MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 30124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017051	ACA	2	6	18409	18414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489139
502	NC_017051	AGATA	2	10	18463	18472	60 %	20 %	20 %	0 %	383489139
503	NC_017051	ATT	2	6	18474	18479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489139
504	NC_017051	TCAAA	2	10	18493	18502	60 %	20 %	0 %	20 %	383489139
505	NC_017051	CAT	2	6	18515	18520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489139
506	NC_017051	AATTAT	2	12	18551	18562	50 %	50 %	0 %	0 %	383489139
507	NC_017051	TAT	3	9	18577	18585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489139
508	NC_017051	TA	3	6	18630	18635	50 %	50 %	0 %	0 %	383489139
509	NC_017051	AAT	2	6	18683	18688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489139
510	NC_017051	AT	3	6	18687	18692	50 %	50 %	0 %	0 %	383489139
511	NC_017051	TAA	2	6	18748	18753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489139
512	NC_017051	TTA	2	6	18822	18827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489139
513	NC_017051	ATA	2	6	18837	18842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489139
514	NC_017051	TAT	2	6	18904	18909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489139
515	NC_017051	AAT	2	6	18920	18925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489139
516	NC_017051	ATT	2	6	18948	18953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489139
517	NC_017051	TAAA	2	8	18957	18964	75 %	25 %	0 %	0 %	383489139
518	NC_017051	TCA	2	6	18976	18981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489139
519	NC_017051	ATA	2	6	19097	19102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017051	ACC	2	6	19147	19152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_017051	ATA	2	6	19244	19249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017051	TAA	2	6	19257	19262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017051	AAG	2	6	19279	19284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017051	TTA	2	6	19321	19326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017051	ATTTA	2	10	19331	19340	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017051	CTT	2	6	19395	19400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017051	TATT	2	8	19401	19408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017051	ATCTAA	2	12	19410	19421	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
529	NC_017051	ATT	2	6	19422	19427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017051	TAG	2	6	19458	19463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017051	AGTTT	2	10	19529	19538	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017051	A	6	6	19561	19566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017051	GTAA	2	8	19575	19582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017051	AAT	2	6	19587	19592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017051	TTAT	2	8	19653	19660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017051	TCAA	2	8	19685	19692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
537	NC_017051	AT	3	6	19694	19699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017051	CAT	2	6	19745	19750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017051	TATAA	2	10	19762	19771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017051	GTAA	2	8	19854	19861	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017051	TA	3	6	19881	19886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017051	AT	3	6	19894	19899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017051	TAG	2	6	19914	19919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017051	GTA	2	6	20038	20043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017051	TAA	2	6	20044	20049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017051	ATAG	2	8	20089	20096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017051	AAT	2	6	20121	20126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017051	A	8	8	20134	20141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017051	A	8	8	20157	20164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017051	ATTA	2	8	20193	20200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017051	GAA	2	6	20221	20226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017051	TAA	2	6	20239	20244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017051	A	9	9	20250	20258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017051	TAG	2	6	20259	20264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017051	AGT	2	6	20352	20357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017051	TAT	2	6	20413	20418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017051	A	6	6	20429	20434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017051	AAT	2	6	20440	20445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017051	TA	3	6	20450	20455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017051	AT	3	6	20546	20551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017051	AATCT	2	10	20572	20581	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
562	NC_017051	ATT	2	6	20599	20604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017051	AAG	2	6	20658	20663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017051	GTT	2	6	20688	20693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017051	AAT	2	6	20725	20730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017051	ATCA	2	8	20755	20762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
