MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017060	CGC	2	6	222984	222989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527789
4502	NC_017060	GTT	2	6	223124	223129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527789
4503	NC_017060	CTG	2	6	223168	223173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527789
4504	NC_017060	CTG	2	6	223180	223185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527789
4505	NC_017060	CGC	2	6	223206	223211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527789
4506	NC_017060	GCCA	2	8	223216	223223	25 %	0 %	25 %	50 %	384527789
4507	NC_017060	AC	3	6	223238	223243	50 %	0 %	0 %	50 %	384527789
4508	NC_017060	AGC	2	6	223246	223251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527789
4509	NC_017060	AATA	2	8	223293	223300	75 %	25 %	0 %	0 %	384527789
4510	NC_017060	GCA	2	6	223348	223353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527789
4511	NC_017060	GCCC	2	8	223382	223389	0 %	0 %	25 %	75 %	384527789
4512	NC_017060	GCC	2	6	223396	223401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527789
4513	NC_017060	GTG	2	6	223407	223412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527789
4514	NC_017060	AC	3	6	223457	223462	50 %	0 %	0 %	50 %	384527789
4515	NC_017060	CAG	2	6	223527	223532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527789
4516	NC_017060	TCA	2	6	223571	223576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527789
4517	NC_017060	AAT	2	6	223594	223599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527789
4518	NC_017060	CATT	2	8	223615	223622	25 %	50 %	0 %	25 %	384527789
4519	NC_017060	CAG	2	6	223674	223679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527789
4520	NC_017060	CAGC	2	8	223731	223738	25 %	0 %	25 %	50 %	384527789
4521	NC_017060	CGA	2	6	223761	223766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527789
4522	NC_017060	GCC	2	6	223821	223826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527789
4523	NC_017060	CAG	2	6	223851	223856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527789
4524	NC_017060	CCG	2	6	223948	223953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527789
4525	NC_017060	GCCA	2	8	223973	223980	25 %	0 %	25 %	50 %	384527789
4526	NC_017060	GCG	2	6	223999	224004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527789
4527	NC_017060	CGC	2	6	224059	224064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527789
4528	NC_017060	GCCA	2	8	224080	224087	25 %	0 %	25 %	50 %	384527789
4529	NC_017060	AT	3	6	224122	224127	50 %	50 %	0 %	0 %	384527789
4530	NC_017060	GC	3	6	224147	224152	0 %	0 %	50 %	50 %	384527789
4531	NC_017060	GATCA	2	10	224214	224223	40 %	20 %	20 %	20 %	384527789
4532	NC_017060	A	6	6	224227	224232	100 %	0 %	0 %	0 %	384527789
4533	NC_017060	GGC	2	6	224298	224303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_017060	ATT	2	6	224361	224366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_017060	TCG	2	6	224416	224421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527790
4536	NC_017060	GGT	2	6	224423	224428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527790
4537	NC_017060	GCAG	2	8	224433	224440	25 %	0 %	50 %	25 %	384527790
4538	NC_017060	CGG	2	6	224447	224452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527790
4539	NC_017060	CTG	2	6	224529	224534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527790
4540	NC_017060	CGG	2	6	224547	224552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527790
4541	NC_017060	CGA	2	6	224627	224632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527790
4542	NC_017060	CGT	2	6	224637	224642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527790
4543	NC_017060	GC	4	8	224695	224702	0 %	0 %	50 %	50 %	384527790
4544	NC_017060	GTG	2	6	224703	224708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527790
4545	NC_017060	GGC	2	6	224720	224725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527790
4546	NC_017060	CTGCA	2	10	224731	224740	20 %	20 %	20 %	40 %	384527790
4547	NC_017060	ACG	2	6	224779	224784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527790
4548	NC_017060	TCA	2	6	224843	224848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527790
4549	NC_017060	CGC	3	9	224849	224857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527790
4550	NC_017060	GAC	2	6	225032	225037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527790
4551	NC_017060	GCC	2	6	225038	225043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527790
4552	NC_017060	GTT	2	6	225071	225076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527790
4553	NC_017060	CGT	2	6	225101	225106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527790
4554	NC_017060	CTGG	2	8	225119	225126	0 %	25 %	50 %	25 %	384527790
4555	NC_017060	TGC	2	6	225163	225168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527790
4556	NC_017060	CATT	2	8	225322	225329	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4557	NC_017060	ATC	2	6	225333	225338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527791
4558	NC_017060	TGC	2	6	225352	225357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527791
4559	NC_017060	T	6	6	225390	225395	0 %	100 %	0 %	0 %	384527791
4560	NC_017060	CG	3	6	225433	225438	0 %	0 %	50 %	50 %	384527791
4561	NC_017060	GCA	2	6	225459	225464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527791
4562	NC_017060	GCTG	2	8	225481	225488	0 %	25 %	50 %	25 %	384527791
4563	NC_017060	ATC	2	6	225535	225540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527791
4564	NC_017060	CGG	2	6	225563	225568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527791
4565	NC_017060	GT	3	6	225601	225606	0 %	50 %	50 %	0 %	384527791
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4567	NC_017060	ATC	2	6	225733	225738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527791
4568	NC_017060	A	6	6	225760	225765	100 %	0 %	0 %	0 %	384527791
