5218	NC_017060	CAT	2	6	258888	258893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527831
5219	NC_017060	CAG	2	6	258982	258987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527831
5220	NC_017060	CAG	2	6	258991	258996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527831
5221	NC_017060	CTGC	2	8	259061	259068	0 %	25 %	25 %	50 %	384527831
5222	NC_017060	GC	3	6	259080	259085	0 %	0 %	50 %	50 %	384527831
5223	NC_017060	ATG	2	6	259169	259174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527831
5224	NC_017060	CCA	2	6	259222	259227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527831
5225	NC_017060	GGC	2	6	259288	259293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527831
5226	NC_017060	GAT	2	6	259306	259311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527831
5227	NC_017060	AAAT	2	8	259326	259333	75 %	25 %	0 %	0 %	384527831
5228	NC_017060	CAT	2	6	259345	259350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527831
5229	NC_017060	GAC	2	6	259362	259367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527831
5230	NC_017060	CCAGCA	2	12	259458	259469	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384527831
5231	NC_017060	GC	3	6	259654	259659	0 %	0 %	50 %	50 %	384527831
5232	NC_017060	GAAA	2	8	259737	259744	75 %	0 %	25 %	0 %	384527831
5233	NC_017060	GT	3	6	259784	259789	0 %	50 %	50 %	0 %	384527831
5234	NC_017060	GCA	2	6	259832	259837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527831
5235	NC_017060	AGT	2	6	259839	259844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527831
5236	NC_017060	GCG	2	6	260166	260171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527831
5237	NC_017060	ATG	2	6	260177	260182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527831
5238	NC_017060	CGA	2	6	260356	260361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527832
5239	NC_017060	TGC	2	6	260383	260388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527832
5240	NC_017060	CCT	2	6	260443	260448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527832
5241	NC_017060	CGGT	2	8	260506	260513	0 %	25 %	50 %	25 %	384527832
5242	NC_017060	ATG	2	6	260526	260531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527832
5243	NC_017060	GCT	3	9	260569	260577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527832
5244	NC_017060	CCG	2	6	260580	260585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527832
5245	NC_017060	CT	3	6	260650	260655	0 %	50 %	0 %	50 %	384527832
5246	NC_017060	TGA	2	6	260731	260736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527832
5247	NC_017060	GCT	2	6	260788	260793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527832
5248	NC_017060	AGC	2	6	260874	260879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527832
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5250	NC_017060	A	7	7	260982	260988	100 %	0 %	0 %	0 %	384527832
5251	NC_017060	CAT	2	6	261023	261028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527832
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5272	NC_017060	T	6	6	262421	262426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5274	NC_017060	AAT	3	9	262629	262637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5275	NC_017060	A	7	7	262660	262666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5276	NC_017060	TCA	2	6	262732	262737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5278	NC_017060	GT	3	6	262759	262764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5279	NC_017060	A	6	6	262793	262798	100 %	0 %	0 %	0 %	384527834
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5281	NC_017060	CTAT	2	8	262847	262854	25 %	50 %	0 %	25 %	384527834
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5365	NC_017060	T	7	7	266623	266629	0 %	100 %	0 %	0 %	384527839
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5490	NC_017060	GGT	2	6	271633	271638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527843
5491	NC_017060	GCC	2	6	271732	271737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527843
5492	NC_017060	ATC	2	6	271759	271764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527843
5493	NC_017060	ATG	2	6	271802	271807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527843
5494	NC_017060	CGC	2	6	271818	271823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527843
5495	NC_017060	CGG	2	6	271839	271844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527843
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5497	NC_017060	CAGCGC	2	12	271963	271974	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384527843
5498	NC_017060	TC	3	6	272019	272024	0 %	50 %	0 %	50 %	384527843
5499	NC_017060	CGG	2	6	272025	272030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527843
5500	NC_017060	TG	3	6	272124	272129	0 %	50 %	50 %	0 %	384527843

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