MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 33435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017058	TAT	2	6	229348	229353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501146
6002	NC_017058	T	6	6	229379	229384	0 %	100 %	0 %	0 %	383501146
6003	NC_017058	ATA	2	6	229397	229402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_017058	AATGAT	2	12	229481	229492	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501147
6005	NC_017058	CTT	2	6	229638	229643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501147
6006	NC_017058	CTA	2	6	229650	229655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501147
6007	NC_017058	TA	3	6	229661	229666	50 %	50 %	0 %	0 %	383501147
6008	NC_017058	ATA	2	6	229701	229706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501147
6009	NC_017058	T	6	6	229732	229737	0 %	100 %	0 %	0 %	383501147
6010	NC_017058	TAA	2	6	229789	229794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501147
6011	NC_017058	TCA	2	6	229813	229818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501147
6012	NC_017058	TGAA	2	8	229827	229834	50 %	25 %	25 %	0 %	383501147
6013	NC_017058	TATT	2	8	229844	229851	25 %	75 %	0 %	0 %	383501147
6014	NC_017058	TAT	2	6	229885	229890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501147
6015	NC_017058	AAG	2	6	229944	229949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501147
6016	NC_017058	CGC	2	6	229999	230004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383501147
6017	NC_017058	TTTA	2	8	230036	230043	25 %	75 %	0 %	0 %	383501147
6018	NC_017058	ATG	2	6	230084	230089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501147
6019	NC_017058	AAT	2	6	230125	230130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501147
6020	NC_017058	A	6	6	230131	230136	100 %	0 %	0 %	0 %	383501147
6021	NC_017058	TAA	2	6	230143	230148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501147
6022	NC_017058	CGG	2	6	230278	230283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383501147
6023	NC_017058	TAA	2	6	230298	230303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501147
6024	NC_017058	AGCTAA	2	12	230350	230361	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501147
6025	NC_017058	TA	3	6	230406	230411	50 %	50 %	0 %	0 %	383501147
6026	NC_017058	GA	3	6	230552	230557	50 %	0 %	50 %	0 %	383501147
6027	NC_017058	TAT	2	6	230590	230595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501147
6028	NC_017058	GAAA	2	8	230677	230684	75 %	0 %	25 %	0 %	383501147
6029	NC_017058	A	6	6	230703	230708	100 %	0 %	0 %	0 %	383501147
6030	NC_017058	CAG	2	6	230710	230715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501147
6031	NC_017058	AG	3	6	230747	230752	50 %	0 %	50 %	0 %	383501147
6032	NC_017058	TTG	2	6	230796	230801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_017058	TG	3	6	230800	230805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_017058	GAG	2	6	230825	230830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_017058	A	7	7	230863	230869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_017058	T	6	6	230885	230890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_017058	TGA	2	6	230998	231003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501148
6038	NC_017058	AT	4	8	231011	231018	50 %	50 %	0 %	0 %	383501148
6039	NC_017058	CGG	2	6	231031	231036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383501148
6040	NC_017058	TTG	2	6	231069	231074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501148
6041	NC_017058	GTG	2	6	231108	231113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383501148
6042	NC_017058	TAT	2	6	231294	231299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501148
6043	NC_017058	AAT	2	6	231334	231339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501148
6044	NC_017058	AGG	2	6	231343	231348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383501148
6045	NC_017058	GCG	2	6	231351	231356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383501148
6046	NC_017058	GAA	2	6	231428	231433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501148
6047	NC_017058	TC	3	6	231460	231465	0 %	50 %	0 %	50 %	383501148
6048	NC_017058	T	6	6	231508	231513	0 %	100 %	0 %	0 %	383501148
6049	NC_017058	TAC	2	6	231559	231564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501148
6050	NC_017058	GTG	2	6	231584	231589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383501148
6051	NC_017058	TCA	2	6	231646	231651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501148
6052	NC_017058	ATGTA	2	10	231694	231703	40 %	40 %	20 %	0 %	383501148
6053	NC_017058	ATG	2	6	231732	231737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501148
6054	NC_017058	AAAAT	2	10	231795	231804	80 %	20 %	0 %	0 %	383501148
6055	NC_017058	TAA	2	6	231820	231825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501148
6056	NC_017058	A	6	6	231858	231863	100 %	0 %	0 %	0 %	383501148
6057	NC_017058	ACA	2	6	231874	231879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501148
6058	NC_017058	CTA	2	6	231882	231887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501148
6059	NC_017058	T	6	6	231897	231902	0 %	100 %	0 %	0 %	383501148
6060	NC_017058	TACA	2	8	231910	231917	50 %	25 %	0 %	25 %	383501148
6061	NC_017058	A	6	6	231964	231969	100 %	0 %	0 %	0 %	383501148
6062	NC_017058	AT	3	6	231979	231984	50 %	50 %	0 %	0 %	383501148
