MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 33435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017058	AGA	2	6	97156	97161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_017058	AGA	2	6	97240	97245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_017058	ATA	2	6	97272	97277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_017058	CAAA	2	8	97279	97286	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2505	NC_017058	T	6	6	97444	97449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_017058	GTA	2	6	97466	97471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_017058	A	6	6	97497	97502	100 %	0 %	0 %	0 %	383501019
2508	NC_017058	GTT	2	6	97508	97513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501019
2509	NC_017058	TGC	2	6	97553	97558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501019
2510	NC_017058	ACC	2	6	97559	97564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383501019
2511	NC_017058	A	7	7	97604	97610	100 %	0 %	0 %	0 %	383501019
2512	NC_017058	A	6	6	97649	97654	100 %	0 %	0 %	0 %	383501019
2513	NC_017058	T	6	6	97670	97675	0 %	100 %	0 %	0 %	383501019
2514	NC_017058	T	7	7	97685	97691	0 %	100 %	0 %	0 %	383501019
2515	NC_017058	CATAC	2	10	97772	97781	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2516	NC_017058	ATTTT	2	10	97807	97816	20 %	80 %	0 %	0 %	383501020
2517	NC_017058	TTG	2	6	97829	97834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501020
2518	NC_017058	TAT	2	6	97851	97856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501020
2519	NC_017058	T	6	6	97856	97861	0 %	100 %	0 %	0 %	383501020
2520	NC_017058	ATAG	2	8	97889	97896	50 %	25 %	25 %	0 %	383501020
2521	NC_017058	TTG	2	6	97912	97917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501020
2522	NC_017058	A	6	6	97925	97930	100 %	0 %	0 %	0 %	383501020
2523	NC_017058	TA	3	6	97956	97961	50 %	50 %	0 %	0 %	383501020
2524	NC_017058	TTA	2	6	97976	97981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501020
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2527	NC_017058	T	6	6	98070	98075	0 %	100 %	0 %	0 %	383501020
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2529	NC_017058	TTG	2	6	98097	98102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501020
2530	NC_017058	T	7	7	98107	98113	0 %	100 %	0 %	0 %	383501020
2531	NC_017058	AGC	2	6	98142	98147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501020
2532	NC_017058	ATT	2	6	98177	98182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501020
2533	NC_017058	T	8	8	98181	98188	0 %	100 %	0 %	0 %	383501020
2534	NC_017058	TAA	2	6	98215	98220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_017058	TTG	2	6	98227	98232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_017058	TG	3	6	98231	98236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_017058	TTG	2	6	98263	98268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_017058	A	6	6	98331	98336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_017058	TAA	2	6	98340	98345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_017058	ATG	2	6	98471	98476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_017058	CTT	2	6	98498	98503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_017058	ATA	2	6	98546	98551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_017058	ATT	2	6	98555	98560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_017058	TAA	2	6	98593	98598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_017058	AATA	2	8	98604	98611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_017058	AT	3	6	98626	98631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_017058	TAA	3	9	98639	98647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_017058	A	6	6	98724	98729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_017058	A	7	7	98843	98849	100 %	0 %	0 %	0 %	383501021
2550	NC_017058	CT	3	6	98928	98933	0 %	50 %	0 %	50 %	383501021
2551	NC_017058	CAAT	2	8	98955	98962	50 %	25 %	0 %	25 %	383501021
2552	NC_017058	A	7	7	98969	98975	100 %	0 %	0 %	0 %	383501021
2553	NC_017058	T	6	6	99003	99008	0 %	100 %	0 %	0 %	383501021
2554	NC_017058	TC	3	6	99147	99152	0 %	50 %	0 %	50 %	383501021
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2557	NC_017058	TAA	2	6	99236	99241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501022
2558	NC_017058	AT	3	6	99253	99258	50 %	50 %	0 %	0 %	383501022
2559	NC_017058	CACAC	2	10	99407	99416	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2560	NC_017058	TGC	2	6	99426	99431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_017058	CCTTA	2	10	99483	99492	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2562	NC_017058	AAC	2	6	99524	99529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_017058	ATT	2	6	99618	99623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_017058	ATT	2	6	99637	99642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_017058	ATG	2	6	99673	99678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_017058	CTA	2	6	99688	99693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_017058	TAA	2	6	99710	99715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_017058	TTGA	2	8	99723	99730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_017058	ATT	2	6	99741	99746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_017058	TAT	2	6	99795	99800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_017058	AAG	2	6	99810	99815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_017058	AGT	2	6	99913	99918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501023
2573	NC_017058	ATG	2	6	100017	100022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501023
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2582	NC_017058	TA	3	6	100422	100427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_017058	ATT	2	6	100513	100518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2585	NC_017058	ATT	2	6	100529	100534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2589	NC_017058	AAT	2	6	100672	100677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_017058	T	6	6	100683	100688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2595	NC_017058	GAT	2	6	100908	100913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501025
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2597	NC_017058	GCA	2	6	101213	101218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_017058	TCT	2	6	101234	101239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_017058	T	7	7	101248	101254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_017058	AAT	2	6	101259	101264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_017058	AT	3	6	101263	101268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_017058	ATT	2	6	101339	101344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_017058	TTAA	2	8	101440	101447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_017058	AT	3	6	101471	101476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_017058	TAA	2	6	101484	101489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_017058	TAGA	2	8	101507	101514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_017058	TAAA	2	8	101528	101535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_017058	TTTA	2	8	101574	101581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_017058	A	6	6	101594	101599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_017058	TAGTA	2	10	101629	101638	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_017058	AAAT	2	8	101649	101656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_017058	ATTTA	2	10	101663	101672	40 %	60 %	0 %	0 %	383501026
2613	NC_017058	AAG	2	6	101747	101752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501026
2614	NC_017058	TTC	2	6	101754	101759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501026
2615	NC_017058	ATG	2	6	101771	101776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501026
2616	NC_017058	ACT	2	6	101793	101798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501026
2617	NC_017058	GTA	2	6	101828	101833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501026
2618	NC_017058	AT	3	6	101872	101877	50 %	50 %	0 %	0 %	383501026
2619	NC_017058	TAC	2	6	101880	101885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501026
2620	NC_017058	TTA	2	6	101958	101963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501026
2621	NC_017058	ATCCTG	2	12	102030	102041	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383501026
2622	NC_017058	ATG	2	6	102152	102157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501026
2623	NC_017058	TAT	2	6	102165	102170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501026
2624	NC_017058	ATT	2	6	102272	102277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501026
2625	NC_017058	T	6	6	102283	102288	0 %	100 %	0 %	0 %	383501026
2626	NC_017058	ATG	2	6	102347	102352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501026
2627	NC_017058	GATG	2	8	102384	102391	25 %	25 %	50 %	0 %	383501026
2628	NC_017058	AAAAG	2	10	102439	102448	80 %	0 %	20 %	0 %	383501026
2629	NC_017058	AAAGCT	2	12	102449	102460	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501026
2630	NC_017058	CGA	2	6	102600	102605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501026
2631	NC_017058	TA	4	8	102619	102626	50 %	50 %	0 %	0 %	383501026
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2633	NC_017058	GTA	2	6	102681	102686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501026
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