MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 30190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017050	TAT	2	6	111226	111231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017050	AT	3	6	111246	111251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017050	ATTT	2	8	111260	111267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017050	GGTGTT	2	12	111323	111334	0 %	50 %	50 %	0 %	383488368
3005	NC_017050	TAA	2	6	111343	111348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488368
3006	NC_017050	AGA	2	6	111374	111379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488368
3007	NC_017050	TA	3	6	111435	111440	50 %	50 %	0 %	0 %	383488368
3008	NC_017050	AT	3	6	111499	111504	50 %	50 %	0 %	0 %	383488368
3009	NC_017050	ATG	2	6	111516	111521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488368
3010	NC_017050	A	6	6	111555	111560	100 %	0 %	0 %	0 %	383488368
3011	NC_017050	AGC	2	6	111574	111579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383488368
3012	NC_017050	GTA	2	6	111739	111744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488369
3013	NC_017050	AATC	2	8	111745	111752	50 %	25 %	0 %	25 %	383488369
3014	NC_017050	TAA	2	6	111753	111758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488369
3015	NC_017050	TAA	2	6	111774	111779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488369
3016	NC_017050	TCTT	2	8	111792	111799	0 %	75 %	0 %	25 %	383488369
3017	NC_017050	AAGA	2	8	111808	111815	75 %	0 %	25 %	0 %	383488369
3018	NC_017050	AGTAG	2	10	111877	111886	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017050	CTA	2	6	111898	111903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_017050	ATA	2	6	111912	111917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017050	TAG	2	6	112047	112052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017050	TGA	2	6	112063	112068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017050	CACTA	2	10	112138	112147	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3024	NC_017050	CATA	2	8	112257	112264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3025	NC_017050	AATAC	2	10	112282	112291	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3026	NC_017050	TA	3	6	112313	112318	50 %	50 %	0 %	0 %	383488370
3027	NC_017050	TAA	2	6	112323	112328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488370
3028	NC_017050	ATA	2	6	112343	112348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488370
3029	NC_017050	A	6	6	112348	112353	100 %	0 %	0 %	0 %	383488370
3030	NC_017050	GATT	2	8	112356	112363	25 %	50 %	25 %	0 %	383488370
3031	NC_017050	TCA	2	6	112380	112385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488370
3032	NC_017050	AAATC	2	10	112416	112425	60 %	20 %	0 %	20 %	383488370
3033	NC_017050	TTG	2	6	112454	112459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383488370
3034	NC_017050	ATA	2	6	112486	112491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488370
3035	NC_017050	TAA	3	9	112503	112511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488370
3036	NC_017050	TTA	2	6	112583	112588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488370
3037	NC_017050	TTA	2	6	112662	112667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488370
3038	NC_017050	GTTA	2	8	112692	112699	25 %	50 %	25 %	0 %	383488370
3039	NC_017050	AAG	2	6	112716	112721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488370
3040	NC_017050	AAG	2	6	112741	112746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488370
3041	NC_017050	TTA	2	6	112756	112761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488370
3042	NC_017050	ATT	2	6	112786	112791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488370
3043	NC_017050	ACT	2	6	112865	112870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488370
3044	NC_017050	TA	3	6	112881	112886	50 %	50 %	0 %	0 %	383488370
3045	NC_017050	AGT	2	6	112891	112896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488370
3046	NC_017050	AAG	2	6	112904	112909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488370
3047	NC_017050	GA	3	6	112914	112919	50 %	0 %	50 %	0 %	383488370
3048	NC_017050	TAG	2	6	112978	112983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_017050	AT	3	6	113028	113033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_017050	AT	3	6	113036	113041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017050	CTA	2	6	113126	113131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_017050	TA	3	6	113135	113140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017050	AAT	2	6	113141	113146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017050	TAT	3	9	113149	113157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017050	ATG	2	6	113211	113216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017050	TAAA	2	8	113233	113240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_017050	ATT	2	6	113272	113277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017050	TAT	2	6	113295	113300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017050	TTA	2	6	113372	113377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017050	TAA	2	6	113394	113399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017050	TAA	2	6	113444	113449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017050	ATA	2	6	113521	113526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017050	AGTA	2	8	113614	113621	50 %	25 %	25 %	0 %	383488371
