MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 30124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017051	ATT	2	6	148456	148461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489239
4003	NC_017051	GTA	2	6	148487	148492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489239
4004	NC_017051	CAG	2	6	148527	148532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_017051	ATT	2	6	148562	148567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017051	TAA	2	6	148583	148588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017051	TTAAG	2	10	148594	148603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017051	A	6	6	148633	148638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017051	TATAA	2	10	148659	148668	60 %	40 %	0 %	0 %	383489240
4010	NC_017051	TCA	2	6	148670	148675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489240
4011	NC_017051	GTA	2	6	148686	148691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489240
4012	NC_017051	AAG	2	6	148741	148746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489240
4013	NC_017051	GCT	2	6	148800	148805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489240
4014	NC_017051	GGT	2	6	148809	148814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489240
4015	NC_017051	TGC	2	6	148820	148825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489240
4016	NC_017051	GAT	2	6	148845	148850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489240
4017	NC_017051	TTAGAG	2	12	148947	148958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489240
4018	NC_017051	TGG	2	6	149015	149020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489240
4019	NC_017051	GCT	2	6	149049	149054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489240
4020	NC_017051	TGC	2	6	149066	149071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489240
4021	NC_017051	T	6	6	149139	149144	0 %	100 %	0 %	0 %	383489240
4022	NC_017051	TTA	2	6	149166	149171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489240
4023	NC_017051	GAT	2	6	149214	149219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489240
4024	NC_017051	GGT	2	6	149325	149330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489240
4025	NC_017051	TTA	2	6	149335	149340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489240
4026	NC_017051	TA	3	6	149393	149398	50 %	50 %	0 %	0 %	383489240
4027	NC_017051	TTA	2	6	149413	149418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489240
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4029	NC_017051	CTG	2	6	149491	149496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489240
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4033	NC_017051	AGC	2	6	149819	149824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489240
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4036	NC_017051	TAG	2	6	150184	150189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489240
4037	NC_017051	CAG	2	6	150241	150246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489240
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4039	NC_017051	TGA	2	6	150338	150343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489240
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4041	NC_017051	ATTA	3	12	150433	150444	50 %	50 %	0 %	0 %	383489240
4042	NC_017051	TA	3	6	150443	150448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017051	TAT	2	6	150450	150455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017051	TTTA	2	8	150456	150463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017051	AAC	2	6	150477	150482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017051	T	6	6	150501	150506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017051	GCT	2	6	150508	150513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_017051	GAA	2	6	150534	150539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017051	A	6	6	150538	150543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017051	TA	3	6	150544	150549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017051	TATT	2	8	150566	150573	25 %	75 %	0 %	0 %	383489241
4052	NC_017051	TAT	2	6	150598	150603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489241
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4054	NC_017051	TAT	2	6	150772	150777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489241
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4058	NC_017051	ATT	2	6	151043	151048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489241
4059	NC_017051	ATT	2	6	151110	151115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489241
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4072	NC_017051	AGG	2	6	151623	151628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383489242
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4074	NC_017051	ATTT	2	8	151765	151772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017051	TAGAGA	2	12	151776	151787	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017051	A	6	6	151789	151794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017051	CGT	2	6	151804	151809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489243
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4082	NC_017051	A	7	7	151949	151955	100 %	0 %	0 %	0 %	383489243
4083	NC_017051	TAA	2	6	151983	151988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489243
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4094	NC_017051	A	7	7	152266	152272	100 %	0 %	0 %	0 %	383489243
4095	NC_017051	ATAA	2	8	152301	152308	75 %	25 %	0 %	0 %	383489244
4096	NC_017051	AACTAC	2	12	152360	152371	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383489244
4097	NC_017051	TAT	2	6	152385	152390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489244
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4104	NC_017051	ATT	2	6	152526	152531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489244
4105	NC_017051	AGGC	2	8	152652	152659	25 %	0 %	50 %	25 %	383489244
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4108	NC_017051	GAA	2	6	152796	152801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489244
4109	NC_017051	GAA	2	6	152880	152885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489244
4110	NC_017051	GTT	2	6	152946	152951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489244
4111	NC_017051	AGA	2	6	153002	153007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489244
4112	NC_017051	TAA	2	6	153022	153027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489244
4113	NC_017051	AAGT	2	8	153166	153173	50 %	25 %	25 %	0 %	383489244
4114	NC_017051	GAA	2	6	153180	153185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489244
4115	NC_017051	ATGA	2	8	153240	153247	50 %	25 %	25 %	0 %	383489244
4116	NC_017051	AT	3	6	153279	153284	50 %	50 %	0 %	0 %	383489244
4117	NC_017051	TTA	2	6	153313	153318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489244
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4119	NC_017051	A	6	6	153340	153345	100 %	0 %	0 %	0 %	383489244
4120	NC_017051	TTA	2	6	153357	153362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489244
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4500	NC_017051	AATT	2	8	168362	168369	50 %	50 %	0 %	0 %	383489253

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