MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 18021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017051	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489124
2	NC_017051	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489124
3	NC_017051	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489124
4	NC_017051	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489124
5	NC_017051	ATG	3	9	392	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489124
6	NC_017051	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489124
7	NC_017051	TAG	3	9	572	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489124
8	NC_017051	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489124
9	NC_017051	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489124
10	NC_017051	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489124
11	NC_017051	ATT	2	6	834	839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017051	GTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017051	ACA	2	6	927	932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017051	ACA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017051	GTG	2	6	1064	1069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489125
16	NC_017051	ATA	2	6	1095	1100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489125
17	NC_017051	TGA	2	6	1154	1159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489125
18	NC_017051	TGT	2	6	1210	1215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489125
19	NC_017051	CAA	2	6	1254	1259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489125
20	NC_017051	TAA	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489125
21	NC_017051	TGC	2	6	1590	1595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489126
22	NC_017051	ATA	3	9	1667	1675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489126
23	NC_017051	GTA	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489126
24	NC_017051	TGA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489126
25	NC_017051	GCA	2	6	1846	1851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489126
26	NC_017051	GAA	2	6	1890	1895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489126
27	NC_017051	AAT	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489126
28	NC_017051	TCA	2	6	1932	1937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489126
29	NC_017051	AGA	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489126
30	NC_017051	TTA	2	6	1975	1980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489126
31	NC_017051	GAT	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489126
32	NC_017051	ACA	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489126
33	NC_017051	TAA	2	6	2046	2051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489126
34	NC_017051	ATA	2	6	2193	2198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489127
35	NC_017051	TTA	2	6	2223	2228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489127
36	NC_017051	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489127
37	NC_017051	ATA	2	6	2478	2483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489127
38	NC_017051	ATG	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489127
39	NC_017051	TAA	2	6	2746	2751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489127
40	NC_017051	TTA	2	6	2773	2778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489127
41	NC_017051	CTC	2	6	2970	2975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383489128
42	NC_017051	ATT	2	6	2981	2986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489128
43	NC_017051	ATT	2	6	2994	2999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489128
44	NC_017051	AAG	2	6	3066	3071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489128
45	NC_017051	ATT	2	6	3107	3112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489128
46	NC_017051	GAA	2	6	3281	3286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489128
47	NC_017051	AGC	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489128
48	NC_017051	TGC	2	6	3322	3327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489128
49	NC_017051	TTA	2	6	3343	3348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489128
50	NC_017051	TCA	2	6	3359	3364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489128
51	NC_017051	CAA	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489128
52	NC_017051	GAT	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489128
53	NC_017051	ATT	2	6	3537	3542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489128
54	NC_017051	AGC	2	6	3724	3729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489128
55	NC_017051	TAT	2	6	3736	3741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489128
56	NC_017051	GCA	2	6	3764	3769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489128
57	NC_017051	AGA	2	6	3862	3867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489128
58	NC_017051	CTT	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489128
59	NC_017051	TAT	2	6	4013	4018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489128
60	NC_017051	TTA	2	6	4019	4024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489128
61	NC_017051	AAC	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489128
62	NC_017051	AAT	3	9	4232	4240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489128
63	NC_017051	TGA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489128
64	NC_017051	TGA	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489128
65	NC_017051	ATA	2	6	4478	4483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489128
66	NC_017051	GGT	2	6	4487	4492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489128
67	NC_017051	CTT	2	6	4497	4502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489128
68	NC_017051	AGA	3	9	4585	4593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489128
69	NC_017051	GAA	2	6	4607	4612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489128
70	NC_017051	AAG	2	6	4638	4643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489128
71	NC_017051	GAA	2	6	4655	4660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489128
72	NC_017051	TAA	2	6	4675	4680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489128
73	NC_017051	GGA	2	6	4685	4690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383489128
74	NC_017051	TAT	2	6	4700	4705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489128
75	NC_017051	TAC	2	6	4858	4863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489128
76	NC_017051	AGT	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489128
77	NC_017051	ATA	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489128
78	NC_017051	AAG	2	6	5076	5081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489128
79	NC_017051	TTA	2	6	5091	5096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489128
80	NC_017051	ATT	2	6	5163	5168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489128
81	NC_017051	TAA	2	6	5185	5190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489128
82	NC_017051	TGC	2	6	5242	5247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489128
83	NC_017051	ATT	2	6	5286	5291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489128
84	NC_017051	CTA	2	6	5394	5399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489128
85	NC_017051	AGT	2	6	5431	5436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489128
86	NC_017051	ATT	3	9	5489	5497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489128
87	NC_017051	TAA	2	6	5613	5618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489128
88	NC_017051	TAA	2	6	5685	5690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489128
89	NC_017051	ATG	2	6	5717	5722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489128
90	NC_017051	AAT	2	6	5809	5814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489128
91	NC_017051	ATT	2	6	5896	5901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017051	TCT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017051	GTT	2	6	5909	5914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017051	TAA	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017051	CAT	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017051	TAA	2	6	6038	6043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017051	ATA	2	6	6121	6126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017051	ATT	2	6	6175	6180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017051	CTA	3	9	6253	6261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489129
100	NC_017051	AAT	2	6	6279	6284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489129
101	NC_017051	ATT	2	6	6300	6305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489129
102	NC_017051	CAA	2	6	6338	6343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489129
103	NC_017051	TCT	2	6	6367	6372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489129
104	NC_017051	TAC	2	6	6461	6466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489129
105	NC_017051	ATC	2	6	6517	6522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489129
106	NC_017051	CCA	2	6	6565	6570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489129
107	NC_017051	ATT	2	6	6571	6576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489129
108	NC_017051	TTA	2	6	6685	6690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489129
109	NC_017051	TAT	2	6	6758	6763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489129
110	NC_017051	ATT	2	6	6772	6777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489129
111	NC_017051	TAC	2	6	6882	6887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489129
112	NC_017051	GTA	2	6	6997	7002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489129
113	NC_017051	CTT	2	6	7217	7222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489130
114	NC_017051	TAG	2	6	7229	7234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489130
115	NC_017051	AGC	2	6	7260	7265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489130
116	NC_017051	TAT	2	6	7368	7373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489130
117	NC_017051	CTA	2	6	7406	7411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489130
118	NC_017051	TTA	2	6	7504	7509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017051	ATT	2	6	7555	7560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017051	ACA	2	6	7638	7643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017051	ACT	2	6	7659	7664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489131
122	NC_017051	ATA	2	6	7706	7711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489131
123	NC_017051	CCT	2	6	7790	7795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383489131
124	NC_017051	TCC	2	6	7852	7857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383489131
125	NC_017051	ATA	2	6	7913	7918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489131
126	NC_017051	TCT	2	6	7979	7984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489131
127	NC_017051	ATA	2	6	7985	7990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489131
128	NC_017051	TAG	2	6	8016	8021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489131
129	NC_017051	ATT	2	6	8041	8046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489131
130	NC_017051	ATG	2	6	8080	8085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489131
131	NC_017051	CTA	2	6	8136	8141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489131
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133	NC_017051	TCG	2	6	8153	8158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489131
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