3064	NC_017050	TATT	2	8	113661	113668	25 %	75 %	0 %	0 %	383488371
3065	NC_017050	TAG	2	6	113715	113720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488371
3066	NC_017050	TTATA	2	10	113722	113731	40 %	60 %	0 %	0 %	383488371
3067	NC_017050	TAAA	2	8	113766	113773	75 %	25 %	0 %	0 %	383488371
3068	NC_017050	TAA	2	6	113797	113802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488371
3069	NC_017050	TAC	2	6	113807	113812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488371
3070	NC_017050	AT	3	6	113829	113834	50 %	50 %	0 %	0 %	383488371
3071	NC_017050	T	6	6	113844	113849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017050	GTAAT	2	10	113860	113869	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017050	AGG	2	6	113921	113926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_017050	ATA	2	6	113927	113932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017050	A	6	6	113968	113973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017050	A	6	6	113995	114000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_017050	AGC	2	6	114041	114046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383488372
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3082	NC_017050	TGCTT	2	10	114227	114236	0 %	60 %	20 %	20 %	383488372
3083	NC_017050	AGA	2	6	114282	114287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488372
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3086	NC_017050	TA	3	6	114421	114426	50 %	50 %	0 %	0 %	383488372
3087	NC_017050	TA	3	6	114436	114441	50 %	50 %	0 %	0 %	383488372
3088	NC_017050	TGG	2	6	114452	114457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383488372
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3091	NC_017050	AAG	2	6	114483	114488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488372
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3093	NC_017050	GAAA	2	8	114539	114546	75 %	0 %	25 %	0 %	383488372
3094	NC_017050	TAAT	2	8	114667	114674	50 %	50 %	0 %	0 %	383488372
3095	NC_017050	TGA	2	6	114719	114724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488372
3096	NC_017050	TACC	2	8	114730	114737	25 %	25 %	0 %	50 %	383488372
3097	NC_017050	ATT	2	6	114743	114748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488372
3098	NC_017050	T	6	6	114747	114752	0 %	100 %	0 %	0 %	383488372
3099	NC_017050	AAG	2	6	114773	114778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488372
3100	NC_017050	ATC	2	6	114804	114809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488372
3101	NC_017050	ACA	2	6	114941	114946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383488372
3102	NC_017050	TTG	2	6	114988	114993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383488372
3103	NC_017050	CTA	2	6	115018	115023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488372
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3105	NC_017050	ATC	2	6	115045	115050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488372
3106	NC_017050	AGA	2	6	115091	115096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488372
3107	NC_017050	TAT	2	6	115099	115104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488372
3108	NC_017050	GCA	2	6	115110	115115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383488372
3109	NC_017050	TA	3	6	115206	115211	50 %	50 %	0 %	0 %	383488372
3110	NC_017050	CTA	2	6	115222	115227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488372
3111	NC_017050	TTTTA	2	10	115344	115353	20 %	80 %	0 %	0 %	383488372
3112	NC_017050	T	6	6	115470	115475	0 %	100 %	0 %	0 %	383488372
3113	NC_017050	ATA	2	6	115660	115665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488372
3114	NC_017050	A	8	8	115705	115712	100 %	0 %	0 %	0 %	383488372
3115	NC_017050	GAT	2	6	115833	115838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488372
3116	NC_017050	TA	3	6	115921	115926	50 %	50 %	0 %	0 %	383488372
3117	NC_017050	AT	3	6	115942	115947	50 %	50 %	0 %	0 %	383488372
3118	NC_017050	A	6	6	115960	115965	100 %	0 %	0 %	0 %	383488372
3119	NC_017050	TGA	2	6	115979	115984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488372
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3121	NC_017050	TGC	2	6	116096	116101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383488372
3122	NC_017050	AGT	2	6	116106	116111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488372
3123	NC_017050	CAA	2	6	116130	116135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383488372
3124	NC_017050	CA	3	6	116141	116146	50 %	0 %	0 %	50 %	383488372
3125	NC_017050	T	7	7	116149	116155	0 %	100 %	0 %	0 %	383488372
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3498	NC_017050	ATT	2	6	130022	130027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488377
3499	NC_017050	GAAT	2	8	130046	130053	50 %	25 %	25 %	0 %	383488377
3500	NC_017050	TAAAAG	2	12	130054	130065	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383488377

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