MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 33435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017058	T	6	6	152817	152822	0 %	100 %	0 %	0 %	383501065
4002	NC_017058	CTT	2	6	152824	152829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501065
4003	NC_017058	ATTTT	2	10	152953	152962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017058	TTA	2	6	152977	152982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017058	GAA	2	6	152999	153004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501066
4006	NC_017058	CAA	2	6	153053	153058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501066
4007	NC_017058	ATT	2	6	153099	153104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501066
4008	NC_017058	GCT	2	6	153163	153168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501066
4009	NC_017058	ATA	2	6	153226	153231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501066
4010	NC_017058	CCG	2	6	153286	153291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383501066
4011	NC_017058	A	7	7	153314	153320	100 %	0 %	0 %	0 %	383501066
4012	NC_017058	TA	3	6	153348	153353	50 %	50 %	0 %	0 %	383501066
4013	NC_017058	TAGCGG	2	12	153392	153403	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383501066
4014	NC_017058	CTCG	2	8	153443	153450	0 %	25 %	25 %	50 %	383501066
4015	NC_017058	ATA	2	6	153469	153474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501066
4016	NC_017058	CCA	2	6	153557	153562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383501066
4017	NC_017058	CTT	2	6	153602	153607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501066
4018	NC_017058	AATT	2	8	153650	153657	50 %	50 %	0 %	0 %	383501066
4019	NC_017058	CGCT	2	8	153697	153704	0 %	25 %	25 %	50 %	383501066
4020	NC_017058	AAT	2	6	153711	153716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501066
4021	NC_017058	CTTTTT	2	12	153751	153762	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383501066
4022	NC_017058	TAAC	2	8	153800	153807	50 %	25 %	0 %	25 %	383501066
4023	NC_017058	T	6	6	153892	153897	0 %	100 %	0 %	0 %	383501066
4024	NC_017058	ATA	2	6	153916	153921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501066
4025	NC_017058	TATC	2	8	153923	153930	25 %	50 %	0 %	25 %	383501066
4026	NC_017058	AAG	2	6	153998	154003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501066
4027	NC_017058	A	6	6	154009	154014	100 %	0 %	0 %	0 %	383501066
4028	NC_017058	TTATA	2	10	154037	154046	40 %	60 %	0 %	0 %	383501066
4029	NC_017058	AAG	2	6	154102	154107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501066
4030	NC_017058	TTGTC	2	10	154111	154120	0 %	60 %	20 %	20 %	383501066
4031	NC_017058	TCT	2	6	154162	154167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501066
4032	NC_017058	TAA	2	6	154176	154181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501066
4033	NC_017058	ATAAA	2	10	154198	154207	80 %	20 %	0 %	0 %	383501066
4034	NC_017058	AAT	2	6	154213	154218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501066
4035	NC_017058	ATA	2	6	154233	154238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501066
4036	NC_017058	TAA	2	6	154239	154244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501066
4037	NC_017058	CAT	2	6	154245	154250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501066
4038	NC_017058	GTT	2	6	154279	154284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501067
4039	NC_017058	TAT	2	6	154373	154378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501067
4040	NC_017058	T	6	6	154439	154444	0 %	100 %	0 %	0 %	383501067
4041	NC_017058	TA	3	6	154486	154491	50 %	50 %	0 %	0 %	383501067
4042	NC_017058	TAT	2	6	154520	154525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501067
4043	NC_017058	TAG	2	6	154585	154590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501067
4044	NC_017058	CTA	2	6	154594	154599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501067
4045	NC_017058	CTA	2	6	154621	154626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501067
4046	NC_017058	A	6	6	154783	154788	100 %	0 %	0 %	0 %	383501067
4047	NC_017058	TATT	2	8	154863	154870	25 %	75 %	0 %	0 %	383501067
4048	NC_017058	T	6	6	154872	154877	0 %	100 %	0 %	0 %	383501067
4049	NC_017058	T	6	6	154883	154888	0 %	100 %	0 %	0 %	383501067
4050	NC_017058	ATT	2	6	154972	154977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017058	T	6	6	154980	154985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017058	CT	3	6	155040	155045	0 %	50 %	0 %	50 %	383501068
4053	NC_017058	CTT	2	6	155061	155066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501068
