MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 33435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_017058	TAC	2	6	1280269	1280274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502156
33002	NC_017058	TAG	2	6	1280322	1280327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383502156
33003	NC_017058	CCCA	2	8	1280332	1280339	25 %	0 %	0 %	75 %	383502156
33004	NC_017058	TAT	2	6	1280340	1280345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502156
33005	NC_017058	CTC	2	6	1280499	1280504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383502156
33006	NC_017058	GCA	2	6	1280567	1280572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383502156
33007	NC_017058	TAA	2	6	1280646	1280651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502156
33008	NC_017058	AT	3	6	1280665	1280670	50 %	50 %	0 %	0 %	383502156
33009	NC_017058	TCC	2	6	1280794	1280799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383502156
33010	NC_017058	CAT	2	6	1280844	1280849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502156
33011	NC_017058	CTT	2	6	1280883	1280888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502156
33012	NC_017058	CAA	2	6	1280916	1280921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383502156
33013	NC_017058	A	6	6	1280920	1280925	100 %	0 %	0 %	0 %	383502156
33014	NC_017058	CTG	2	6	1280947	1280952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383502156
33015	NC_017058	ATGGC	2	10	1280969	1280978	20 %	20 %	40 %	20 %	383502156
33016	NC_017058	GCA	2	6	1280993	1280998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383502156
33017	NC_017058	TGT	2	6	1281034	1281039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383502156
33018	NC_017058	CATA	2	8	1281195	1281202	50 %	25 %	0 %	25 %	383502156
33019	NC_017058	ATC	2	6	1281214	1281219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502156
33020	NC_017058	AGC	2	6	1281259	1281264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383502156
33021	NC_017058	CTT	2	6	1281318	1281323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502156
33022	NC_017058	ACT	2	6	1281371	1281376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502156
33023	NC_017058	ATG	2	6	1281388	1281393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383502156
33024	NC_017058	ATTAA	2	10	1281416	1281425	60 %	40 %	0 %	0 %	383502156
33025	NC_017058	TAT	2	6	1281430	1281435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33026	NC_017058	AT	3	6	1281434	1281439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33027	NC_017058	TAT	2	6	1281509	1281514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33028	NC_017058	ATT	2	6	1281528	1281533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33029	NC_017058	TAT	2	6	1281604	1281609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33030	NC_017058	CTT	2	6	1281652	1281657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502157
33031	NC_017058	GCA	2	6	1281676	1281681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383502157
33032	NC_017058	ATC	2	6	1281729	1281734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502157
33033	NC_017058	AT	3	6	1281764	1281769	50 %	50 %	0 %	0 %	383502158
33034	NC_017058	AT	3	6	1281783	1281788	50 %	50 %	0 %	0 %	383502158
33035	NC_017058	CTA	2	6	1281872	1281877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502158
33036	NC_017058	TTC	2	6	1281927	1281932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33037	NC_017058	ATA	2	6	1281958	1281963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33038	NC_017058	CTA	2	6	1281998	1282003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502159
33039	NC_017058	AAT	2	6	1282030	1282035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502159
33040	NC_017058	TAT	2	6	1282041	1282046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502159
33041	NC_017058	AT	3	6	1282052	1282057	50 %	50 %	0 %	0 %	383502159
33042	NC_017058	TA	3	6	1282077	1282082	50 %	50 %	0 %	0 %	383502159
33043	NC_017058	ACC	2	6	1282132	1282137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383502159
33044	NC_017058	CTA	2	6	1282151	1282156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502159
33045	NC_017058	ATA	3	9	1282183	1282191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502159
33046	NC_017058	ATT	2	6	1282200	1282205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502159
33047	NC_017058	GTTA	2	8	1282209	1282216	25 %	50 %	25 %	0 %	383502159
33048	NC_017058	AT	3	6	1282224	1282229	50 %	50 %	0 %	0 %	383502159
33049	NC_017058	ATG	2	6	1282284	1282289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383502159
33050	NC_017058	T	6	6	1282315	1282320	0 %	100 %	0 %	0 %	383502159
33051	NC_017058	TA	3	6	1282445	1282450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33052	NC_017058	GAA	2	6	1282461	1282466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33053	NC_017058	ACG	2	6	1282562	1282567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33054	NC_017058	TAA	2	6	1282621	1282626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502160
33055	NC_017058	AC	3	6	1282643	1282648	50 %	0 %	0 %	50 %	383502160
33056	NC_017058	AAAT	2	8	1282699	1282706	75 %	25 %	0 %	0 %	383502160
33057	NC_017058	CTA	2	6	1282752	1282757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502160
33058	NC_017058	ATT	2	6	1282798	1282803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502160
