MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 33435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017058	TA	3	6	191130	191135	50 %	50 %	0 %	0 %	383501104
5002	NC_017058	ATT	2	6	191144	191149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501104
5003	NC_017058	AATT	2	8	191167	191174	50 %	50 %	0 %	0 %	383501104
5004	NC_017058	T	7	7	191178	191184	0 %	100 %	0 %	0 %	383501104
5005	NC_017058	TAA	2	6	191187	191192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501104
5006	NC_017058	TA	3	6	191224	191229	50 %	50 %	0 %	0 %	383501104
5007	NC_017058	CTT	2	6	191241	191246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501104
5008	NC_017058	TAT	2	6	191247	191252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501104
5009	NC_017058	AGTT	2	8	191314	191321	25 %	50 %	25 %	0 %	383501104
5010	NC_017058	TTA	2	6	191363	191368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501104
5011	NC_017058	TTA	2	6	191384	191389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501104
5012	NC_017058	AT	4	8	191392	191399	50 %	50 %	0 %	0 %	383501104
5013	NC_017058	TAC	2	6	191422	191427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501104
5014	NC_017058	ATT	2	6	191459	191464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501104
5015	NC_017058	ATA	2	6	191474	191479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501104
5016	NC_017058	CTG	2	6	191484	191489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501104
5017	NC_017058	T	6	6	191491	191496	0 %	100 %	0 %	0 %	383501104
5018	NC_017058	TTA	2	6	191528	191533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501104
5019	NC_017058	ATT	2	6	191566	191571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501104
5020	NC_017058	AGA	2	6	191626	191631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501104
5021	NC_017058	TA	3	6	191632	191637	50 %	50 %	0 %	0 %	383501104
5022	NC_017058	ATT	2	6	191695	191700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501104
5023	NC_017058	TAAT	2	8	191721	191728	50 %	50 %	0 %	0 %	383501104
5024	NC_017058	ATT	2	6	191746	191751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501104
5025	NC_017058	ATAGAT	2	12	191752	191763	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501104
5026	NC_017058	TTA	2	6	191778	191783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501104
5027	NC_017058	AATA	2	8	191794	191801	75 %	25 %	0 %	0 %	383501104
5028	NC_017058	GAA	2	6	191833	191838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501104
5029	NC_017058	ATACT	2	10	191898	191907	40 %	40 %	0 %	20 %	383501104
5030	NC_017058	AGC	2	6	191933	191938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501104
5031	NC_017058	T	6	6	191948	191953	0 %	100 %	0 %	0 %	383501104
5032	NC_017058	AGC	2	6	191972	191977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501104
5033	NC_017058	ATA	2	6	192031	192036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017058	A	6	6	192036	192041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017058	T	6	6	192050	192055	0 %	100 %	0 %	0 %	383501105
5036	NC_017058	ATA	2	6	192085	192090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501105
5037	NC_017058	TTA	2	6	192113	192118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501105
5038	NC_017058	TAT	2	6	192119	192124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501105
5039	NC_017058	AATT	2	8	192141	192148	50 %	50 %	0 %	0 %	383501105
5040	NC_017058	ATA	2	6	192244	192249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501105
5041	NC_017058	AAATA	2	10	192293	192302	80 %	20 %	0 %	0 %	383501105
5042	NC_017058	GCT	2	6	192330	192335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501105
5043	NC_017058	TATT	2	8	192368	192375	25 %	75 %	0 %	0 %	383501105
5044	NC_017058	TAT	2	6	192471	192476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501105
5045	NC_017058	TAT	2	6	192494	192499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501105
5046	NC_017058	ATTT	2	8	192512	192519	25 %	75 %	0 %	0 %	383501105
5047	NC_017058	AT	3	6	192564	192569	50 %	50 %	0 %	0 %	383501105
5048	NC_017058	AT	4	8	192580	192587	50 %	50 %	0 %	0 %	383501105
5049	NC_017058	AAAAC	2	10	192609	192618	80 %	0 %	0 %	20 %	383501105
5050	NC_017058	ATT	2	6	192622	192627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501105
5051	NC_017058	A	6	6	192631	192636	100 %	0 %	0 %	0 %	383501105
5052	NC_017058	A	6	6	192710	192715	100 %	0 %	0 %	0 %	383501105
5053	NC_017058	CAT	2	6	192723	192728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501105
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5055	NC_017058	AT	4	8	192854	192861	50 %	50 %	0 %	0 %	383501106
5056	NC_017058	ATAA	2	8	192932	192939	75 %	25 %	0 %	0 %	383501106
5057	NC_017058	AT	3	6	193037	193042	50 %	50 %	0 %	0 %	383501106
5058	NC_017058	TAA	3	9	193093	193101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501106
5059	NC_017058	GAC	2	6	193116	193121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501106
5060	NC_017058	T	7	7	193144	193150	0 %	100 %	0 %	0 %	383501106
5061	NC_017058	T	6	6	193184	193189	0 %	100 %	0 %	0 %	383501106
5062	NC_017058	ACA	2	6	193192	193197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501106
5063	NC_017058	AAATC	2	10	193331	193340	60 %	20 %	0 %	20 %	383501106
5064	NC_017058	ATT	2	6	193402	193407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501106
5065	NC_017058	GTTTA	2	10	193499	193508	20 %	60 %	20 %	0 %	383501106
5066	NC_017058	ATT	2	6	193511	193516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501107
5067	NC_017058	TAC	2	6	193579	193584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501107
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5073	NC_017058	GAA	2	6	193693	193698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501107
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5081	NC_017058	GATAAA	2	12	194238	194249	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017058	ATTA	2	8	194281	194288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017058	TAA	2	6	194295	194300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501108
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5090	NC_017058	TAA	2	6	194592	194597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017058	AAG	2	6	194612	194617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017058	AG	3	6	194623	194628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017058	TA	3	6	194679	194684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017058	GAT	2	6	194729	194734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501109
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5097	NC_017058	ATA	2	6	194844	194849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017058	AGCTT	2	10	194867	194876	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5099	NC_017058	T	7	7	194878	194884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017058	ATT	2	6	194896	194901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501110
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5106	NC_017058	AG	3	6	195060	195065	50 %	0 %	50 %	0 %	383501110
5107	NC_017058	TTA	2	6	195078	195083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501110
5108	NC_017058	GTT	2	6	195122	195127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501110
5109	NC_017058	TGA	2	6	195175	195180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501110
5110	NC_017058	A	6	6	195202	195207	100 %	0 %	0 %	0 %	383501110
5111	NC_017058	TAA	2	6	195220	195225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017058	CAG	2	6	195240	195245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_017058	ACA	2	6	195319	195324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_017058	GAA	2	6	195382	195387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017058	TGC	2	6	195416	195421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_017058	AAT	2	6	195516	195521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017058	GTAT	2	8	195682	195689	25 %	50 %	25 %	0 %	383501111
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5120	NC_017058	AGA	2	6	195873	195878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501112
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5122	NC_017058	TA	3	6	195952	195957	50 %	50 %	0 %	0 %	383501112
5123	NC_017058	A	7	7	195962	195968	100 %	0 %	0 %	0 %	383501112
5124	NC_017058	TTATA	2	10	195969	195978	40 %	60 %	0 %	0 %	383501113
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5126	NC_017058	AT	3	6	196049	196054	50 %	50 %	0 %	0 %	383501113
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