MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 33435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017058	TAT	2	6	116482	116487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501042
3002	NC_017058	AAC	2	6	116524	116529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501042
3003	NC_017058	ATC	2	6	116625	116630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501042
3004	NC_017058	TA	3	6	116662	116667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017058	T	6	6	116680	116685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017058	AATA	2	8	116754	116761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017058	TAA	3	9	116765	116773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017058	TAA	2	6	116781	116786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017058	ATA	2	6	116860	116865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017058	TGCT	2	8	116892	116899	0 %	50 %	25 %	25 %	383501043
3011	NC_017058	TA	3	6	116937	116942	50 %	50 %	0 %	0 %	383501043
3012	NC_017058	TGATCG	2	12	116980	116991	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501043
3013	NC_017058	ATT	2	6	116993	116998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501043
3014	NC_017058	TTA	2	6	117042	117047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501043
3015	NC_017058	GA	4	8	117204	117211	50 %	0 %	50 %	0 %	383501043
3016	NC_017058	AATG	2	8	117218	117225	50 %	25 %	25 %	0 %	383501043
3017	NC_017058	ACT	2	6	117280	117285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501043
3018	NC_017058	A	6	6	117288	117293	100 %	0 %	0 %	0 %	383501043
3019	NC_017058	AAAT	2	8	117375	117382	75 %	25 %	0 %	0 %	383501043
3020	NC_017058	AT	3	6	117385	117390	50 %	50 %	0 %	0 %	383501043
3021	NC_017058	TAA	2	6	117400	117405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501043
3022	NC_017058	AGC	2	6	117454	117459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501043
3023	NC_017058	GAT	2	6	117467	117472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501043
3024	NC_017058	AT	3	6	117550	117555	50 %	50 %	0 %	0 %	383501043
3025	NC_017058	TCAAA	2	10	117576	117585	60 %	20 %	0 %	20 %	383501043
3026	NC_017058	CTC	2	6	117601	117606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383501043
3027	NC_017058	GTA	2	6	117623	117628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501043
3028	NC_017058	TAT	2	6	117660	117665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501043
3029	NC_017058	CAAA	2	8	117668	117675	75 %	0 %	0 %	25 %	383501043
3030	NC_017058	TAAA	2	8	117684	117691	75 %	25 %	0 %	0 %	383501043
3031	NC_017058	A	6	6	117693	117698	100 %	0 %	0 %	0 %	383501043
3032	NC_017058	TTA	2	6	117699	117704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501043
3033	NC_017058	A	6	6	117753	117758	100 %	0 %	0 %	0 %	383501043
3034	NC_017058	TAA	2	6	117814	117819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501043
3035	NC_017058	GAT	2	6	117881	117886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501043
3036	NC_017058	TTA	2	6	117893	117898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501043
3037	NC_017058	TA	3	6	117965	117970	50 %	50 %	0 %	0 %	383501043
3038	NC_017058	GACC	2	8	117979	117986	25 %	0 %	25 %	50 %	383501043
3039	NC_017058	TAA	2	6	118030	118035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501043
3040	NC_017058	AT	3	6	118057	118062	50 %	50 %	0 %	0 %	383501044
3041	NC_017058	TA	3	6	118105	118110	50 %	50 %	0 %	0 %	383501044
3042	NC_017058	CTA	2	6	118135	118140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501044
3043	NC_017058	ATT	2	6	118194	118199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501044
3044	NC_017058	GCT	2	6	118200	118205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501044
3045	NC_017058	AAAGA	2	10	118206	118215	80 %	0 %	20 %	0 %	383501044
3046	NC_017058	CTC	2	6	118219	118224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383501044
3047	NC_017058	TTA	2	6	118303	118308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501044
3048	NC_017058	GAA	2	6	118365	118370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501044
3049	NC_017058	AGC	2	6	118398	118403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501044
3050	NC_017058	ATG	2	6	118543	118548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501044
3051	NC_017058	AAAT	2	8	118558	118565	75 %	25 %	0 %	0 %	383501044
3052	NC_017058	TAGT	2	8	118570	118577	25 %	50 %	25 %	0 %	383501044
3053	NC_017058	TAT	2	6	118582	118587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501044
3054	NC_017058	TAA	2	6	118691	118696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501044
3055	NC_017058	ATT	2	6	118697	118702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501044
3056	NC_017058	GATG	2	8	118706	118713	25 %	25 %	50 %	0 %	383501044
3057	NC_017058	AT	3	6	118807	118812	50 %	50 %	0 %	0 %	383501044
3058	NC_017058	T	7	7	118812	118818	0 %	100 %	0 %	0 %	383501044
3059	NC_017058	TTAC	2	8	118866	118873	25 %	50 %	0 %	25 %	383501044
3060	NC_017058	CTA	2	6	118966	118971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501044
3061	NC_017058	ATAG	2	8	119061	119068	50 %	25 %	25 %	0 %	383501044
3062	NC_017058	TTG	2	6	119200	119205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501044
3063	NC_017058	ATG	2	6	119301	119306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501044
3064	NC_017058	TTGATT	2	12	119332	119343	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383501044