6063	NC_017058	AAGA	2	8	231995	232002	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_017058	A	6	6	232054	232059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_017058	TTAAAA	2	12	232079	232090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_017058	CTAC	2	8	232122	232129	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6067	NC_017058	AGT	2	6	232145	232150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_017058	TAA	2	6	232194	232199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_017058	GTT	2	6	232220	232225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501149
6070	NC_017058	TTTCT	2	10	232266	232275	0 %	80 %	0 %	20 %	383501149
6071	NC_017058	TTA	2	6	232291	232296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501149
6072	NC_017058	AT	4	8	232298	232305	50 %	50 %	0 %	0 %	383501149
6073	NC_017058	TCT	2	6	232318	232323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501149
6074	NC_017058	ATT	2	6	232359	232364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501149
6075	NC_017058	TTG	2	6	232413	232418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501149
6076	NC_017058	ATA	2	6	232420	232425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501149
6077	NC_017058	ATC	2	6	232437	232442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501149
6078	NC_017058	TAT	2	6	232520	232525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501149
6079	NC_017058	TAA	2	6	232560	232565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501149
6080	NC_017058	T	7	7	232609	232615	0 %	100 %	0 %	0 %	383501149
6081	NC_017058	TAA	2	6	232623	232628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501149
6082	NC_017058	TTCATT	2	12	232678	232689	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383501149
6083	NC_017058	CTT	2	6	232703	232708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501149
6084	NC_017058	TTC	2	6	232749	232754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501149
6085	NC_017058	T	6	6	232773	232778	0 %	100 %	0 %	0 %	383501149
6086	NC_017058	CTC	2	6	232785	232790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383501149
6087	NC_017058	TAACAT	2	12	232892	232903	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383501149
6088	NC_017058	TAC	2	6	232964	232969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501149
6089	NC_017058	TAC	2	6	232974	232979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501149
6090	NC_017058	ACC	2	6	232998	233003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383501149
6091	NC_017058	CTTT	2	8	233077	233084	0 %	75 %	0 %	25 %	383501149
6092	NC_017058	GTT	2	6	233120	233125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501149
6093	NC_017058	ACTT	2	8	233142	233149	25 %	50 %	0 %	25 %	383501149
6094	NC_017058	T	8	8	233174	233181	0 %	100 %	0 %	0 %	383501149
6095	NC_017058	T	6	6	233298	233303	0 %	100 %	0 %	0 %	383501149
6096	NC_017058	TTC	2	6	233330	233335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501149
6097	NC_017058	TAT	2	6	233340	233345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501149
6098	NC_017058	T	6	6	233370	233375	0 %	100 %	0 %	0 %	383501149
6099	NC_017058	T	6	6	233427	233432	0 %	100 %	0 %	0 %	383501149
6100	NC_017058	ATCT	2	8	233466	233473	25 %	50 %	0 %	25 %	383501149
6101	NC_017058	T	6	6	233518	233523	0 %	100 %	0 %	0 %	383501149
6102	NC_017058	TAA	2	6	233543	233548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_017058	GTC	2	6	233684	233689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_017058	ACTA	2	8	233703	233710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6105	NC_017058	CTT	2	6	233765	233770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_017058	TAA	2	6	233788	233793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_017058	ATT	2	6	233822	233827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_017058	T	6	6	233856	233861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_017058	TAA	2	6	233900	233905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_017058	ATC	2	6	233954	233959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_017058	TCA	2	6	233970	233975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_017058	TAG	2	6	234093	234098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_017058	TAT	2	6	234132	234137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_017058	ATG	2	6	234139	234144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_017058	ATA	3	9	234169	234177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_017058	T	6	6	234193	234198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_017058	ATA	2	6	234275	234280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_017058	TTGC	2	8	234329	234336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6119	NC_017058	T	6	6	234343	234348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_017058	CTT	2	6	234354	234359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_017058	GAG	2	6	234427	234432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_017058	TAA	2	6	234435	234440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_017058	A	9	9	234457	234465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_017058	AT	3	6	234467	234472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_017058	ATTAT	2	10	234479	234488	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_017058	T	6	6	234488	234493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_017058	AGAT	2	8	234511	234518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_017058	GTT	2	6	234590	234595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6500	NC_017058	AAG	2	6	249542	249547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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