MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 33435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017058	ACT	2	6	19720	19725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500949
502	NC_017058	CCG	2	6	19762	19767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383500949
503	NC_017058	CTG	2	6	19769	19774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500949
504	NC_017058	CTAAAG	2	12	19787	19798	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383500949
505	NC_017058	TAT	2	6	19859	19864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500949
506	NC_017058	AT	3	6	19891	19896	50 %	50 %	0 %	0 %	383500949
507	NC_017058	TATCTT	2	12	19949	19960	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383500949
508	NC_017058	AT	3	6	19974	19979	50 %	50 %	0 %	0 %	383500949
509	NC_017058	TCA	2	6	20011	20016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500949
510	NC_017058	T	8	8	20050	20057	0 %	100 %	0 %	0 %	383500949
511	NC_017058	GCTT	2	8	20068	20075	0 %	50 %	25 %	25 %	383500949
512	NC_017058	ATC	2	6	20079	20084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500949
513	NC_017058	TAGCAA	2	12	20114	20125	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383500949
514	NC_017058	AATT	2	8	20160	20167	50 %	50 %	0 %	0 %	383500949
515	NC_017058	TAC	2	6	20174	20179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500949
516	NC_017058	TAAA	2	8	20270	20277	75 %	25 %	0 %	0 %	383500949
517	NC_017058	GA	3	6	20327	20332	50 %	0 %	50 %	0 %	383500949
518	NC_017058	CAA	2	6	20366	20371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383500949
519	NC_017058	GCA	2	6	20396	20401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500949
520	NC_017058	TAT	2	6	20465	20470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500949
521	NC_017058	TAC	2	6	20534	20539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500949
522	NC_017058	AAT	2	6	20545	20550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500949
523	NC_017058	A	6	6	20636	20641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017058	T	7	7	20657	20663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017058	GAC	2	6	20708	20713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017058	TC	3	6	20792	20797	0 %	50 %	0 %	50 %	383500950
527	NC_017058	ATTAT	2	10	20848	20857	40 %	60 %	0 %	0 %	383500950
528	NC_017058	A	6	6	20911	20916	100 %	0 %	0 %	0 %	383500950
529	NC_017058	GTA	2	6	20923	20928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500950
530	NC_017058	AT	3	6	20950	20955	50 %	50 %	0 %	0 %	383500950
531	NC_017058	A	7	7	21013	21019	100 %	0 %	0 %	0 %	383500950
532	NC_017058	TGTT	2	8	21030	21037	0 %	75 %	25 %	0 %	383500950
533	NC_017058	TCA	2	6	21184	21189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500950
534	NC_017058	AT	3	6	21241	21246	50 %	50 %	0 %	0 %	383500950
535	NC_017058	AAT	2	6	21247	21252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500950
536	NC_017058	ATC	2	6	21330	21335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500950
537	NC_017058	T	6	6	21456	21461	0 %	100 %	0 %	0 %	383500950
538	NC_017058	TAT	2	6	21503	21508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500950
539	NC_017058	AAAT	2	8	21563	21570	75 %	25 %	0 %	0 %	383500950
540	NC_017058	CTC	2	6	21677	21682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383500950
541	NC_017058	A	6	6	21693	21698	100 %	0 %	0 %	0 %	383500950
542	NC_017058	A	6	6	21736	21741	100 %	0 %	0 %	0 %	383500950
543	NC_017058	TAAAA	2	10	21815	21824	80 %	20 %	0 %	0 %	383500950
544	NC_017058	AGT	2	6	21837	21842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500950
545	NC_017058	TGT	2	6	21904	21909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383500950
546	NC_017058	TA	3	6	21957	21962	50 %	50 %	0 %	0 %	383500950
547	NC_017058	CTG	2	6	22052	22057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500950
548	NC_017058	ATA	2	6	22064	22069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500950
549	NC_017058	ATT	2	6	22089	22094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500950
550	NC_017058	ATG	2	6	22116	22121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500950
551	NC_017058	T	6	6	22374	22379	0 %	100 %	0 %	0 %	383500950
552	NC_017058	CTT	2	6	22390	22395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500950
553	NC_017058	A	6	6	22416	22421	100 %	0 %	0 %	0 %	383500950
554	NC_017058	CGC	2	6	22487	22492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383500950
555	NC_017058	TTTC	2	8	22622	22629	0 %	75 %	0 %	25 %	383500950
556	NC_017058	TTA	2	6	22660	22665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500950
557	NC_017058	CTT	2	6	22680	22685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500950
558	NC_017058	AGC	2	6	22704	22709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500950
559	NC_017058	CCG	2	6	22711	22716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383500950
560	NC_017058	TA	3	6	22727	22732	50 %	50 %	0 %	0 %	383500950
561	NC_017058	A	6	6	22755	22760	100 %	0 %	0 %	0 %	383500950
562	NC_017058	TCT	2	6	22881	22886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500950
563	NC_017058	TAAG	2	8	22931	22938	50 %	25 %	25 %	0 %	383500950
564	NC_017058	TCA	3	9	22972	22980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500950
565	NC_017058	TAA	2	6	23009	23014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500950
566	NC_017058	TAA	2	6	23019	23024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500950