33059	NC_017058	ACC	2	6	1282824	1282829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383502160
33060	NC_017058	A	6	6	1282849	1282854	100 %	0 %	0 %	0 %	383502160
33061	NC_017058	TA	4	8	1282911	1282918	50 %	50 %	0 %	0 %	383502160
33062	NC_017058	GCG	2	6	1282926	1282931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383502160
33063	NC_017058	TTA	2	6	1282943	1282948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502160
33064	NC_017058	ATA	2	6	1282973	1282978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502160
33065	NC_017058	TAA	3	9	1282980	1282988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33066	NC_017058	A	6	6	1282987	1282992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33067	NC_017058	TA	3	6	1282995	1283000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33068	NC_017058	A	6	6	1283014	1283019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33069	NC_017058	TTA	2	6	1283054	1283059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33070	NC_017058	GCT	2	6	1283087	1283092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33071	NC_017058	ATCT	2	8	1283154	1283161	25 %	50 %	0 %	25 %	383502161
33072	NC_017058	ATC	2	6	1283192	1283197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502161
33073	NC_017058	ATC	2	6	1283213	1283218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502161
33074	NC_017058	ATT	2	6	1283246	1283251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502161
33075	NC_017058	TCT	2	6	1283265	1283270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502161
33076	NC_017058	ACC	2	6	1283285	1283290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383502161
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33078	NC_017058	TAAG	2	8	1283326	1283333	50 %	25 %	25 %	0 %	383502161
33079	NC_017058	TGG	2	6	1283335	1283340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383502161
33080	NC_017058	ACC	2	6	1283357	1283362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383502161
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33082	NC_017058	TTC	2	6	1283406	1283411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502161
33083	NC_017058	TTTTG	2	10	1283520	1283529	0 %	80 %	20 %	0 %	383502161
33084	NC_017058	TA	3	6	1283558	1283563	50 %	50 %	0 %	0 %	383502161
33085	NC_017058	TCTT	2	8	1283616	1283623	0 %	75 %	0 %	25 %	383502161
33086	NC_017058	ATTT	2	8	1283666	1283673	25 %	75 %	0 %	0 %	383502161
33087	NC_017058	TTC	2	6	1283711	1283716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502161
33088	NC_017058	TAA	2	6	1283777	1283782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502161
33089	NC_017058	TTC	2	6	1283846	1283851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502161
33090	NC_017058	T	6	6	1283887	1283892	0 %	100 %	0 %	0 %	383502161
33091	NC_017058	ATT	2	6	1283902	1283907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33092	NC_017058	TAT	3	9	1283912	1283920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33093	NC_017058	TGA	2	6	1283956	1283961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33094	NC_017058	A	6	6	1283972	1283977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33095	NC_017058	CGC	2	6	1284005	1284010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33096	NC_017058	GAC	2	6	1284033	1284038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33097	NC_017058	ACC	2	6	1284049	1284054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383502162
33098	NC_017058	AC	3	6	1284068	1284073	50 %	0 %	0 %	50 %	383502162
33099	NC_017058	TCAA	2	8	1284088	1284095	50 %	25 %	0 %	25 %	383502162
33100	NC_017058	T	6	6	1284120	1284125	0 %	100 %	0 %	0 %	383502162
33101	NC_017058	TTC	2	6	1284141	1284146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502162
33102	NC_017058	CTTA	2	8	1284150	1284157	25 %	50 %	0 %	25 %	383502162
33103	NC_017058	TCT	2	6	1284217	1284222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502162
33104	NC_017058	TCA	2	6	1284223	1284228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502162
33105	NC_017058	TTC	2	6	1284285	1284290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502162
33106	NC_017058	T	7	7	1284337	1284343	0 %	100 %	0 %	0 %	383502162
33107	NC_017058	TTTG	2	8	1284345	1284352	0 %	75 %	25 %	0 %	383502162
33108	NC_017058	TCT	2	6	1284358	1284363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502162
33109	NC_017058	TCT	2	6	1284373	1284378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502162
33110	NC_017058	CTT	2	6	1284395	1284400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502162
33111	NC_017058	T	6	6	1284438	1284443	0 %	100 %	0 %	0 %	383502162
33112	NC_017058	GTA	2	6	1284449	1284454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383502162
33113	NC_017058	CTT	2	6	1284467	1284472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502162
33114	NC_017058	AAT	2	6	1284492	1284497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502162
33115	NC_017058	T	6	6	1284507	1284512	0 %	100 %	0 %	0 %	383502162
33116	NC_017058	TAT	3	9	1284543	1284551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502162
33117	NC_017058	TCT	2	6	1284589	1284594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502162
33118	NC_017058	CTA	2	6	1284605	1284610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502162
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33120	NC_017058	TACT	2	8	1284692	1284699	25 %	50 %	0 %	25 %	383502162
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.