MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP chromosome

Total Repeats: 1193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017056	TTAAT	2	10	1880	1889	40 %	60 %	0 %	0 %	383499259
2	NC_017056	TTTTA	2	10	2441	2450	20 %	80 %	0 %	0 %	383499260
3	NC_017056	ATTTA	2	10	2794	2803	40 %	60 %	0 %	0 %	383499260
4	NC_017056	GCAAA	2	10	3251	3260	60 %	0 %	20 %	20 %	383499261
5	NC_017056	TAAAT	2	10	4735	4744	60 %	40 %	0 %	0 %	383499261
6	NC_017056	GTAGT	2	10	5046	5055	20 %	40 %	40 %	0 %	383499261
7	NC_017056	AATGC	2	10	5707	5716	40 %	20 %	20 %	20 %	383499261
8	NC_017056	AATAC	2	10	6935	6944	60 %	20 %	0 %	20 %	383499262
9	NC_017056	AAACC	2	10	8104	8113	60 %	0 %	0 %	40 %	383499264
10	NC_017056	TGACT	2	10	8807	8816	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017056	GATAC	2	10	8991	9000	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017056	ATTTA	2	10	9350	9359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017056	TTAAT	2	10	10607	10616	40 %	60 %	0 %	0 %	383499265
14	NC_017056	ACAAT	2	10	11056	11065	60 %	20 %	0 %	20 %	383499266
15	NC_017056	TAAAC	2	10	14654	14663	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017056	TCAAT	2	10	15899	15908	40 %	40 %	0 %	20 %	383499270
17	NC_017056	AATCA	2	10	16122	16131	60 %	20 %	0 %	20 %	383499271
18	NC_017056	TTACT	2	10	17221	17230	20 %	60 %	0 %	20 %	383499271
19	NC_017056	AGATA	2	10	18456	18465	60 %	20 %	20 %	0 %	383499272
20	NC_017056	TCAAA	2	10	18486	18495	60 %	20 %	0 %	20 %	383499272
21	NC_017056	ATTTA	2	10	19324	19333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017056	AGTTT	2	10	19522	19531	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017056	TATAA	2	10	19755	19764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017056	AATCT	2	10	20567	20576	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017056	TAAAA	2	10	20928	20937	80 %	20 %	0 %	0 %	383499273
26	NC_017056	TTTGT	2	10	21440	21449	0 %	80 %	20 %	0 %	383499274
27	NC_017056	TAAAT	2	10	21631	21640	60 %	40 %	0 %	0 %	383499274
28	NC_017056	TTTGT	2	10	21948	21957	0 %	80 %	20 %	0 %	383499275
29	NC_017056	AATAA	2	10	22881	22890	80 %	20 %	0 %	0 %	383499277
30	NC_017056	CTATA	2	10	23540	23549	40 %	40 %	0 %	20 %	383499279
31	NC_017056	TAATA	2	10	23763	23772	60 %	40 %	0 %	0 %	383499279
32	NC_017056	CCATA	2	10	27824	27833	40 %	20 %	0 %	40 %	383499282
33	NC_017056	TTGAG	2	10	28487	28496	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017056	ATTTT	2	10	29208	29217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017056	TATTT	2	10	29784	29793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017056	GTTTC	2	10	30302	30311	0 %	60 %	20 %	20 %	383499283
37	NC_017056	ATATT	2	10	31070	31079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017056	ATTAA	2	10	31702	31711	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017056	CTTAA	2	10	32056	32065	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017056	ATTTA	2	10	32193	32202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017056	AAATT	2	10	32776	32785	60 %	40 %	0 %	0 %	383499284
42	NC_017056	TTTTA	2	10	33606	33615	20 %	80 %	0 %	0 %	383499285
43	NC_017056	TTGAT	2	10	39557	39566	20 %	60 %	20 %	0 %	383499289
44	NC_017056	AATTG	2	10	39591	39600	40 %	40 %	20 %	0 %	383499289
45	NC_017056	ATATG	2	10	39750	39759	40 %	40 %	20 %	0 %	383499289
46	NC_017056	ATTAT	2	10	40657	40666	40 %	60 %	0 %	0 %	383499289
47	NC_017056	GTATT	2	10	41428	41437	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017056	ATAAC	2	10	43782	43791	60 %	20 %	0 %	20 %	383499291