567	NC_017051	ATA	2	6	20785	20790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017051	TA	3	6	20871	20876	50 %	50 %	0 %	0 %	383489140
569	NC_017051	TCT	2	6	20918	20923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489140
570	NC_017051	TAAAA	2	10	20933	20942	80 %	20 %	0 %	0 %	383489140
571	NC_017051	ATC	2	6	20948	20953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489140
572	NC_017051	A	6	6	21032	21037	100 %	0 %	0 %	0 %	383489140
573	NC_017051	T	6	6	21044	21049	0 %	100 %	0 %	0 %	383489140
574	NC_017051	A	8	8	21051	21058	100 %	0 %	0 %	0 %	383489140
575	NC_017051	A	6	6	21095	21100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017051	TGA	2	6	21107	21112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017051	AACA	2	8	21116	21123	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_017051	GTAT	2	8	21155	21162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017051	T	6	6	21268	21273	0 %	100 %	0 %	0 %	383489141
580	NC_017051	TCA	2	6	21321	21326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489141
581	NC_017051	TTTTGA	2	12	21363	21374	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383489141
582	NC_017051	T	6	6	21395	21400	0 %	100 %	0 %	0 %	383489141
583	NC_017051	TTC	2	6	21413	21418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489141
584	NC_017051	TTTGT	2	10	21445	21454	0 %	80 %	20 %	0 %	383489141
585	NC_017051	TCT	2	6	21468	21473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489141
586	NC_017051	TTTGTA	2	12	21502	21513	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383489141
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589	NC_017051	T	6	6	21554	21559	0 %	100 %	0 %	0 %	383489141
590	NC_017051	T	7	7	21620	21626	0 %	100 %	0 %	0 %	383489141
591	NC_017051	TAAAT	2	10	21636	21645	60 %	40 %	0 %	0 %	383489141
592	NC_017051	ATT	2	6	21699	21704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489141
593	NC_017051	T	7	7	21716	21722	0 %	100 %	0 %	0 %	383489142
594	NC_017051	GTA	2	6	21723	21728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489142
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597	NC_017051	ATC	2	6	21785	21790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489142
598	NC_017051	TTA	2	6	21800	21805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489142
599	NC_017051	TGAT	2	8	21848	21855	25 %	50 %	25 %	0 %	383489142
600	NC_017051	T	8	8	21884	21891	0 %	100 %	0 %	0 %	383489142
601	NC_017051	T	6	6	21921	21926	0 %	100 %	0 %	0 %	383489142
602	NC_017051	T	7	7	21928	21934	0 %	100 %	0 %	0 %	383489142
603	NC_017051	TTTGT	2	10	21953	21962	0 %	80 %	20 %	0 %	383489142
604	NC_017051	TCT	2	6	22001	22006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489142
605	NC_017051	AGC	2	6	22012	22017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489142
606	NC_017051	TAT	2	6	22053	22058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489142
607	NC_017051	TTC	2	6	22066	22071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489142
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609	NC_017051	AAT	2	6	22146	22151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489142
610	NC_017051	TATCAA	2	12	22155	22166	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383489142
611	NC_017051	A	6	6	22194	22199	100 %	0 %	0 %	0 %	383489143
612	NC_017051	A	6	6	22224	22229	100 %	0 %	0 %	0 %	383489143
613	NC_017051	AG	3	6	22319	22324	50 %	0 %	50 %	0 %	383489143
614	NC_017051	TAAT	2	8	22428	22435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017051	CAT	2	6	22464	22469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489144
616	NC_017051	ATAC	2	8	22474	22481	50 %	25 %	0 %	25 %	383489144
617	NC_017051	CAT	2	6	22633	22638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489144
618	NC_017051	GCA	2	6	22643	22648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489144
619	NC_017051	AACT	2	8	22662	22669	50 %	25 %	0 %	25 %	383489144
620	NC_017051	A	7	7	22742	22748	100 %	0 %	0 %	0 %	383489144
621	NC_017051	A	6	6	22754	22759	100 %	0 %	0 %	0 %	383489144
622	NC_017051	TAG	2	6	22842	22847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489144
623	NC_017051	AATAA	2	10	22886	22895	80 %	20 %	0 %	0 %	383489144
624	NC_017051	AAAT	2	8	22896	22903	75 %	25 %	0 %	0 %	383489144
625	NC_017051	CACT	2	8	22992	22999	25 %	25 %	0 %	50 %	383489144
626	NC_017051	AAGT	2	8	23045	23052	50 %	25 %	25 %	0 %	383489144
627	NC_017051	GTA	2	6	23063	23068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489144
628	NC_017051	T	6	6	23137	23142	0 %	100 %	0 %	0 %	383489144
629	NC_017051	TAT	2	6	23219	23224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489145
630	NC_017051	ATA	2	6	23232	23237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489145
631	NC_017051	T	6	6	23341	23346	0 %	100 %	0 %	0 %	383489145
632	NC_017051	TTAGAA	2	12	23355	23366	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383489145
633	NC_017051	ATTA	2	8	23427	23434	50 %	50 %	0 %	0 %	383489145
634	NC_017051	TTA	3	9	23474	23482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017051	ATTT	2	8	23486	23493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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