MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP chromosome

Total Repeats: 30186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017056	AT	3	6	111256	111261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017056	ATTT	2	8	111270	111277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017056	GGTGTT	2	12	111333	111344	0 %	50 %	50 %	0 %	383499346
3004	NC_017056	TAA	2	6	111353	111358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499346
3005	NC_017056	AGA	2	6	111384	111389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499346
3006	NC_017056	TA	3	6	111445	111450	50 %	50 %	0 %	0 %	383499346
3007	NC_017056	AT	3	6	111509	111514	50 %	50 %	0 %	0 %	383499346
3008	NC_017056	ATG	2	6	111526	111531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499346
3009	NC_017056	A	6	6	111565	111570	100 %	0 %	0 %	0 %	383499346
3010	NC_017056	AGC	2	6	111584	111589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383499346
3011	NC_017056	GTA	2	6	111749	111754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499347
3012	NC_017056	AATC	2	8	111755	111762	50 %	25 %	0 %	25 %	383499347
3013	NC_017056	TAA	2	6	111763	111768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499347
3014	NC_017056	TAA	2	6	111784	111789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499347
3015	NC_017056	TCTT	2	8	111802	111809	0 %	75 %	0 %	25 %	383499347
3016	NC_017056	AAGA	2	8	111818	111825	75 %	0 %	25 %	0 %	383499347
3017	NC_017056	AGTAG	2	10	111887	111896	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017056	CTA	2	6	111908	111913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_017056	ATA	2	6	111922	111927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017056	TAG	2	6	112057	112062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017056	TGA	2	6	112073	112078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017056	CACTA	2	10	112148	112157	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3023	NC_017056	CATA	2	8	112267	112274	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3024	NC_017056	AATAC	2	10	112292	112301	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3025	NC_017056	TA	3	6	112323	112328	50 %	50 %	0 %	0 %	383499348
3026	NC_017056	TAA	2	6	112333	112338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499348
3027	NC_017056	ATA	2	6	112353	112358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499348
3028	NC_017056	A	6	6	112358	112363	100 %	0 %	0 %	0 %	383499348
3029	NC_017056	GATT	2	8	112366	112373	25 %	50 %	25 %	0 %	383499348
3030	NC_017056	TCA	2	6	112390	112395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499348
3031	NC_017056	AAATC	2	10	112426	112435	60 %	20 %	0 %	20 %	383499348
3032	NC_017056	TTG	2	6	112464	112469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383499348
3033	NC_017056	ATA	2	6	112496	112501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499348
3034	NC_017056	TAA	3	9	112513	112521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499348
3035	NC_017056	TTA	2	6	112593	112598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499348
3036	NC_017056	TTA	2	6	112672	112677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499348
3037	NC_017056	GTTA	2	8	112702	112709	25 %	50 %	25 %	0 %	383499348
3038	NC_017056	AAG	2	6	112726	112731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499348
3039	NC_017056	AAG	2	6	112751	112756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499348
3040	NC_017056	TTA	2	6	112766	112771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499348
3041	NC_017056	ATT	2	6	112796	112801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499348
3042	NC_017056	ACT	2	6	112875	112880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499348
3043	NC_017056	TA	3	6	112891	112896	50 %	50 %	0 %	0 %	383499348
3044	NC_017056	AGT	2	6	112901	112906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499348
3045	NC_017056	AAG	2	6	112914	112919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499348
3046	NC_017056	GA	3	6	112924	112929	50 %	0 %	50 %	0 %	383499348
3047	NC_017056	TAG	2	6	112988	112993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017056	AT	3	6	113038	113043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_017056	AT	3	6	113046	113051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_017056	CTA	2	6	113136	113141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_017056	TA	3	6	113145	113150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017056	AAT	2	6	113151	113156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017056	TAT	3	9	113159	113167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017056	ATG	2	6	113221	113226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017056	TAAA	2	8	113243	113250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017056	ATT	2	6	113282	113287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_017056	TAT	2	6	113305	113310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017056	TTA	2	6	113382	113387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017056	TAA	2	6	113404	113409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017056	TAA	2	6	113454	113459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017056	ATA	2	6	113531	113536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017056	AGTA	2	8	113624	113631	50 %	25 %	25 %	0 %	383499349
