MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP chromosome

Total Repeats: 30186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017056	AGATA	2	10	18456	18465	60 %	20 %	20 %	0 %	383499272
502	NC_017056	ATT	2	6	18467	18472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499272
503	NC_017056	TCAAA	2	10	18486	18495	60 %	20 %	0 %	20 %	383499272
504	NC_017056	CAT	2	6	18508	18513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499272
505	NC_017056	AATTAT	2	12	18544	18555	50 %	50 %	0 %	0 %	383499272
506	NC_017056	TAT	3	9	18570	18578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499272
507	NC_017056	TA	3	6	18623	18628	50 %	50 %	0 %	0 %	383499272
508	NC_017056	AAT	2	6	18676	18681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499272
509	NC_017056	AT	3	6	18680	18685	50 %	50 %	0 %	0 %	383499272
510	NC_017056	TAA	2	6	18741	18746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499272
511	NC_017056	TTA	2	6	18815	18820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499272
512	NC_017056	ATA	2	6	18830	18835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499272
513	NC_017056	TAT	2	6	18897	18902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499272
514	NC_017056	AAT	2	6	18913	18918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499272
515	NC_017056	ATT	2	6	18941	18946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499272
516	NC_017056	TAAA	2	8	18950	18957	75 %	25 %	0 %	0 %	383499272
517	NC_017056	TCA	2	6	18969	18974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499272
518	NC_017056	ATA	2	6	19090	19095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017056	ACC	2	6	19140	19145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_017056	ATA	2	6	19237	19242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017056	TAA	2	6	19250	19255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017056	AAG	2	6	19272	19277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017056	TTA	2	6	19314	19319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017056	ATTTA	2	10	19324	19333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017056	CTT	2	6	19388	19393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017056	TATT	2	8	19394	19401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017056	ATCTAA	2	12	19403	19414	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
528	NC_017056	ATT	2	6	19415	19420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017056	TAG	2	6	19451	19456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017056	AGTTT	2	10	19522	19531	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017056	A	6	6	19554	19559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017056	GTAA	2	8	19568	19575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017056	AAT	2	6	19580	19585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017056	TTAT	2	8	19646	19653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017056	TCAA	2	8	19678	19685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
536	NC_017056	AT	3	6	19687	19692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017056	CAT	2	6	19738	19743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017056	TATAA	2	10	19755	19764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017056	GTAA	2	8	19847	19854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017056	TA	3	6	19874	19879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017056	AT	3	6	19887	19892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017056	TAG	2	6	19907	19912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017056	GTA	2	6	20031	20036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017056	TAA	2	6	20037	20042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017056	ATAG	2	8	20082	20089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017056	AAT	2	6	20114	20119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017056	A	8	8	20127	20134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017056	A	8	8	20150	20157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017056	ATTA	2	8	20186	20193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017056	GAA	2	6	20214	20219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017056	TAA	2	6	20232	20237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017056	A	11	11	20243	20253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017056	TAG	2	6	20254	20259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017056	AGT	2	6	20347	20352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017056	TAT	2	6	20408	20413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017056	A	6	6	20424	20429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017056	AAT	2	6	20435	20440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017056	TA	3	6	20445	20450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017056	AT	3	6	20541	20546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017056	AATCT	2	10	20567	20576	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
561	NC_017056	ATT	2	6	20594	20599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017056	AAG	2	6	20653	20658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017056	GTT	2	6	20683	20688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017056	AAT	2	6	20720	20725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017056	ATCA	2	8	20750	20757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