567	NC_017058	TCTT	2	8	23094	23101	0 %	75 %	0 %	25 %	383500950
568	NC_017058	GCT	2	6	23122	23127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500950
569	NC_017058	ATTT	2	8	23173	23180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017058	GCT	2	6	23249	23254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017058	TTG	2	6	23264	23269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017058	T	6	6	23375	23380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017058	CTAC	2	8	23389	23396	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_017058	GTA	2	6	23473	23478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500951
575	NC_017058	TTA	2	6	23483	23488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500951
576	NC_017058	TTTA	2	8	23512	23519	25 %	75 %	0 %	0 %	383500951
577	NC_017058	ATATA	2	10	23553	23562	60 %	40 %	0 %	0 %	383500951
578	NC_017058	AGC	2	6	23578	23583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500951
579	NC_017058	AAAT	2	8	23616	23623	75 %	25 %	0 %	0 %	383500951
580	NC_017058	ATC	2	6	23627	23632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500951
581	NC_017058	GCA	2	6	23651	23656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500951
582	NC_017058	TACT	2	8	23664	23671	25 %	50 %	0 %	25 %	383500951
583	NC_017058	ATC	2	6	23678	23683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500951
584	NC_017058	A	6	6	23737	23742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017058	TTA	2	6	23825	23830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017058	CT	3	6	23850	23855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_017058	TAAT	2	8	23856	23863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017058	TCT	2	6	23864	23869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_017058	ATT	2	6	23878	23883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017058	ATC	2	6	23887	23892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017058	TAT	2	6	23931	23936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017058	TTG	2	6	24009	24014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017058	GTTAA	2	10	24020	24029	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017058	TAA	2	6	24034	24039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017058	T	6	6	24045	24050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017058	ATT	2	6	24091	24096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017058	TAA	2	6	24109	24114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017058	ATA	2	6	24131	24136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017058	A	8	8	24145	24152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017058	T	6	6	24204	24209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017058	AAC	2	6	24253	24258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017058	TAC	2	6	24262	24267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017058	ATA	3	9	24315	24323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017058	ATT	2	6	24326	24331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017058	T	6	6	24361	24366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017058	TA	4	8	24431	24438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017058	TAA	2	6	24475	24480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017058	AAT	2	6	24489	24494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017058	AAT	3	9	24503	24511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017058	AGC	2	6	24512	24517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017058	TGC	2	6	24543	24548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017058	ACT	2	6	24554	24559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017058	TAT	2	6	24566	24571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017058	GAA	2	6	24600	24605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017058	T	6	6	24620	24625	0 %	100 %	0 %	0 %	383500952
616	NC_017058	CTT	2	6	24671	24676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500952
617	NC_017058	CTA	2	6	24682	24687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500952
618	NC_017058	ACAT	2	8	24691	24698	50 %	25 %	0 %	25 %	383500952
619	NC_017058	AGT	2	6	24710	24715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500952
620	NC_017058	AAT	2	6	24789	24794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500952
621	NC_017058	CTT	2	6	24859	24864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500952
622	NC_017058	TCAA	2	8	24868	24875	50 %	25 %	0 %	25 %	383500952
623	NC_017058	ATA	2	6	24912	24917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500952
624	NC_017058	TAAT	2	8	24920	24927	50 %	50 %	0 %	0 %	383500952
625	NC_017058	TAA	2	6	24992	24997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500952
626	NC_017058	A	7	7	25014	25020	100 %	0 %	0 %	0 %	383500952
627	NC_017058	TAT	2	6	25070	25075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500952
628	NC_017058	TATT	2	8	25085	25092	25 %	75 %	0 %	0 %	383500952
629	NC_017058	GATTT	2	10	25155	25164	20 %	60 %	20 %	0 %	383500952
630	NC_017058	TGA	2	6	25195	25200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500952
631	NC_017058	T	6	6	25227	25232	0 %	100 %	0 %	0 %	383500952
632	NC_017058	ATT	2	6	25233	25238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500952
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634	NC_017058	T	6	6	25265	25270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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