49	NC_017056	TAACA	2	10	44011	44020	60 %	20 %	0 %	20 %	383499291
50	NC_017056	TTTAA	2	10	44147	44156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017056	AATTG	2	10	46059	46068	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017056	AATAT	2	10	46190	46199	60 %	40 %	0 %	0 %	383499295
53	NC_017056	TACCT	2	10	47331	47340	20 %	40 %	0 %	40 %	383499295
54	NC_017056	TGGTA	2	10	48851	48860	20 %	40 %	40 %	0 %	383499296
55	NC_017056	AAATT	2	10	50902	50911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017056	AACTA	2	10	51751	51760	60 %	20 %	0 %	20 %	383499298
57	NC_017056	ACTTT	2	10	53189	53198	20 %	60 %	0 %	20 %	383499300
58	NC_017056	TTAAA	2	10	54106	54115	60 %	40 %	0 %	0 %	383499300
59	NC_017056	AATAT	2	10	54158	54167	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017056	CAAGT	2	10	54488	54497	40 %	20 %	20 %	20 %	383499301
61	NC_017056	CTATG	2	10	55335	55344	20 %	40 %	20 %	20 %	383499301
62	NC_017056	GCTAA	2	10	56346	56355	40 %	20 %	20 %	20 %	383499302
63	NC_017056	TTTAC	2	10	58697	58706	20 %	60 %	0 %	20 %	383499305
64	NC_017056	AGCAT	2	10	58722	58731	40 %	20 %	20 %	20 %	383499305
65	NC_017056	GGGTT	2	10	60283	60292	0 %	40 %	60 %	0 %	383499306
66	NC_017056	TTTAT	2	10	60659	60668	20 %	80 %	0 %	0 %	383499306
67	NC_017056	GTTTT	2	10	61850	61859	0 %	80 %	20 %	0 %	383499307
68	NC_017056	ACAAT	2	10	62330	62339	60 %	20 %	0 %	20 %	383499308
69	NC_017056	TTTTC	2	10	62718	62727	0 %	80 %	0 %	20 %	383499308
70	NC_017056	CAATG	2	10	65610	65619	40 %	20 %	20 %	20 %	383499311
71	NC_017056	ATAAA	2	10	66025	66034	80 %	20 %	0 %	0 %	383499312
72	NC_017056	TAAAT	2	10	66431	66440	60 %	40 %	0 %	0 %	383499312
73	NC_017056	ATTAA	2	10	66779	66788	60 %	40 %	0 %	0 %	383499312
74	NC_017056	ATATT	2	10	69962	69971	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017056	TAACA	2	10	70263	70272	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017056	AATGA	2	10	70305	70314	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017056	ACAAA	2	10	71907	71916	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017056	TTAAT	2	10	74818	74827	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017056	TGAAA	2	10	77672	77681	60 %	20 %	20 %	0 %	383499320
80	NC_017056	TTGAT	2	10	78999	79008	20 %	60 %	20 %	0 %	383499321
81	NC_017056	ATATA	2	10	79634	79643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017056	TTGTA	2	10	79755	79764	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017056	AAAAT	2	10	80522	80531	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017056	ATTTA	2	10	80845	80854	40 %	60 %	0 %	0 %	383499323
85	NC_017056	TTAGT	2	10	85841	85850	20 %	60 %	20 %	0 %	383499329
86	NC_017056	TTAAT	2	10	88052	88061	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017056	TTATT	2	10	89073	89082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017056	TTAAC	2	10	89097	89106	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017056	ATATT	2	10	89340	89349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017056	TCTTT	2	10	90180	90189	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017056	TTTAA	2	10	90591	90600	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017056	TCCTT	2	10	91065	91074	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017056	ATTGT	2	10	91143	91152	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017056	TACTT	2	10	93562	93571	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017056	TTATG	2	10	94493	94502	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017056	TTATG	2	10	96424	96433	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017056	AGTTA	2	10	96465	96474	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017056	TCTAT	2	10	98537	98546	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017056	ATAAA	2	10	101058	101067	80 %	20 %	0 %	0 %	383499336