3063	NC_017056	TATT	2	8	113671	113678	25 %	75 %	0 %	0 %	383499349
3064	NC_017056	TAG	2	6	113725	113730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499349
3065	NC_017056	TTATA	2	10	113732	113741	40 %	60 %	0 %	0 %	383499349
3066	NC_017056	TAAA	2	8	113776	113783	75 %	25 %	0 %	0 %	383499349
3067	NC_017056	TAA	2	6	113807	113812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499349
3068	NC_017056	TAC	2	6	113817	113822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499349
3069	NC_017056	AT	3	6	113839	113844	50 %	50 %	0 %	0 %	383499349
3070	NC_017056	T	6	6	113854	113859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_017056	GTAAT	2	10	113870	113879	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017056	AGG	2	6	113931	113936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017056	ATA	2	6	113937	113942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_017056	A	6	6	113978	113983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017056	A	6	6	114005	114010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3080	NC_017056	GAT	2	6	114199	114204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499350
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3085	NC_017056	TA	3	6	114431	114436	50 %	50 %	0 %	0 %	383499350
3086	NC_017056	TA	3	6	114446	114451	50 %	50 %	0 %	0 %	383499350
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3092	NC_017056	GAAA	2	8	114549	114556	75 %	0 %	25 %	0 %	383499350
3093	NC_017056	TAAT	2	8	114677	114684	50 %	50 %	0 %	0 %	383499350
3094	NC_017056	TGA	2	6	114729	114734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499350
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3096	NC_017056	ATT	2	6	114753	114758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499350
3097	NC_017056	T	6	6	114757	114762	0 %	100 %	0 %	0 %	383499350
3098	NC_017056	AAG	2	6	114783	114788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499350
3099	NC_017056	ATC	2	6	114814	114819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499350
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3102	NC_017056	GCG	2	6	115034	115039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383499350
3103	NC_017056	ATC	2	6	115055	115060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499350
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3105	NC_017056	TAT	2	6	115109	115114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499350
3106	NC_017056	GCA	2	6	115120	115125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383499350
3107	NC_017056	TA	3	6	115216	115221	50 %	50 %	0 %	0 %	383499350
3108	NC_017056	CTA	2	6	115232	115237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499350
3109	NC_017056	TTTTA	2	10	115354	115363	20 %	80 %	0 %	0 %	383499350
3110	NC_017056	T	6	6	115480	115485	0 %	100 %	0 %	0 %	383499350
3111	NC_017056	ATA	2	6	115670	115675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499350
3112	NC_017056	A	8	8	115715	115722	100 %	0 %	0 %	0 %	383499350
3113	NC_017056	GAT	2	6	115843	115848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499350
3114	NC_017056	TA	3	6	115931	115936	50 %	50 %	0 %	0 %	383499350
3115	NC_017056	AT	3	6	115952	115957	50 %	50 %	0 %	0 %	383499350
3116	NC_017056	A	6	6	115970	115975	100 %	0 %	0 %	0 %	383499350
3117	NC_017056	TGA	2	6	115989	115994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499350
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3119	NC_017056	TGC	2	6	116106	116111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383499350
3120	NC_017056	AGT	2	6	116116	116121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499350
3121	NC_017056	CAA	2	6	116140	116145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383499350
3122	NC_017056	CA	3	6	116151	116156	50 %	0 %	0 %	50 %	383499350
3123	NC_017056	T	7	7	116159	116165	0 %	100 %	0 %	0 %	383499350
3124	NC_017056	AT	3	6	116223	116228	50 %	50 %	0 %	0 %	383499350
3125	NC_017056	TTAA	2	8	116230	116237	50 %	50 %	0 %	0 %	383499350
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3359	NC_017056	A	7	7	124823	124829	100 %	0 %	0 %	0 %	383499353
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3372	NC_017056	AAAT	2	8	125261	125268	75 %	25 %	0 %	0 %	383499354
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3498	NC_017056	TAAAAG	2	12	130064	130075	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383499355
3499	NC_017056	AAAT	2	8	130122	130129	75 %	25 %	0 %	0 %	383499355
3500	NC_017056	ATG	2	6	130130	130135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499355

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