MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 30190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017050	TACT	2	8	37112	37119	25 %	50 %	0 %	25 %	383488310
1002	NC_017050	T	6	6	37122	37127	0 %	100 %	0 %	0 %	383488310
1003	NC_017050	T	6	6	37155	37160	0 %	100 %	0 %	0 %	383488310
1004	NC_017050	TTC	2	6	37164	37169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383488310
1005	NC_017050	AGC	2	6	37227	37232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383488310
1006	NC_017050	A	6	6	37246	37251	100 %	0 %	0 %	0 %	383488310
1007	NC_017050	T	6	6	37276	37281	0 %	100 %	0 %	0 %	383488310
1008	NC_017050	ATT	2	6	37345	37350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488310
1009	NC_017050	TTA	2	6	37375	37380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017050	A	6	6	37405	37410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017050	ATA	2	6	37413	37418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017050	AAC	2	6	37435	37440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_017050	AT	3	6	37463	37468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017050	T	6	6	37468	37473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017050	ATG	2	6	37474	37479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017050	TTTAAT	2	12	37510	37521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017050	TAT	2	6	37540	37545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017050	AGT	2	6	37546	37551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017050	T	6	6	37581	37586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017050	T	6	6	37588	37593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017050	GTT	2	6	37604	37609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017050	TAT	2	6	37825	37830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017050	T	6	6	37868	37873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017050	AAT	2	6	37909	37914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017050	TAA	2	6	37938	37943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017050	CAT	2	6	37965	37970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017050	TCAA	2	8	37973	37980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_017050	T	6	6	38004	38009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017050	ATGT	2	8	38033	38040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017050	TA	4	8	38048	38055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017050	T	6	6	38145	38150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017050	TCA	2	6	38184	38189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017050	T	7	7	38219	38225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017050	TTAA	2	8	38299	38306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017050	TTA	2	6	38348	38353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017050	TTAT	2	8	38365	38372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017050	ATC	2	6	38419	38424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488311
1038	NC_017050	ATC	2	6	38446	38451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488311
1039	NC_017050	TAT	2	6	38473	38478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488311
1040	NC_017050	GAA	2	6	38493	38498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488311
1041	NC_017050	TAA	2	6	38522	38527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488311
1042	NC_017050	AGG	2	6	38531	38536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383488311
1043	NC_017050	TTA	2	6	38547	38552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488311
1044	NC_017050	TAAA	2	8	38575	38582	75 %	25 %	0 %	0 %	383488311
1045	NC_017050	TAT	2	6	38619	38624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488311
1046	NC_017050	CTG	2	6	38626	38631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383488311
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1050	NC_017050	A	6	6	38775	38780	100 %	0 %	0 %	0 %	383488311
1051	NC_017050	A	6	6	38814	38819	100 %	0 %	0 %	0 %	383488311
1052	NC_017050	ATG	2	6	38848	38853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488311
1053	NC_017050	TGA	2	6	38924	38929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488311
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1055	NC_017050	ACG	2	6	38960	38965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383488311
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1057	NC_017050	TAT	2	6	39083	39088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488311
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1059	NC_017050	ATT	2	6	39192	39197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488311
1060	NC_017050	TTA	2	6	39267	39272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488311
1061	NC_017050	GTG	2	6	39289	39294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383488311
1062	NC_017050	CTA	2	6	39313	39318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488311
1063	NC_017050	AT	3	6	39338	39343	50 %	50 %	0 %	0 %	383488311
1064	NC_017050	TGC	2	6	39353	39358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383488311
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1070	NC_017050	TGA	2	6	39557	39562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488311
1071	NC_017050	AATTG	2	10	39581	39590	40 %	40 %	20 %	0 %	383488311
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1079	NC_017050	ATA	2	6	39934	39939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488311
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1084	NC_017050	ATTCTT	2	12	40169	40180	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383488311
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1096	NC_017050	TGA	2	6	40754	40759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488311
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1098	NC_017050	AG	3	6	40834	40839	50 %	0 %	50 %	0 %	383488311
1099	NC_017050	AAT	2	6	40848	40853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488311
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1102	NC_017050	ATT	2	6	40975	40980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1104	NC_017050	T	6	6	41008	41013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1106	NC_017050	AATA	2	8	41053	41060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017050	AAAT	2	8	41119	41126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017050	TAT	2	6	41160	41165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017050	TTG	2	6	41176	41181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017050	AAT	2	6	41196	41201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017050	TAG	2	6	41380	41385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017050	CTG	2	6	41386	41391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017050	GTATT	2	10	41418	41427	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017050	TAC	2	6	41450	41455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017050	ATT	2	6	41469	41474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017050	TA	3	6	41499	41504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017050	TA	3	6	41533	41538	50 %	50 %	0 %	0 %	383488312
1118	NC_017050	TAT	2	6	41591	41596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488312
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1123	NC_017050	GAT	2	6	41879	41884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488312
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1125	NC_017050	TA	3	6	41918	41923	50 %	50 %	0 %	0 %	383488312
1126	NC_017050	TAC	2	6	41945	41950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488312
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1129	NC_017050	CTT	2	6	42014	42019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383488312
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