566	NC_017056	ATA	2	6	20780	20785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017056	TA	3	6	20866	20871	50 %	50 %	0 %	0 %	383499273
568	NC_017056	TCT	2	6	20913	20918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383499273
569	NC_017056	TAAAA	2	10	20928	20937	80 %	20 %	0 %	0 %	383499273
570	NC_017056	ATC	2	6	20943	20948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499273
571	NC_017056	A	6	6	21027	21032	100 %	0 %	0 %	0 %	383499273
572	NC_017056	T	6	6	21039	21044	0 %	100 %	0 %	0 %	383499273
573	NC_017056	A	8	8	21046	21053	100 %	0 %	0 %	0 %	383499273
574	NC_017056	A	6	6	21090	21095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017056	TGA	2	6	21102	21107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017056	AACA	2	8	21111	21118	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
577	NC_017056	GTAT	2	8	21150	21157	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017056	T	6	6	21263	21268	0 %	100 %	0 %	0 %	383499274
579	NC_017056	TCA	2	6	21316	21321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499274
580	NC_017056	TTTTGA	2	12	21358	21369	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383499274
581	NC_017056	T	6	6	21390	21395	0 %	100 %	0 %	0 %	383499274
582	NC_017056	TTC	2	6	21408	21413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383499274
583	NC_017056	TTTGT	2	10	21440	21449	0 %	80 %	20 %	0 %	383499274
584	NC_017056	TCT	2	6	21463	21468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383499274
585	NC_017056	TTTGTA	2	12	21497	21508	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383499274
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588	NC_017056	T	6	6	21549	21554	0 %	100 %	0 %	0 %	383499274
589	NC_017056	T	7	7	21615	21621	0 %	100 %	0 %	0 %	383499274
590	NC_017056	TAAAT	2	10	21631	21640	60 %	40 %	0 %	0 %	383499274
591	NC_017056	ATT	2	6	21694	21699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499274
592	NC_017056	T	7	7	21711	21717	0 %	100 %	0 %	0 %	383499275
593	NC_017056	GTA	2	6	21718	21723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499275
594	NC_017056	T	6	6	21751	21756	0 %	100 %	0 %	0 %	383499275
595	NC_017056	AAT	2	6	21758	21763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499275
596	NC_017056	ATC	2	6	21780	21785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499275
597	NC_017056	TTA	2	6	21795	21800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499275
598	NC_017056	TGAT	2	8	21843	21850	25 %	50 %	25 %	0 %	383499275
599	NC_017056	T	8	8	21879	21886	0 %	100 %	0 %	0 %	383499275
600	NC_017056	T	6	6	21916	21921	0 %	100 %	0 %	0 %	383499275
601	NC_017056	T	7	7	21923	21929	0 %	100 %	0 %	0 %	383499275
602	NC_017056	TTTGT	2	10	21948	21957	0 %	80 %	20 %	0 %	383499275
603	NC_017056	TCT	2	6	21996	22001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383499275
604	NC_017056	AGC	2	6	22007	22012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383499275
605	NC_017056	TAT	2	6	22048	22053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499275
606	NC_017056	TTC	2	6	22061	22066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383499275
607	NC_017056	A	6	6	22129	22134	100 %	0 %	0 %	0 %	383499275
608	NC_017056	AAT	2	6	22141	22146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499275
609	NC_017056	TATCAA	2	12	22150	22161	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383499275
610	NC_017056	A	6	6	22189	22194	100 %	0 %	0 %	0 %	383499276
611	NC_017056	A	6	6	22219	22224	100 %	0 %	0 %	0 %	383499276
612	NC_017056	AG	3	6	22314	22319	50 %	0 %	50 %	0 %	383499276
613	NC_017056	TAAT	2	8	22423	22430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017056	CAT	2	6	22459	22464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499277
615	NC_017056	ATAC	2	8	22469	22476	50 %	25 %	0 %	25 %	383499277
616	NC_017056	CAT	2	6	22628	22633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499277
617	NC_017056	GCA	2	6	22638	22643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383499277
618	NC_017056	AACT	2	8	22657	22664	50 %	25 %	0 %	25 %	383499277
619	NC_017056	A	7	7	22737	22743	100 %	0 %	0 %	0 %	383499277
620	NC_017056	A	6	6	22749	22754	100 %	0 %	0 %	0 %	383499277
621	NC_017056	TAG	2	6	22837	22842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499277
622	NC_017056	AATAA	2	10	22881	22890	80 %	20 %	0 %	0 %	383499277
623	NC_017056	AAAT	2	8	22891	22898	75 %	25 %	0 %	0 %	383499277
624	NC_017056	CACT	2	8	22987	22994	25 %	25 %	0 %	50 %	383499277
625	NC_017056	AAGT	2	8	23040	23047	50 %	25 %	25 %	0 %	383499277
626	NC_017056	GTA	2	6	23058	23063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499277
627	NC_017056	T	6	6	23132	23137	0 %	100 %	0 %	0 %	383499277
628	NC_017056	TAT	2	6	23214	23219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499278
629	NC_017056	ATA	2	6	23227	23232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499278
630	NC_017056	T	6	6	23336	23341	0 %	100 %	0 %	0 %	383499278
631	NC_017056	TTAGAA	2	12	23350	23361	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383499278
632	NC_017056	ATTA	2	8	23422	23429	50 %	50 %	0 %	0 %	383499278
633	NC_017056	TTA	3	9	23469	23477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499279
634	NC_017056	ATTT	2	8	23481	23488	25 %	75 %	0 %	0 %	383499279
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