MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 30190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017050	TAAT	2	8	148219	148226	50 %	50 %	0 %	0 %	383488393
4002	NC_017050	TGA	2	6	148229	148234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488393
4003	NC_017050	AGA	2	6	148235	148240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488393
4004	NC_017050	TAA	2	6	148264	148269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488393
4005	NC_017050	GAT	2	6	148293	148298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488393
4006	NC_017050	TAT	2	6	148315	148320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488393
4007	NC_017050	A	6	6	148332	148337	100 %	0 %	0 %	0 %	383488393
4008	NC_017050	GT	3	6	148384	148389	0 %	50 %	50 %	0 %	383488393
4009	NC_017050	ACTT	2	8	148430	148437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_017050	TAAGC	2	10	148479	148488	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4011	NC_017050	TAAAT	2	10	148500	148509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017050	ATGA	2	8	148517	148524	50 %	25 %	25 %	0 %	383488394
4013	NC_017050	ATA	2	6	148562	148567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488394
4014	NC_017050	A	9	9	148607	148615	100 %	0 %	0 %	0 %	383488394
4015	NC_017050	GCTA	2	8	148636	148643	25 %	25 %	25 %	25 %	383488394
4016	NC_017050	GTA	2	6	148722	148727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488394
4017	NC_017050	AAAT	2	8	148743	148750	75 %	25 %	0 %	0 %	383488394
4018	NC_017050	AG	4	8	148794	148801	50 %	0 %	50 %	0 %	383488394
4019	NC_017050	TA	3	6	148853	148858	50 %	50 %	0 %	0 %	383488394
4020	NC_017050	ACAAA	2	10	148886	148895	80 %	0 %	0 %	20 %	383488394
4021	NC_017050	ACT	2	6	149017	149022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488394
4022	NC_017050	AAG	2	6	149030	149035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488394
4023	NC_017050	AGA	2	6	149146	149151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488394
4024	NC_017050	AC	3	6	149153	149158	50 %	0 %	0 %	50 %	383488394
4025	NC_017050	AAT	2	6	149165	149170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488394
4026	NC_017050	TGA	2	6	149197	149202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488394
4027	NC_017050	GAT	2	6	149219	149224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488394
4028	NC_017050	ATAG	2	8	149253	149260	50 %	25 %	25 %	0 %	383488394
4029	NC_017050	ATC	2	6	149265	149270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_017050	ATA	2	6	149305	149310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017050	T	6	6	149329	149334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017050	TAT	2	6	149375	149380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017050	TAAAA	2	10	149403	149412	80 %	20 %	0 %	0 %	383488395
4034	NC_017050	TAA	2	6	149424	149429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488395
4035	NC_017050	CAC	2	6	149441	149446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383488395
4036	NC_017050	TA	4	8	149454	149461	50 %	50 %	0 %	0 %	383488395
4037	NC_017050	T	6	6	149518	149523	0 %	100 %	0 %	0 %	383488395
4038	NC_017050	TGGTG	2	10	149537	149546	0 %	40 %	60 %	0 %	383488395
4039	NC_017050	AAT	2	6	149569	149574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488395
4040	NC_017050	TAT	2	6	149598	149603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488395
4041	NC_017050	TAG	2	6	149615	149620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488395
4042	NC_017050	GT	3	6	149724	149729	0 %	50 %	50 %	0 %	383488395
4043	NC_017050	AGT	2	6	149730	149735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488395
4044	NC_017050	TAT	2	6	149744	149749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488395
4045	NC_017050	TTA	2	6	149758	149763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488395
4046	NC_017050	T	6	6	149816	149821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017050	TGAAA	2	10	149853	149862	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017050	TAA	2	6	149874	149879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017050	AAT	2	6	149884	149889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017050	AT	3	6	149934	149939	50 %	50 %	0 %	0 %	383488396
4051	NC_017050	CAT	2	6	149997	150002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488396
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4053	NC_017050	CAA	2	6	150074	150079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383488396
4054	NC_017050	AAT	2	6	150081	150086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488396
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4056	NC_017050	ATTA	2	8	150140	150147	50 %	50 %	0 %	0 %	383488396
4057	NC_017050	GTA	2	6	150189	150194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488396
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4059	NC_017050	ATT	2	6	150251	150256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488396
4060	NC_017050	GTA	2	6	150282	150287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488396
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4062	NC_017050	ATT	2	6	150357	150362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017050	TAA	2	6	150378	150383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017050	TTAAG	2	10	150389	150398	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017050	A	6	6	150428	150433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017050	TATAA	2	10	150454	150463	60 %	40 %	0 %	0 %	383488397
4067	NC_017050	TCA	2	6	150465	150470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488397
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4084	NC_017050	TTA	2	6	151208	151213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488397
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4095	NC_017050	AAGAA	2	10	152046	152055	80 %	0 %	20 %	0 %	383488397
4096	NC_017050	TGA	2	6	152133	152138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488397
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4098	NC_017050	ATTA	3	12	152228	152239	50 %	50 %	0 %	0 %	383488397
4099	NC_017050	TA	3	6	152238	152243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017050	TAT	2	6	152245	152250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017050	TTTA	2	8	152251	152258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017050	AAC	2	6	152272	152277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_017050	T	6	6	152296	152301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017050	GCT	2	6	152303	152308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_017050	GAA	2	6	152329	152334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017050	A	6	6	152333	152338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017050	TA	3	6	152339	152344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017050	TATT	2	8	152361	152368	25 %	75 %	0 %	0 %	383488398
4109	NC_017050	TAT	2	6	152393	152398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488398
4110	NC_017050	CTT	2	6	152466	152471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383488398
4111	NC_017050	TAT	2	6	152567	152572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488398
4112	NC_017050	TGC	2	6	152579	152584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383488398
4113	NC_017050	GCT	2	6	152715	152720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383488398
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4118	NC_017050	GTT	2	6	152935	152940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383488398
4119	NC_017050	AAT	2	6	152978	152983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488398
4120	NC_017050	A	7	7	152988	152994	100 %	0 %	0 %	0 %	383488398
4121	NC_017050	TTAA	2	8	153001	153008	50 %	50 %	0 %	0 %	383488398
4122	NC_017050	ATAATT	2	12	153033	153044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017050	AG	3	6	153098	153103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017050	TAAG	2	8	153143	153150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4380	NC_017050	GTA	2	6	162680	162685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488408
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