MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP plasmid pMCC_1

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017055	A	6	6	374	379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017055	A	6	6	517	522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017055	A	6	6	617	622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017055	A	6	6	1723	1728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017055	A	7	7	1788	1794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017055	A	6	6	1825	1830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017055	T	7	7	2923	2929	0 %	100 %	0 %	0 %	381356296
8	NC_017055	T	6	6	3447	3452	0 %	100 %	0 %	0 %	381356296
9	NC_017055	T	6	6	3701	3706	0 %	100 %	0 %	0 %	381356296
10	NC_017055	T	6	6	3947	3952	0 %	100 %	0 %	0 %	381356296
11	NC_017055	T	6	6	4468	4473	0 %	100 %	0 %	0 %	381356296
12	NC_017055	A	7	7	4940	4946	100 %	0 %	0 %	0 %	381356296
13	NC_017055	T	6	6	5002	5007	0 %	100 %	0 %	0 %	381356296
14	NC_017055	A	6	6	5016	5021	100 %	0 %	0 %	0 %	381356296
15	NC_017055	T	6	6	5367	5372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017055	T	7	7	5890	5896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017055	A	6	6	6639	6644	100 %	0 %	0 %	0 %	381356298
18	NC_017055	A	6	6	7199	7204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017055	T	8	8	7686	7693	0 %	100 %	0 %	0 %	381356299
20	NC_017055	T	6	6	8040	8045	0 %	100 %	0 %	0 %	381356299
21	NC_017055	T	6	6	8079	8084	0 %	100 %	0 %	0 %	381356299
22	NC_017055	T	6	6	8709	8714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017055	T	6	6	9065	9070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017055	A	6	6	9133	9138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017055	G	6	6	9883	9888	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017055	T	6	6	11483	11488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017055	T	6	6	11760	11765	0 %	100 %	0 %	0 %	381356304
28	NC_017055	T	7	7	12001	12007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017055	A	6	6	12410	12415	100 %	0 %	0 %	0 %	381356305
30	NC_017055	A	6	6	12591	12596	100 %	0 %	0 %	0 %	381356305
31	NC_017055	A	7	7	12600	12606	100 %	0 %	0 %	0 %	381356305
32	NC_017055	A	7	7	12710	12716	100 %	0 %	0 %	0 %	381356305
33	NC_017055	T	7	7	13215	13221	0 %	100 %	0 %	0 %	381356306
34	NC_017055	T	6	6	13229	13234	0 %	100 %	0 %	0 %	381356306
35	NC_017055	T	6	6	13511	13516	0 %	100 %	0 %	0 %	381356307
36	NC_017055	T	6	6	13829	13834	0 %	100 %	0 %	0 %	381356307
37	NC_017055	T	6	6	13929	13934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017055	T	6	6	14037	14042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017055	A	6	6	14295	14300	100 %	0 %	0 %	0 %	381356308
40	NC_017055	A	6	6	14982	14987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.