100	NC_017056	TATAA	2	10	101092	101101	60 %	40 %	0 %	0 %	383499336
101	NC_017056	TAAAA	2	10	103309	103318	80 %	20 %	0 %	0 %	383499339
102	NC_017056	AAAAC	2	10	104005	104014	80 %	0 %	0 %	20 %	383499339
103	NC_017056	TTTAA	2	10	104081	104090	40 %	60 %	0 %	0 %	383499339
104	NC_017056	TGAAA	2	10	105531	105540	60 %	20 %	20 %	0 %	383499341
105	NC_017056	CTTGT	2	10	108299	108308	0 %	60 %	20 %	20 %	383499343
106	NC_017056	ATGAT	2	10	109216	109225	40 %	40 %	20 %	0 %	383499344
107	NC_017056	TTAAT	2	10	109892	109901	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017056	ATTTT	2	10	109946	109955	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017056	TTATT	2	10	110115	110124	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017056	AGTAG	2	10	111887	111896	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017056	CACTA	2	10	112148	112157	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017056	AATAC	2	10	112292	112301	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017056	AAATC	2	10	112426	112435	60 %	20 %	0 %	20 %	383499348
114	NC_017056	TTATA	2	10	113732	113741	40 %	60 %	0 %	0 %	383499349
115	NC_017056	GTAAT	2	10	113870	113879	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017056	TGCTT	2	10	114237	114246	0 %	60 %	20 %	20 %	383499350
117	NC_017056	TTTTA	2	10	115354	115363	20 %	80 %	0 %	0 %	383499350
118	NC_017056	GCTTT	2	10	116930	116939	0 %	60 %	20 %	20 %	383499351
119	NC_017056	TATGT	2	10	117583	117592	20 %	60 %	20 %	0 %	383499351
120	NC_017056	TCTAC	2	10	117928	117937	20 %	40 %	0 %	40 %	383499351
121	NC_017056	AGAAA	2	10	119454	119463	80 %	0 %	20 %	0 %	383499351
122	NC_017056	GTTTT	2	10	120139	120148	0 %	80 %	20 %	0 %	383499352
123	NC_017056	TGCAG	2	10	120472	120481	20 %	20 %	40 %	20 %	383499352
124	NC_017056	GGTAT	2	10	121169	121178	20 %	40 %	40 %	0 %	383499352
125	NC_017056	ATCTA	2	10	122347	122356	40 %	40 %	0 %	20 %	383499353
126	NC_017056	GTTTG	2	10	122778	122787	0 %	60 %	40 %	0 %	383499353
127	NC_017056	ACAAG	2	10	124733	124742	60 %	0 %	20 %	20 %	383499353
128	NC_017056	AGTTT	2	10	125044	125053	20 %	60 %	20 %	0 %	383499354
129	NC_017056	TTAGT	2	10	125567	125576	20 %	60 %	20 %	0 %	383499354
130	NC_017056	GTTAT	2	10	126968	126977	20 %	60 %	20 %	0 %	383499354
131	NC_017056	ATGGT	2	10	128109	128118	20 %	40 %	40 %	0 %	383499355
132	NC_017056	TATTT	2	10	129043	129052	20 %	80 %	0 %	0 %	383499355
133	NC_017056	CAAAG	2	10	129435	129444	60 %	0 %	20 %	20 %	383499355
134	NC_017056	GAACA	2	10	129845	129854	60 %	0 %	20 %	20 %	383499355
135	NC_017056	TGATA	2	10	130821	130830	40 %	40 %	20 %	0 %	383499355
136	NC_017056	TGTAT	2	10	135488	135497	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017056	TTTAA	2	10	136553	136562	40 %	60 %	0 %	0 %	383499361
138	NC_017056	GGTTT	2	10	137671	137680	0 %	60 %	40 %	0 %	383499362
139	NC_017056	TATGT	2	10	141778	141787	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017056	ATTAA	2	10	142029	142038	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017056	TATCA	2	10	143548	143557	40 %	40 %	0 %	20 %	383499367
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