4054	NC_017058	CTT	2	6	155151	155156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501068
4055	NC_017058	ATT	2	6	155192	155197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501068
4056	NC_017058	T	7	7	155321	155327	0 %	100 %	0 %	0 %	383501068
4057	NC_017058	TA	3	6	155350	155355	50 %	50 %	0 %	0 %	383501068
4058	NC_017058	AGC	2	6	155383	155388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501068
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4060	NC_017058	TTAA	2	8	155447	155454	50 %	50 %	0 %	0 %	383501068
4061	NC_017058	TC	3	6	155533	155538	0 %	50 %	0 %	50 %	383501068
4062	NC_017058	ATA	2	6	155591	155596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501068
4063	NC_017058	ATC	2	6	155608	155613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501068
4064	NC_017058	TAA	3	9	155712	155720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501068
4065	NC_017058	AAT	2	6	155863	155868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501068
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4067	NC_017058	TA	4	8	155907	155914	50 %	50 %	0 %	0 %	383501068
4068	NC_017058	CCG	2	6	155924	155929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383501068
4069	NC_017058	TACT	2	8	155931	155938	25 %	50 %	0 %	25 %	383501068
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4076	NC_017058	AAT	2	6	156211	156216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501068
4077	NC_017058	CAG	2	6	156269	156274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_017058	TAA	3	9	156345	156353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017058	ATA	2	6	156357	156362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017058	ATT	2	6	156385	156390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017058	TAT	2	6	156419	156424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017058	AGTA	2	8	156425	156432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017058	TAAAA	2	10	156463	156472	80 %	20 %	0 %	0 %	383501069
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4090	NC_017058	TA	3	6	156621	156626	50 %	50 %	0 %	0 %	383501069
4091	NC_017058	ATG	2	6	156639	156644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501069
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4093	NC_017058	TAT	2	6	156701	156706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501069
4094	NC_017058	T	6	6	156724	156729	0 %	100 %	0 %	0 %	383501069
4095	NC_017058	A	6	6	156730	156735	100 %	0 %	0 %	0 %	383501069
4096	NC_017058	T	6	6	156802	156807	0 %	100 %	0 %	0 %	383501069
4097	NC_017058	CTA	2	6	156885	156890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501069
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4099	NC_017058	ATT	2	6	156972	156977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501069
4100	NC_017058	AATG	2	8	157078	157085	50 %	25 %	25 %	0 %	383501069
4101	NC_017058	AT	3	6	157130	157135	50 %	50 %	0 %	0 %	383501069
4102	NC_017058	AAAAC	2	10	157159	157168	80 %	0 %	0 %	20 %	383501069
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4105	NC_017058	TTTAA	2	10	157235	157244	40 %	60 %	0 %	0 %	383501069
4106	NC_017058	CGC	2	6	157294	157299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383501069
4107	NC_017058	ATTT	2	8	157330	157337	25 %	75 %	0 %	0 %	383501069
4108	NC_017058	TGAA	2	8	157344	157351	50 %	25 %	25 %	0 %	383501069
4109	NC_017058	ATAA	2	8	157352	157359	75 %	25 %	0 %	0 %	383501069
4110	NC_017058	T	6	6	157360	157365	0 %	100 %	0 %	0 %	383501069
4111	NC_017058	A	7	7	157368	157374	100 %	0 %	0 %	0 %	383501069
4112	NC_017058	GAA	2	6	157397	157402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501069
4113	NC_017058	ATA	2	6	157403	157408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501069
4114	NC_017058	AATA	2	8	157421	157428	75 %	25 %	0 %	0 %	383501069
4115	NC_017058	TAT	2	6	157432	157437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501069
4116	NC_017058	CTAT	2	8	157482	157489	25 %	50 %	0 %	25 %	383501070
4117	NC_017058	TATGC	2	10	157490	157499	20 %	40 %	20 %	20 %	383501070
4118	NC_017058	ATT	2	6	157502	157507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501070
4119	NC_017058	AT	3	6	157542	157547	50 %	50 %	0 %	0 %	383501070
4120	NC_017058	TGG	2	6	157556	157561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383501070
4121	NC_017058	TA	3	6	157647	157652	50 %	50 %	0 %	0 %	383501070
4122	NC_017058	TCA	2	6	157723	157728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501070
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4126	NC_017058	TAC	2	6	158019	158024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501070
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