MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. RpGvF24 chromosome

Total Repeats: 30217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017057	AGATA	2	10	18449	18458	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017057	ATT	2	6	18460	18465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017057	TCAAA	2	10	18479	18488	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
504	NC_017057	CAT	2	6	18501	18506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017057	AATTAT	2	12	18537	18548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017057	TAT	3	9	18563	18571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017057	TA	3	6	18616	18621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017057	AAT	2	6	18669	18674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017057	AT	3	6	18673	18678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017057	TAA	2	6	18734	18739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017057	TTA	2	6	18808	18813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017057	ATA	2	6	18823	18828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017057	TAT	2	6	18890	18895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017057	AAT	2	6	18906	18911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017057	TAA	2	6	18914	18919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017057	ATT	2	6	18935	18940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017057	TAAA	2	8	18944	18951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017057	TCA	2	6	18963	18968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017057	ATA	2	6	19084	19089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017057	ACC	2	6	19134	19139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_017057	ATA	2	6	19231	19236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017057	TAA	2	6	19244	19249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017057	AAG	2	6	19266	19271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017057	TTA	2	6	19308	19313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017057	ATTTA	2	10	19318	19327	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017057	CTT	2	6	19382	19387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017057	TATT	2	8	19388	19395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017057	ATCTAA	2	12	19397	19408	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
529	NC_017057	ATT	2	6	19409	19414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017057	TAG	2	6	19445	19450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017057	AGTTT	2	10	19516	19525	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017057	A	6	6	19548	19553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017057	GTAA	2	8	19562	19569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017057	AAT	2	6	19574	19579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017057	TTAT	2	8	19640	19647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017057	TCAA	2	8	19672	19679	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
537	NC_017057	AT	3	6	19681	19686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017057	CAT	2	6	19732	19737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017057	TATAA	2	10	19749	19758	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017057	GTAA	2	8	19841	19848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017057	TA	3	6	19868	19873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017057	AT	3	6	19881	19886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017057	TAG	2	6	19901	19906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017057	GTA	2	6	20025	20030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017057	TAA	2	6	20031	20036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017057	ATAG	2	8	20076	20083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017057	AAT	2	6	20108	20113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017057	A	8	8	20121	20128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017057	A	8	8	20144	20151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017057	ATTA	2	8	20180	20187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017057	GAA	2	6	20208	20213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017057	TAA	2	6	20226	20231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017057	A	9	9	20237	20245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017057	TAG	2	6	20246	20251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017057	AGT	2	6	20339	20344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017057	TAT	2	6	20400	20405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017057	A	6	6	20416	20421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017057	AAT	2	6	20427	20432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017057	TA	3	6	20437	20442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017057	AT	3	6	20533	20538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017057	AATCT	2	10	20559	20568	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
562	NC_017057	ATT	2	6	20586	20591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017057	AAG	2	6	20645	20650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017057	GTT	2	6	20675	20680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017057	AAT	2	6	20712	20717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017057	ATCA	2	8	20742	20749	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
567	NC_017057	ATA	2	6	20772	20777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017057	TA	3	6	20858	20863	50 %	50 %	0 %	0 %	383500114
569	NC_017057	TCT	2	6	20905	20910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500114
570	NC_017057	TAAAA	2	10	20920	20929	80 %	20 %	0 %	0 %	383500114
571	NC_017057	ATC	2	6	20935	20940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500114
572	NC_017057	A	6	6	21019	21024	100 %	0 %	0 %	0 %	383500114
573	NC_017057	T	6	6	21031	21036	0 %	100 %	0 %	0 %	383500114
574	NC_017057	A	8	8	21038	21045	100 %	0 %	0 %	0 %	383500114
575	NC_017057	A	6	6	21082	21087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017057	TGA	2	6	21094	21099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017057	AACA	2	8	21103	21110	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_017057	GTAT	2	8	21142	21149	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017057	T	6	6	21255	21260	0 %	100 %	0 %	0 %	383500115
580	NC_017057	TCA	2	6	21308	21313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500115
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583	NC_017057	TTC	2	6	21400	21405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500115
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585	NC_017057	TCT	2	6	21455	21460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500115
586	NC_017057	TTTGTA	2	12	21489	21500	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383500115
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588	NC_017057	TCT	2	6	21530	21535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500115
589	NC_017057	T	6	6	21541	21546	0 %	100 %	0 %	0 %	383500115
590	NC_017057	T	7	7	21607	21613	0 %	100 %	0 %	0 %	383500115
591	NC_017057	TAAAT	2	10	21623	21632	60 %	40 %	0 %	0 %	383500115
592	NC_017057	ATT	2	6	21686	21691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500115
593	NC_017057	T	7	7	21703	21709	0 %	100 %	0 %	0 %	383500116
594	NC_017057	GTA	2	6	21710	21715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500116
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596	NC_017057	AAT	2	6	21750	21755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500116
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599	NC_017057	TGAT	2	8	21835	21842	25 %	50 %	25 %	0 %	383500116
600	NC_017057	T	8	8	21871	21878	0 %	100 %	0 %	0 %	383500116
601	NC_017057	T	6	6	21908	21913	0 %	100 %	0 %	0 %	383500116
602	NC_017057	T	7	7	21915	21921	0 %	100 %	0 %	0 %	383500116
603	NC_017057	TTTGT	2	10	21940	21949	0 %	80 %	20 %	0 %	383500116
604	NC_017057	TCT	2	6	21988	21993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500116
605	NC_017057	AGC	2	6	21999	22004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500116
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607	NC_017057	TTC	2	6	22053	22058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500116
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609	NC_017057	AAT	2	6	22133	22138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500116
610	NC_017057	TATCAA	2	12	22142	22153	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383500116
611	NC_017057	A	6	6	22181	22186	100 %	0 %	0 %	0 %	383500117
612	NC_017057	A	6	6	22211	22216	100 %	0 %	0 %	0 %	383500117
613	NC_017057	AG	3	6	22306	22311	50 %	0 %	50 %	0 %	383500117
614	NC_017057	TAAT	2	8	22415	22422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017057	CAT	2	6	22451	22456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500118
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619	NC_017057	AACT	2	8	22649	22656	50 %	25 %	0 %	25 %	383500118
620	NC_017057	A	7	7	22729	22735	100 %	0 %	0 %	0 %	383500118
621	NC_017057	A	6	6	22741	22746	100 %	0 %	0 %	0 %	383500118
622	NC_017057	TAG	2	6	22829	22834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500118
623	NC_017057	AATAA	2	10	22873	22882	80 %	20 %	0 %	0 %	383500118
624	NC_017057	AAAT	2	8	22883	22890	75 %	25 %	0 %	0 %	383500118
625	NC_017057	CACT	2	8	22979	22986	25 %	25 %	0 %	50 %	383500118
626	NC_017057	AAGT	2	8	23032	23039	50 %	25 %	25 %	0 %	383500118
627	NC_017057	GTA	2	6	23050	23055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500118
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629	NC_017057	TAT	2	6	23206	23211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500119
630	NC_017057	ATA	2	6	23219	23224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500119
631	NC_017057	CTA	2	6	23280	23285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500119
632	NC_017057	T	6	6	23328	23333	0 %	100 %	0 %	0 %	383500119
633	NC_017057	TTAGAA	2	12	23342	23353	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383500119
634	NC_017057	ATTA	2	8	23414	23421	50 %	50 %	0 %	0 %	383500119
635	NC_017057	TTA	3	9	23461	23469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500120
636	NC_017057	ATTT	2	8	23473	23480	25 %	75 %	0 %	0 %	383500120
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