MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. RpGvF24 chromosome

Total Repeats: 30217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017057	TAC	2	6	148225	148230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500211
4003	NC_017057	GAA	2	6	148278	148283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500211
4004	NC_017057	TTA	2	6	148285	148290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500211
4005	NC_017057	AGA	2	6	148301	148306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500211
4006	NC_017057	TAA	2	6	148310	148315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500211
4007	NC_017057	TAA	3	9	148321	148329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500211
4008	NC_017057	A	6	6	148332	148337	100 %	0 %	0 %	0 %	383500211
4009	NC_017057	ATCT	2	8	148345	148352	25 %	50 %	0 %	25 %	383500211
4010	NC_017057	ATA	2	6	148363	148368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500211
4011	NC_017057	GAA	2	6	148389	148394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500211
4012	NC_017057	A	7	7	148400	148406	100 %	0 %	0 %	0 %	383500211
4013	NC_017057	TAAT	2	8	148441	148448	50 %	50 %	0 %	0 %	383500211
4014	NC_017057	TGA	2	6	148451	148456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500211
4015	NC_017057	AGA	2	6	148457	148462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500211
4016	NC_017057	TAA	2	6	148486	148491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500211
4017	NC_017057	GAT	2	6	148515	148520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500211
4018	NC_017057	TAT	2	6	148537	148542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500211
4019	NC_017057	A	6	6	148554	148559	100 %	0 %	0 %	0 %	383500211
4020	NC_017057	GT	3	6	148606	148611	0 %	50 %	50 %	0 %	383500211
4021	NC_017057	ACTT	2	8	148652	148659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4022	NC_017057	TAAGC	2	10	148701	148710	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4023	NC_017057	TAAAT	2	10	148722	148731	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017057	ATGA	2	8	148739	148746	50 %	25 %	25 %	0 %	383500212
4025	NC_017057	ATA	2	6	148784	148789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500212
4026	NC_017057	A	9	9	148829	148837	100 %	0 %	0 %	0 %	383500212
4027	NC_017057	GCTA	2	8	148858	148865	25 %	25 %	25 %	25 %	383500212
4028	NC_017057	GTA	2	6	148944	148949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500212
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4030	NC_017057	AG	4	8	149016	149023	50 %	0 %	50 %	0 %	383500212
4031	NC_017057	TA	3	6	149075	149080	50 %	50 %	0 %	0 %	383500212
4032	NC_017057	ACAAA	2	10	149108	149117	80 %	0 %	0 %	20 %	383500212
4033	NC_017057	ACT	2	6	149239	149244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500212
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4038	NC_017057	TGA	2	6	149419	149424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500212
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4040	NC_017057	ATAG	2	8	149475	149482	50 %	25 %	25 %	0 %	383500212
4041	NC_017057	ATC	2	6	149487	149492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_017057	ATA	2	6	149527	149532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017057	T	6	6	149551	149556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017057	TAT	2	6	149597	149602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017057	TAAAA	2	10	149625	149634	80 %	20 %	0 %	0 %	383500213
4046	NC_017057	TAA	2	6	149646	149651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500213
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4049	NC_017057	T	6	6	149740	149745	0 %	100 %	0 %	0 %	383500213
4050	NC_017057	TGGTG	2	10	149759	149768	0 %	40 %	60 %	0 %	383500213
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4057	NC_017057	TTA	2	6	149980	149985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500213
4058	NC_017057	T	6	6	150038	150043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017057	TGAAA	2	10	150075	150084	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017057	TAA	2	6	150096	150101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4062	NC_017057	AT	3	6	150156	150161	50 %	50 %	0 %	0 %	383500214
4063	NC_017057	CAT	2	6	150219	150224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500214
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4076	NC_017057	TTAAG	2	10	150611	150620	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4078	NC_017057	TATAA	2	10	150676	150685	60 %	40 %	0 %	0 %	383500215
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4096	NC_017057	TTA	2	6	151430	151435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500215
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4108	NC_017057	TGA	2	6	152355	152360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500215
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4112	NC_017057	TTTA	2	8	152473	152480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017057	AAC	2	6	152494	152499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_017057	T	6	6	152518	152523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4117	NC_017057	A	6	6	152555	152560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017057	TA	3	6	152561	152566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017057	TATT	2	8	152583	152590	25 %	75 %	0 %	0 %	383500216
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4245	NC_017057	TAA	2	6	157575	157580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_017057	TAAA	2	8	157586	157593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_017057	CTT	2	6	157629	157634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4248	NC_017057	TTA	2	6	157663	157668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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