3065	NC_017058	T	6	6	119380	119385	0 %	100 %	0 %	0 %	383501044
3066	NC_017058	TAA	2	6	119456	119461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501044
3067	NC_017058	TAT	2	6	119491	119496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501044
3068	NC_017058	AGA	3	9	119501	119509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501044
3069	NC_017058	TAA	2	6	119599	119604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501044
3070	NC_017058	ACT	2	6	119691	119696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501044
3071	NC_017058	TCTTGC	2	12	119702	119713	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383501044
3072	NC_017058	T	7	7	119868	119874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017058	GTG	2	6	119900	119905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_017058	GTG	2	6	119909	119914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017058	AAT	2	6	119938	119943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501045
3076	NC_017058	GTT	3	9	119944	119952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501045
3077	NC_017058	TATT	2	8	119988	119995	25 %	75 %	0 %	0 %	383501045
3078	NC_017058	TGA	2	6	120045	120050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501045
3079	NC_017058	ATA	2	6	120076	120081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501045
3080	NC_017058	AGC	2	6	120096	120101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501045
3081	NC_017058	AT	3	6	120115	120120	50 %	50 %	0 %	0 %	383501045
3082	NC_017058	TCAAAG	2	12	120207	120218	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501045
3083	NC_017058	TGA	2	6	120219	120224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501045
3084	NC_017058	TGA	2	6	120231	120236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501045
3085	NC_017058	TAA	2	6	120270	120275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501045
3086	NC_017058	ATA	2	6	120301	120306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501045
3087	NC_017058	AAT	2	6	120358	120363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501045
3088	NC_017058	GAAGCA	2	12	120400	120411	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383501045
3089	NC_017058	AAG	2	6	120416	120421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501045
3090	NC_017058	A	6	6	120432	120437	100 %	0 %	0 %	0 %	383501045
3091	NC_017058	TGT	2	6	120462	120467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501045
3092	NC_017058	A	6	6	120478	120483	100 %	0 %	0 %	0 %	383501045
3093	NC_017058	GAC	2	6	120493	120498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501045
3094	NC_017058	ATA	2	6	120578	120583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501045
3095	NC_017058	TG	3	6	120592	120597	0 %	50 %	50 %	0 %	383501045
3096	NC_017058	ATA	2	6	120603	120608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501045
3097	NC_017058	ATA	2	6	120627	120632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_017058	GAA	2	6	120636	120641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017058	TGA	2	6	120647	120652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017058	GAAA	2	8	120705	120712	75 %	0 %	25 %	0 %	383501046
3101	NC_017058	GTC	2	6	120789	120794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501046
3102	NC_017058	GAG	2	6	120800	120805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383501046
3103	NC_017058	AAT	2	6	120829	120834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501046
3104	NC_017058	A	7	7	120836	120842	100 %	0 %	0 %	0 %	383501046
3105	NC_017058	TCG	2	6	120875	120880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_017058	TAC	2	6	120884	120889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_017058	TTC	2	6	120894	120899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_017058	ATAA	2	8	120911	120918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017058	AAG	2	6	120937	120942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501047
3110	NC_017058	TTA	2	6	121068	121073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501047
3111	NC_017058	GGT	2	6	121130	121135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383501047
3112	NC_017058	ACC	2	6	121156	121161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383501047
3113	NC_017058	CGTTA	2	10	121216	121225	20 %	40 %	20 %	20 %	383501047
3114	NC_017058	TTGA	2	8	121230	121237	25 %	50 %	25 %	0 %	383501047
3115	NC_017058	GCA	2	6	121275	121280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501047
3116	NC_017058	TTA	2	6	121323	121328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501047
3117	NC_017058	ATG	2	6	121372	121377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501047
3118	NC_017058	ATA	2	6	121395	121400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501047
3119	NC_017058	CCG	2	6	121473	121478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383501047
3120	NC_017058	ACC	2	6	121522	121527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383501047
3121	NC_017058	CGG	2	6	121583	121588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383501047
3122	NC_017058	ATT	2	6	121593	121598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501047
3123	NC_017058	TTA	2	6	121612	121617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501047
3124	NC_017058	TAC	2	6	121628	121633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501047
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