4569	NC_017060	ACC	2	6	225879	225884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4570	NC_017060	T	9	9	225942	225950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_017060	CA	3	6	225997	226002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4572	NC_017060	CA	3	6	226016	226021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_017060	GTT	3	9	226134	226142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527792
4574	NC_017060	GAA	2	6	226224	226229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527792
4575	NC_017060	AT	3	6	226446	226451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_017060	GCT	2	6	226458	226463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_017060	GAA	2	6	226482	226487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527793
4578	NC_017060	GACT	2	8	226489	226496	25 %	25 %	25 %	25 %	384527793
4579	NC_017060	GAA	2	6	226538	226543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527793
4580	NC_017060	ACA	2	6	226600	226605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527793
4581	NC_017060	ATT	2	6	226632	226637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527793
4582	NC_017060	TCA	2	6	226762	226767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_017060	GCGAT	2	10	226790	226799	20 %	20 %	40 %	20 %	384527794
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4585	NC_017060	AT	3	6	227091	227096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_017060	TAA	2	6	227103	227108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_017060	AGA	2	6	227226	227231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527795
4588	NC_017060	TAA	2	6	227274	227279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527795
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4590	NC_017060	ATT	2	6	227317	227322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527795
4591	NC_017060	A	6	6	227336	227341	100 %	0 %	0 %	0 %	384527795
4592	NC_017060	CGT	2	6	227397	227402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527795
4593	NC_017060	TGA	3	9	227415	227423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527795
4594	NC_017060	AT	3	6	227433	227438	50 %	50 %	0 %	0 %	384527795
4595	NC_017060	AC	3	6	227649	227654	50 %	0 %	0 %	50 %	384527796
4596	NC_017060	TTC	2	6	227679	227684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527796
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4599	NC_017060	ATC	2	6	227868	227873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527796
4600	NC_017060	ACG	2	6	227941	227946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527796
4601	NC_017060	TCT	2	6	228092	228097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527796
4602	NC_017060	GTT	2	6	228148	228153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527796
4603	NC_017060	CAA	2	6	228245	228250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527796
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4605	NC_017060	GAA	2	6	228350	228355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527796
4606	NC_017060	GC	3	6	228410	228415	0 %	0 %	50 %	50 %	384527796
4607	NC_017060	ACA	2	6	228472	228477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527796
4608	NC_017060	GCG	2	6	228528	228533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527796
4609	NC_017060	AAC	2	6	228558	228563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527796
4610	NC_017060	ATT	2	6	228567	228572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527796
4611	NC_017060	TAT	2	6	228596	228601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527796
4612	NC_017060	GCAG	2	8	228733	228740	25 %	0 %	50 %	25 %	384527796
4613	NC_017060	TTTA	2	8	228836	228843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_017060	A	6	6	228887	228892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_017060	GGA	2	6	228947	228952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_017060	CAA	2	6	228997	229002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527797
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4618	NC_017060	ATC	2	6	229060	229065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527797
4619	NC_017060	CGC	2	6	229068	229073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527797
4620	NC_017060	CCGG	2	8	229083	229090	0 %	0 %	50 %	50 %	384527797
4621	NC_017060	AAC	2	6	229174	229179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527797
4622	NC_017060	CGG	2	6	229214	229219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527797
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4624	NC_017060	T	6	6	229292	229297	0 %	100 %	0 %	0 %	384527797
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4871	NC_017060	CAGA	2	8	241636	241643	50 %	0 %	25 %	25 %	384527815
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4883	NC_017060	TTCA	2	8	242038	242045	25 %	50 %	0 %	25 %	384527815
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4987	NC_017060	ATGTG	2	10	248507	248516	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4988	NC_017060	CTC	2	6	248521	248526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4989	NC_017060	TAC	2	6	248545	248550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527822
4990	NC_017060	CAC	2	6	248580	248585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527822
4991	NC_017060	ATC	2	6	248636	248641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527822
4992	NC_017060	TGA	2	6	248648	248653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527822
4993	NC_017060	TCCC	2	8	248673	248680	0 %	25 %	0 %	75 %	384527822
4994	NC_017060	CGG	2	6	248699	248704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527822
4995	NC_017060	ATC	2	6	248740	248745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527822
4996	NC_017060	GAT	3	9	248775	248783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527822
4997	NC_017060	CCTG	2	8	248875	248882	0 %	25 %	25 %	50 %	384527822
4998	NC_017060	T	6	6	248887	248892	0 %	100 %	0 %	0 %	384527822
4999	NC_017060	TGG	2	6	248965	248970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527822
5000	NC_017060	CGG	2	6	248994	248999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527822

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